InterPro er en integrert database med "signaturer" for domener og proteiner som brukes til automatisk klassifisering og merking av proteiner .
Interpro tillater klassifisering av proteiner i henhold til tilstedeværelsen av funksjonelle domener, gjentakelser og signaler takket være et automatisk søk i flere databaser (CATH-Gene3D, HAMAP, PANTHER, Pfam, PIRSF, PRINTS, ProDom, PROSITE, SMART, SUPERFAMILY, TIGRFAMs ).