DNMT3B

DNMT3B
Illustrasjonsbilde av varen DNMT3B
Hovedtrekkene
Symbol DNMT3B
Synonymer DNMT3B, ICF, ICF1, M.HsaIIIB, DNA (cytosin-5 -) - metyltransferase 3 beta, DNA metyltransferase 3 beta
Locus 20 q11.21

DNA (cytosin-5 -) - metyltransferase 3 beta er et enzym som, hos mennesker, er kodet av DNMT3B- genet . Mutasjoner i dette genet er assosiert med immunsvikt og sentromer ustabilitet og ansikts abnormiteter syndrom .

Funksjon

Den metylering CpG er en endring epigenetisk viktig for embryoutvikling , den foreldre empreintage er og X-kromosominaktiveringsstudier i mus vist at DNA-metylering er nødvendig for pattedyr-utvikling. Dette genet koder for en DNA-metyltransferase som antas å fungere i de novo- metylering , i stedet for å opprettholde metylering. Proteinet er hovedsakelig lokalisert i kjernen og uttrykket reguleres under utvikling. Åtte alternative spleisningsvarianter av transkripsjoner er beskrevet. De komplette sekvensene av variant 4 og 5 er ennå ikke bestemt.

DNMT3B kreves for metylering av de novo- genomet og er viktig for å etablere DNA-metyleringsmønstre under utvikling. DNA-metylering koordineres med histonmetylering. DNMT3B kan fortrinnsvis metylere det nukleosomale DNA i den sentrale regionen av nukleosomet. Det kan også fungere som en transkripsjons co-repressor ved å assosiere med CBX4 og uavhengig av DNA-metylering. Det ser ut til å være involvert i prosessen med gendemping. I forbindelse med DNMT1 og via rekruttering av CTCFL / BORIS, er DNMT3 involvert i aktiveringen av ekspresjonen av BAG1-genet ved å modulere H3-dimetylering ved K4- og K9-restene av histonene ved sin promoter. DNMT3B fungerer også som en transkripsjonell co-repressor ved å assosiere med ZHX1. Til slutt er det nødvendig for deaktivering av DUX4 i somatiske celler.

Isoformer

DNMT3B har 8 isoformer. Isoformer 4 og 5 er sannsynligvis ikke funksjonelle på grunn av fjerning av to konserverte metyltransferasemotiver.

Klinisk signifikans

Den immunodeficiency syndrome-centromeric ustabilitet-facial anomalier (ICF) resultat defekter i modningen av cellene som følge av avvikende DNA-metylering forårsaket av mutasjoner i genet DNMT3B.

Varianter av genet kan også bidra til nikotinavhengighet.

Interaksjoner

DNMT3B har vist seg å samhandle med:

Referanser

  1. "  Enter Gene: DNMT3B DNA (cytosine-5 -) - methyltransferase 3 beta  "
  2. “  ICF syndrom, en DNA metyltransferase 3B mangel og immunsvikt sykdom  ”, Clinical Immunology , vol.  109, n o  1,Oktober 2003, s.  17–28 ( PMID  14585272 , DOI  10.1016 / S1521-6616 (03) 00201-8 )
  3. “  DNMT3B  ” , på www.genecards.org (åpnet 14. mars 2019 )
  4. Lunching Sun , Lei Huang , Phuongmai Nguyen og Kheem S. Bisht , “  DNA metyltransferase 1 og 3B aktiverer BAG-1 uttrykk via rekruttering av CTCFL / BORIS og modulering av promotor histon metylering  ”, Cancer Research , vol.  68, n o  8,15. april 2008, s.  2726–2735 ( ISSN  1538-7445 , PMID  18413740 , PMCID  PMCPMC2733164 , DOI  10.1158 / 0008-5472.CAN-07-6654 , lest online , åpnet 14. mars 2019 )
  5. Marlinde L. van den Boogaard , Richard JLF Lemmers , Judit Balog og Mariëlle Wohlgemuth , “  Mutations in DNMT3B Modify Epigenetic Repression of the D4Z4 Repeat and the Penetrance of Facioscapulohumeral Dystrophy  ”, American Journal of Human Genetics , vol.  98, n o  5, 05 05, 2016, s.  1020–1029 ( ISSN  1537-6605 , PMID  27153398 , PMCID  PMCPMC4863565 , DOI  10.1016 / j.ajhg.2016.03.013 , lest online , åpnet 14. mars 2019 )
  6. "  DNMT3B - DNA (cytosine-5) -metyltransferase 3B - Homo sapiens (Human) - DNMT3B gen og protein  " , på www.uniprot.org (åpnet 14. mars 2019 )
  7. "  Genomenomfattende foreningsstudie på tvers av europeiske og afroamerikanske forfedre identifiserte en SNP i DNMT3B som bidro til nikotinavhengighet  ", Molecular Psychiatry ,oktober 2017( PMID  28972577 , DOI  10.1038 / mp.2017.193 )
  8. Lehnertz B, Ueda Y, Derijck AA, Braunschweig U, Perez-Burgos L, Kubicek S, Chen T, Li E, Jenuwein T, Peters AH, “  Suv39h-mediert histon H3 lysin 9 metylering direkte DNA metylering til store satellittgjentakelser ved perikentrisk heterokromatin  ”, Current Biology , vol.  13, nr .  14,Juli 2003, s.  1192–200 ( PMID  12867029 , DOI  10.1016 / s0960-9822 (03) 00432-9 )
  9. Kim GD, Ni J, Kelesoglu N, Roberts RJ, Pradhan S, “  Co-operation and communication between the human maintenance and de novo DNA (cytosine-5) methyltransferases  ”, The EMBO Journal , vol.  21, n o  15,august 2002, s.  4183–95 ( PMID  12145218 , PMCID  126147 , DOI  10.1093 / emboj / cdf401 )
  10. Ling Y, Sankpal UT, Robertson AK, McNally JG, Karpova T, Robertson KD, "  Modifisering av de novo DNA methyltransferase 3a (Dnmt3a) av SUMO-1 modulerer interaksjonen med histondeacetylaser (HDACs) og dens evne til å undertrykke transkripsjon  " , Nucleic Acids Research , vol.  32, n o  tojanuar 2004, s.  598–610 ( PMID  14752048 , PMCID  373322 , DOI  10.1093 / nar / gkh195 )
  11. Geiman TM, Sankpal UT, Robertson AK, Chen Y, Mazumdar M, Heale JT, Schmiesing JA, Kim W, Yokomori K, Zhao Y, Robertson KD, “  Isolation and characterization of a roman DNA methyltransferase complex linking DNMT3B med komponenter i det mitotiske kromosomkondensasjonsmaskineriet  ”, Nucleic Acids Research , vol.  32, n o  9,Mai 2004, s.  2716–29 ( PMID  15148359 , PMCID  419596 , DOI  10.1093 / nar / gkh589 )
  12. Kang ES, Park CW, Chung JH, “  Dnmt3b, de novo DNA methyltransferase, interagerer med SUMO-1 og Ubc9 gjennom sin N-terminale region og kan endres av SUMO-1  ”, biokjemisk og biofysisk forskningskommunikasjon , vol.  289, n o  4,desember 2001, s.  862–8 ( PMID  11735126 , DOI  10.1006 / bbrc.2001.6057 )

Tilleggsbibliografi

Eksterne linker