Terminator (genetikk)
I genetikk, en transkripsjonsterminator eller terminator er en genomsekvens som markerer slutten av transkripsjon av et gen eller et operon til messenger-RNA av RNA-polymerase . Mekanismen for transkripsjonsavslutning er forskjellig i prokaryoter og eukaryoter .
I bakterier er det to mekanismer for avslutning av transkripsjon, en som involverer et spesifikt protein kalt Rho termineringsfaktor, og det andre som ikke krever intervensjon av en ekstern faktor, noe som fører til å skille mellom to typer terminatorer:
- Rho-uavhengige terminatorer består av en omvendt repeteringssekvens etterfulgt av en serie T-er ( uracils på transkribert RNA). Ved transkripsjon til RNA vedtar den inverterte repeteringssekvensen en struktur i stammen og sløyfen som forårsaker et brudd på RNA-polymerase . Det transkriberte RNA blir da bare paret med mal-DNA-strengen ved følgende uridinsekvens. Disse AU-interaksjonene er svake, og det syntetiserte RNA kan løsne seg fra malen. Transkripsjonen stopper. Rho-uavhengige terminatorer er generelt sterke terminatorer.
- Rho-avhengige terminatorer, sammensatt av en konsensus-sekvens gjenkjent av Rho-proteinet, som forårsaker løsrivelse av RNA-polymerase fra mal-DNA.
I eukaryoter er avslutning av transkripsjon generelt koblet med 3'- polyadenylering av messenger-RNA. Dette utføres på nivået med en AAUAAA-sekvens på det syntetiserte RNA, kalt polyadenyleringssignalet . Det involverer et spesifikt kompleks, kalt CPSF ( Cleavage and polyadenylation specificity factor ) som gjenkjenner dette signalet og utløser avslutning av RNA-polymerase.
Disambiguation
Begrepet terminator blir noen ganger også brukt tvetydig for å betegne stoppkodonet for kodingsfasen, derfor til stede på messenger-RNA . Når man overfører messenger-RNA til protein av ribosomet , er stoppkodonen signalet om å stoppe translasjon.
Merknader og referanser
-
I. Gusarov og E. Nudler , “ Mekanismen for iboende transkripsjonsavslutning ”, Molecular Cell , vol. 3,1 st april 1999, s. 495–504 ( ISSN 1097-2765 , PMID 10230402 , lest online , åpnet 5. november 2016 )
-
(i) Patricia Richard og James L. Manley , " transkripsjonsavslutning av RNA-polymeraser kjernefysiske " , Genes & Development , Vol. 23,1 st juni 2009, s. 1247–1269 ( ISSN 0890-9369 og 1549-5477 , PMID 19487567 , PMCID 2763537 , DOI 10.1101 / gad.1792809 , lest online , åpnet 5. november 2016 )
Se også