SARS-CoV-2 diagnostisk test

En diagnostisk test for SARS-CoV-2 kan utføres hvis det mistenkes koronavirus sykdom 2019 (Covid-19) ved klinisk undersøkelse og i tillegg til grundige undersøkelser ( computertomografi , etc.). Det kan utføres ved polymerase-kjedereaksjon tester etter revers transkriptase for deteksjon av viralt RNA (RT-PCR, for "  Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction  ") eller ved antistoff-baserte ELISA- tester for påvisning av proteiner i virionet .

European Virus Archive (EVA) forskningsinfrastruktur organiserte seg raskt for å gi diagnostiske laboratorier over hele verden viralt materiale som skal fungere som kontroller for RNA- eller proteinbasert testing.

Typer tester

RT-PCR (eller ved molekylærbiologi, gendeteksjon)

En av de første Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction tester , forkortet RT-PCR, ble utviklet på La Charité i Berlin ijanuar 2020ved hjelp av kvantitativ PCR og dannet grunnlaget for 250 000 sett som WHO distribuerer. de2. mars, WHO formidler en standardprotokoll etablert av Institut Pasteur i Paris. I følge en koreansk studie ville denne siste testen ha en lavere følsomhet for påvisning av N-genet.

Den følsomhet av denne type test er rangert mellom 50 og 60% og spesifisiteten er ganske dårlig på 75%, sammenlignet med 99% og 98% for multipleks PCR-tester, som enda ikke er i bruk i begynnelsen av mai 2020 .

Det sørkoreanske selskapet Kogenebiotech kunngjorde 11. februar 2020at dens PowerChek 2019-nCoV Sanntids-PCR Kit deteksjon kit, som er rettet mot den “E” gen deles av alle Betacoronaviruses og den SARS-CoV-2-spesifikk RdRp -genet , hadde mottatt en nødsituasjon autorisasjon  (i) fra den koreanske og amerikanske myndigheter .

Andre selskaper som Seegene og Solgent utviklet også i februar 2020 sine versjoner av deteksjonssett for klinisk kvalitet kalt henholdsvis “DiaPlexQ” og “Allplex 2019-nCoV Assay”.

I USA distribuerer sentrene for sykdomskontroll CDC 2019-Novel Coronavirus (2019-nCoV) sanntid RT-PCR diagnostisk test til folkehelselaboratorier. I tidlige versjoner ga en av tre genetiske tester ufattelige resultater ved Atlanta CDC; nyere tester med to komponenter har vist seg å være pålitelige28. februar 2020, slik at nasjonale og lokale laboratorier raskt kan fullføre testene: denne testen er godkjent av Food and Drug Administration (FDA) under en autorisasjon for bruk i nødstilfeller.

Den Hong Kong University of Science and Technology tilbudt en svært rask microfluidic RT-PCR test i begynnelsen av februar .

På 4. mars 2020, WHO har listet opp følgende offisielle referanselaboratorier og utviklingsprotokoller:

Land Institutt Genetiske mål
Tyskland Veldedighet RdRp , E, N
Kina Kinesisk CDC ORF 1ab og nukleoprotein (N)
forente stater Amerikansk CDC Tre mål i N-genet
Frankrike Institut Pasteur , Paris To mål i RdRp- genet , E
Hong Kong HKU ORF1b-nsp14, N
Japan Nasjonalt institutt for smittsomme sykdommer Spike Protein ( Peplomer )
Thailand National Institute of Health IKKE

7. april 2020 publiserte WHO listen over de første 2 RT-PCR-testene som kan brukes i en nødsituasjon: disse er genene Real-Time PCR Coronavirus (COVID-19) -tester fra Primerdesign, divisjon av Novacyt , Grande -Bretagne, og cobas SARS-CoV-2 for bruk på cobas 6800/8800 Systems , fra Roche , USA. Denne listen blir deretter fullført for å nå 21 tester i slutten av september 2020.

Produksjon av RT-PCR testsett

Allerede i januar startet alle potensielle produsenter en kamp for å produsere RT-PCR-testsett: kamptid for å dempe epidemien og kommersiell kamp for ikke å holde seg borte fra en etterspørsel.

