Ensembl er et bioinformatikk system for automatisk genom annotering . Det er et felles prosjekt fra European Bioinformatics Institute (EBI) og Wellcome Trust Sanger Institute, hvis sentrale ide er å organisere store felt med biologisk informasjon rundt genomiske sekvenser .
For hvert analysert genom prøver Ensembl å identifisere alle genene det inneholder ved en automatisk prosess . For å gjøre dette er det avhengig av data fra eksisterende sekvenser ( RNA , proteiner ), som det "henger opp" på genomet for å utlede strukturen til genene.
På dette første merkelaget, av strukturen til gener, vil Ensembl legge til andre elementer, blant annet:
Ensembl presenterer seg først som en "browser genomes" ( " Genome Browser " ) for å utforske og visualisere forskjellige nivåer genomene til mange organismer.
Ensembl er også en åpen database som man fritt kan hente, enten direkte, eller via et programmeringsgrensesnitt , eller gjennom BioMart-avhørssystemet.
Endelig er Ensembl en åpen programvareinfrastruktur som gjør det mulig å bygge forskjellige systemer som organiserer data relatert til genomiske sekvenser.
Ensembl-prosjektet er drevet av en kultur med omfattende åpenhet, som oversettes til: