Den bakterielle nomenklatur er den disiplin som setter reglene for et internasjonalt språk for å utpeke ved samme navn, de bakteriene identisk i alle regioner i verden.
Som i andre disipliner av livs fag (handler, zoologi, etc.), den nomenklatur av bakterier er binomial . Den er regulert av International Code of Bacterial Nomenclature ( engelsk versjon tilgjengelig online ), og hvis offisielle tidsskrift er International Journal for Systematic Bacteriology .
Bruken av riktig binomialnavn gjør det mulig å betegne en taxon uten å måtte beskrive alle karakterene, og for alle spesialister i samme fag å forstå hverandre uten tvetydighet. For eksempel indikerer den enkle handlingen med å rapportere en stammebakterie til familien av Enterobacteriaceae enhver bakteriolog at denne stammen gir bakterier gramnegative , for det meste ikke- sporedannende , aero-anaerobe , etc. I medisinsk bakteriologi er det viktig at alle berørte spesialister ( epidemiologer , forskere, klinikere, vaksineprodusenter osv.) Bruker en felles nomenklatur for å kunne samarbeide effektivt.
I tillegg bruker hver språk mange dialekt (uoffisielle) synonymer for å betegne en bakteriearter . Mens noen navn beholder historisk verdi (" Koch's bacillus " for Mycobacterium tuberculosis , for eksempel), er andre en kilde til forvirring. Dermed fremkaller "septisk vibrio" slekten Vibrio , mens den tilhører Clostridium . Til slutt, siden slike navn bare er forstått av visse fransktalere, er det nødvendig å ty til internasjonale vitenskapelige navn.
Prioritetsreglene er de samme som for de andre disipliner: når to bakteriearter er gruppert i samme slekt, eller to slekter i samme familie, i henhold til nye kriterier, er publiseringsprioritetsregelen for navnene på taxa gjeldende for å betegne dette slekten eller denne familien.
Siden 1 st januar 1980, prioriteres det av godkjente lister over bakterielle navn , regelmessig oppdatert i International Journal of Systematic and Evolutionnary Microbiology (IJSEM) . Den er tilgjengelig online på Jean Euzébys nettsted om bakteriell nomenklatur , som oppdateres regelmessig.
Som i botanikk eller mykologi:
Se også siden Taksonomi (bakteriologi)
For ulemper er underinndelingen av arter eller underarter biovars (eller biotyper) serovars ( serotyper ) lysovars ( fag ) og patotyper (eller patotyper), vanligvis skrevet med store bokstaver, ikke vitenskapelige navn, men praktiske referanser eller patologiske , geografiske kriterier osv. .
Således vil " Pasteurella multocida subsp multocida serotype D toxigenic" bety at den identifiserte stammen (assosiert med atrofisk rhinitt hos smågriser) tilhører:
For at opphavsbeskrivelsen skal være gyldig, må bakteriearten være:
Euzéby, JP - Rettelser til godkjente lister over bakterienavn og til den endrede utgaven av de godkjente lister over bakterielle navn . Int. J. Syst. Bacteriol., 1997, 47, 1271-1272.
Euzéby, JP & Tinall, BJ - Nødvendige korreksjoner til godkjente lister over bakterielle navn i henhold til regel 40d (tidligere regel 46). Forespørsel om en mening. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 2321-2322.
Skerman, PHA - Forord. I: VBD Skerman, V. McGowan og PHA Sneath, Approved Lists of Bacterial Names. Endret utgave. American Society for Microbiology, Washington, 1989.
Sneath, PHA & Brenner, DJ - “Offisielle” nomenklaturlister . ASM News, 1992, 58, 175.
Mayo, MA & Horzinek, M. - Internasjonal kode for virusklassifisering og nomenklatur (1998, revidert versjon)