På 17. april 2020, viser FINDDX-nettstedet mer enn 500 tester beregnet for diagnostisering av SARS-CoV-2, hvorav 428 markedsføres og 85 er under utvikling. I testene som markedsføres, er 223 virologiske tester, hovedsakelig i henhold til RT-PCR-metoden.

For Frankrike publiserer Helsedepartementet listen over diagnostiske reagenser av RT-PCR for SARS-CoV-2. I dato for3. april, inneholder denne listen 7 tester validert av CNR (National Reference Center) og 32 CE-merkede tester.

Den effektive tilgjengeligheten av reagenser er et kritisk punkt i screeningpolitikken som er implementert i hvert land. I mars og april er det lite informasjon om antall tilgjengelige testsett, verken fra produsentens side - produksjonskapasitet? produsert mengde? - eller på landsiden - bestilt antall? levert kvantitet? mengde brukt? -.

I tillegg til reagenssettene som kreves, må du også ha oppsamlingssett. Selv om de er mye enklere å produsere, har media rapportert om mangel på innsamlingssett i noen land.

Pålitelighet av RT-PCR-tester

Påliteligheten til RT-PCR-tester har ofte blitt stilt spørsmålstegn ved. Denne tilsynelatende dårlige påliteligheten dekker flere fag, noen knyttet til RT-PCR-analysen, andre knyttet til sykdomsforløpet hos en pasient, og til slutt andre knyttet til implementeringsprosedyrene.

Når det gjelder RT-PCR-metoden, er det en metode som for noen ikke egentlig hadde en utmerket pålitelighet. Det er for eksempel for Sars-Cov2 mange og konstante mutasjoner av viruset, noe som kan gjøre det mindre påvisbart. For noen vil følsomheten være dårlig (den laveste i gjennomsnitt blant alle typer tester), spesifisiteten (evnen til å oppdage ønsket virus og ingenting annet) god nok. For andre ville testene returnere for mange falske positive på grunn av en verdi brukt av Ct (syklusterskel) for høy, og ville ikke gi noen indikasjon på smittsomhet i motsetning til de kvantitative RT-PCR-testene. I tillegg var det også mangler i prosedyrer og reagenser for diagnosen SARS-CoV-2. Ifebruar 2020, besluttet den amerikanske CDC ikke å bruke internasjonalt utviklede tester og å utvikle sin egen test som ble funnet å være mangelfull; i mars og april ble det funnet millioner av sett levert av Kina å være mangelfulle i Spania, Tsjekkia, Slovakia, Tyrkia og Storbritannia.

I Frankrike utføres validering av hvert reagenssett av National Reference Center (CNR) ved bruk av en unik virusstamme og ved hjelp av den analytiske prosedyren og utstyret som er spesifisert av produsenten.

Kilder til tilsynelatende eller reelle falske positive:

  • Feil reagenser eller prosedyrer eller dårlig selektivitet: Testen oppdager noe annet enn SARS-CoV-2.
  • Kryssforurensning under innsamling eller under analyse.
  • Pasientidentifikasjonsfeil, spesielt når prosedyren ikke sikrer automatisk strekkodesporbarhet fra prøven til levering av resultatet.

Kilde til tilsynelatende eller reelle falske negativer:

  • Feil reagenser eller prosedyrer; testen oppdager ikke tilstrekkelig SARS-CoV-2.
  • Mutasjon av viruset; noen reagenser kan være feil; det er teoretisk mulig, men ennå ikke rapportert for SARS-CoV-2
  • Dårlig prøvetaking; viruset er til stede, men prøven samlet for lite virus; spesielt har vi sett tilfeller der prøven er tatt av pasienten, noe som risikerer å være utilstrekkelig fordi prøven er veldig ubehagelig.
  • Utbrudd av infeksjon; viral belastning er fortsatt lav.
  • Utvikling av infeksjonen (det hyppigste tilfellet); etter noen dager med symptomer falt virusbelastningen i øvre luftveier kraftig, selv om viruset fremdeles var i kroppen. Prøver skal tas fra nedre luftveier eller fra avføringen. Dette er hovedårsaken til "falske negativer". Teknisk sett er det ikke falskt negativt, fordi det ikke er mer virus til stede, men medisinsk, da testen er negativ og sykdommen til stede, kan den kalles falsk negativ. Denne subtile presisjonen gjør det mulig å forstå viktige avvik i den rapporterte% følsomheten.
  • Pasientidentifikasjonsfeil.
  • Datasystemfeil; for eksempel rapporterte Irland situasjonen der tester som returnerte med statusen "ugyldig / ubestemt" ble klassifisert som "negativ" fordi programvaren som ble brukt kun visste "positiv eller negativ" .

