Den genetiske kartleggingen er konstruksjonen av et kort er lokalisert rundt et gen eller en bred base på genomets heltall. Mer generelt er det bestemmelsen av posisjonen til et lokus ( gen eller genetisk markør ) på et kromosom som en funksjon av frekvensen av genetisk rekombinasjon . Dens avstandsenhet er centimorgan ( cM ).
Handlingen med kartlegging innebærer å bestemme de relative posisjonene til loci (gener eller DNA-sekvenser) på et kromosom . Koblingskart er hentet fra frekvensen av rekombinasjon mellom lokus . Fysiske kart oppnås vanligvis ved bruk av in situ hybridisering av DNA- fragmenter klonet med metafasekromosomer , eller bruk av somatiske eller bestrålingshybrider.
Det første genetiske kartet ble laget i 1913 av Thomas Hunt Morgan og Alfred Sturtevant på X-kromosomet i Drosophila . Den første kartlagte planten var mais i 1935 ved hjelp av fenotypisk markørteknikk. Teknikken for molekylær merking er mye nyere.
Et kart som er et diagram som representerer den relative plasseringen av lokus på et kromosom og avstandene mellom dem, skiller vi mellom følgende typer kart:
De cytologiske kartene over gener assosiert med mutasjoner kan lages når visse kromosomale mutasjoner har en støtte som kan oppdages ved fargeteknikker, striper av kromosomer.
Den sammenlignende kartleggingen er sammenligningen av plasseringen av gener og markører på kromosomkart mellom arter . I sammenligninger mellom nært beslektede arter finner vi en høy grad av bevaring:
I dette tilfellet kan plasseringen av flere gener forutsies ved hjelp av en datamodell. Sammenligninger mellom fylogenetisk fjerne arter avslører en økning i syntetisk tap.
Den kartlegging S1 er en metode for å karakterisere posttranscriptionelles endringer i RNA ( spleising av introner , etc.) ved hybridisering av RNA med en DNA enkeltrådet og behandling med nuklease S1.