For forskning: RT-PCR-analyse er en referansemetode for forskning på coronavirus, for eksempel for studier av utholdenhet. I denne sammenheng presenterer den en alvorlig mangel; RT-PCR-analyse kan oppdage til og med svært svake spor av coronavirus-RNA, men det beviser ikke at vi er i nærvær av virioner som er i stand til å infisere en celle. Det er en kilde til kontrovers i noen publiserte studier.

Praktisk organisering av RT-PCR-tester

PCR-tester er velkjente og brukes ofte til å søke etter virus fra mennesker, dyr eller planter. Metoden er imidlertid ganske sofistikert og er ikke tilgjengelig i bylaboratorier eller enkle sykehus. Den nåværende organisasjonen for å gjennomføre PCR-tester er basert på tekniske plattformer med analytiske fasiliteter og maskiner; disse tekniske plattformene eksisterer i offentlige laboratorier tilknyttet CHU eller i private laboratorier som samler noen titalls eller noen få hundre bylaboratorier. I Frankrike er det rundt 120 utstyrte tekniske plattformer som vender mot de 3700 medisinske biologilaboratoriene (kilde INSEE).

Det er fire faser for å utføre en RT-PCR diagnostisk test for SARS-CoV-2:

  1. Prøvetaking - Identifikasjon av pasienten, nasopharyngeal vattpinne med en vattpinne , kondisjonering av prøven i trippel emballasje. Denne prøven kan tas av bylaboratorier, sykehustjenester eller til og med byleger, forutsatt at innsamlingssett er tilgjengelig. Noen prosedyrer for å ta to prøver for hver prøve. Varighet: 5 til 15 minutter. Fra midten av februar 2021 er spyttprøver godkjent, men i 2021 er disse begrenset til veldig spesifikke sammenhenger: skole- eller medisinske miljøer og ikke distribuert mye i lys av laboratoriens motvilje.
  2. Innsamling og transport - Hver teknisk plattform har en innsamlings- og transportorganisasjon for tilknyttede laboratorier; bedrifter som spesialiserer seg på denne aktiviteten, går gjennom prøvetakingspunktene og gir transport med tilstrekkelige helseforholdsregler inkludert SARS-CoV-2, bør prøvene oppbevares ved ° C . Varighet for henting og transport: vanligvis en halv dag til en dag, muligens raskere hvis prøven er i nærheten av analyseplattformen.
  3. Analyse - PCR-analyse utføres ved hjelp av en termisk syklus . Det er mange typer enheter som tilsvarer forskjellige bruksområder; disse enhetene er mer eller mindre automatiserte; for masseanalyse fungerer termiske syklister i grupper på 64 prøver og kan analysere opptil 1000 til 3000 prøver per 24 timer (teoretisk verdi forutsatt at hele kjeden holder tritt). Varighet: uansett RT-PCR-analyseenhet, tar det 3 til 4 timer å utføre analysen (forberedelse, sykling og lesing av resultatet).
  4. Resultater - Leveringen av resultatet til søkeren skjer elektronisk, derfor ganske raskt.

I praksis tar en RT-PCR-test 1/2 dag til 2 dager. I media forveksles ofte varigheten av den komplette testen med varigheten av prøven som er den synlige delen. Noen stater (Irland, California) rapporterer om situasjoner der det tar en til to uker å oppnå resultatet fordi mengden prøver som tas er langt større enn den analytiske kapasiteten.

Denne organisasjonen er på plass i Frankrike og fungerer riktig når det gjelder behandling av noen titalls eller noen få hundre prøver per dag. For å øke antallet prøver behandlet per dag massivt, kommer vanskelighetene fra antall prøvetakings- og reagenssett og antall tilgjengelige analysemaskiner, men også fra mangel på kvalifisert personell når analysen er halvautomatisk, det faktum at reagenssett er validert for en type maskin - som kompliserer forsyningen - og det faktum at laboratoriene er utstyrt med mange forskjellige programvare og at dataoverføringsformatene ikke er enhetlige - dette som kompliserer omorganiseringen av laboratorienettverk. Siden 25. juli 2020 er PCR-tester 100% dekket av trygd, uten resept.

Multiparametrisk test - nukleinsyre

Testmetagenomisk analyse Explify Respiratory of IDbyDNA identifiserer på mindre enn en time mer enn 900 respiratoriske patogener, inkludert SARS-CoV-2. Gjennomgangstiden fra mottak av prøven til testresultatet er 36 timer. Det er dyrere enn RT-PCR-tester.

Såkalte "antigeniske" tester : søk etter antigener

Disse testene gir et resultat på 15 minutter til 30 minutter, og er basert på søket etter antigener av viruset. De hadde i gjennomsnitt i juni 2020 en ganske beskjeden følsomhet (60,2%) og en veldig god spesifisitet (99,2%). De siste testene som ble utviklet høsten 2020 gir imidlertid sensitiviteter og spesifisiteter som er større enn 95%. På begynnelsen av sommeren var imidlertid produksjonskapasiteten lav sammenlignet med behovet for å avdefinere befolkningen under de beste forholdene. I motsetning til det som rapporteres av mange medier, følsomheten til testen som hovedsakelig er tilgjengelig i Frankrike (Abbott), kan 93% virke bedre enn for PCR-tester. APHP-evalueringene 7. oktober 2020 viser imidlertid svært markant lavere resultater, inkludert for Abbott-testen som knapt når 55% av følsomheten (mer enn 4 positive pasienter av 10 som ikke ble oppdaget av de antigene testene), sammenlignet med RT PCR.

Serologiske tester: søk etter antistoffer

En serologisk test oppdager tilstedeværelsen av antistoffer klasse IgG eller IgM utviklet etter infeksjon med coronavirus i 2019 (fra 5 dager opp til flere måneder) i blodet . Som med RT-PCR-tester, avhenger verdien av testen av det oppdagede antigenet. Raske tester (enkeltprøve på 15 til 30 minutter) og i mikroplate ELISA-format (for laboratorier, i 50 til 100 prøver på 2 timer) ble gjort tilgjengelig tidlig i epidemien, men ble lite brukt, fordi de har en veldig god spesifisitet (100%), er maksimal følsomhet 70% (etter 10 dagers inkubasjon), og de oppdager ikke antistoffer i løpet av de første 5 til 7 dagene av inkubasjonen. Følsomheten kan også være litt lavere i den eldre befolkningen på grunn av fenomenet immunosenessens . De ser ikke ut til å kunne brukes alene til screening, deres viktigste interesse er for epidemiologisk overvåking:

Nyttighet: Serologiske tester gjør det mulig for epidemiologer og offentlige beslutningstakere å kjenne hvor stor andel av befolkningen generelt som har blitt smittet siden pandemien startet, å vurdere antall asymptomatiske tilfeller og å spesifisere forurensningskoeffisienten til sykdommen. ' epidemi. Startapril 2020, ingen vet ennå dette virkelige antallet asymptomater, og heller ikke den nøyaktige rollen til infiserte, men asymptomatiske barn (skal avklares før skolene åpnes igjen). Til slutt bekrefter disse testene den epidemiologiske forståelsen av Covid-19 gitt av utenlandske studier på klinisk grunnlag, og er fremfor alt et sentralt element i å bestemme responsen på pandemien til en gitt befolkning.

I kliniske studier av en vaksine bekrefter de at vaksinen faktisk fungerer (immuniserer).

De kan også hjelpe til med å retrospektivt søke etter uker eller måneder om det har vært en infeksjon hos en person (mistenkt infeksjon, kontaktundersøkelse av en infisert), og måle den retrospektive eksponeringen til en gruppe.

Bakgrunn: Utformingen av disse analysene er teknisk enkel, men analysens verdi ligger i valget av antigen oppdaget, avhengig av den økende forståelsen av hvordan "viral coating" ( capsid ) utløser gjenkjenning og gjenkjenning. Nøytralisering av viruset ved sunt immunsystem. Siden april 2020 har mange laboratorier og diagnosefirmaer konkurrert om å masseprodusere dem, ettersom de fleste regjeringer vil kjøpe dem i millioner, for sjekker og for enkeltpersoner. Under ledelse av WHO og "med sine nasjonale regulatorer, må regjeringer finne en balanse mellom haster og de daglige bekymringene for følsomhet og spesifisitet som gjelder enhver ny medisinsk diagnose" .

En pasient som har blitt smittet med Covid-19 er sannsynligvis immun i flere måneder eller år (som gjenstår å bekrefte). Basert på denne høye sannsynligheten, overfor det haster med å "få folk tilbake til å jobbe og gjenåpne grenser - og de hvis immunitet kan påvises, kan vende tilbake til arbeidet på en trygg måte" og overfor mangel på offiserer, kan en slik test vise at en helsearbeider kunne trygt eller trygt komme tilbake på jobb; noen myndigheter har unntaksvis bestemt seg for å lette evalueringskriteriene sine siden midten av mars for FDA .

Merk  :

  1. en immunologisk test analyserer en prøve av blodserum  ; det kan være positivt lenge etter utvinning, når viruset ikke lenger er tilstede, men i løpet av inkubasjonsperioden er denne testen mye mindre følsom enn en PCRn-test og negativ de første 6 dagene i tilfelle SARS-CoV-2 ; den vurderer derfor ikke den tilstedeværende virusinfeksjonen, men immuniteten mot viruset. Hvis den ble brukt til deteksjon på slutten av en inneslutningsperiode, er det sannsynlig ikke å oppdage alle de forurensede profilene fordi følsomheten er bare 70% i løpet av de første 10 dagene av infeksjonen.
  2. Forsiktighet bør utvises i tilfelle plasmaoverføringsterapi fra infiserte og kurerte personer (passiv immunisering): i dette tilfellet vil testen være positiv, det vil si at den vil indikere at personen har de antistoffene som er søkt på tidspunktet for test., uten å spesifisere at infeksjonen er (allerede) kontrollert, og om immunitet bare kortvarig er gitt av behandlingen eller ervervet .

Immunologiske tester tilgjengelig:

  • de 17. februar 2020, ble den første immunologiske testen for SARS-CoV-2 beskrevet i Kina av et team fra Wuhan Institute of Virology  ; Den første hurtigprøven ble opprettet av det fransk-finske bioteknologiselskapet Mobidiag (assistert til 25 millioner euro av den europeiske investeringsbanken i 2019), men den er produsert av den kinesiske gruppen Autobio Diagnostics (leder for klinisk diagnose i Kina) deretter distribuert av Mobidiag og lokale distributører (unntatt i Portugal, Nederland og Ukraina). Denne første immuntesten fungerer via de to Amplidiag- og Novodiag- plattformene ; immunanalyse for noen IgG og IgM i serum , fullblod eller plasma tar omtrent 15 minutter.

Mobidiag opprettet deretter to komplementære molekylære tester ( Novodiag COVID-19 og Amplidiag COVID-19 );

  • de 25. februar 2020, et team fra Duke - NUS School of Medicine  i Singapore kunngjorde nok en antistofftest for SARS-CoV-2 , noe som ga et resultat innen få dager.
  • de 28. februar 2020, har et annet sørkoreansk selskap (PCL) bedt om akselerert godkjenning fra det sørkoreanske departementet for mattrygghet og medisiner for et såkalt COVID-19 Ag GICA Rapid  " -sett , som er mye raskere enn en sanntids RT-PCR-basert oppdagelsessett; PCL sier at kit-diagnoser på 10 minutter.
  • I Europa klarte Euroimmun- gruppen raskt å bli sertifisert en "Anti-SARS-CoV-2" test, som derfor kan selges innen EU .

Andre selskaper over hele verden har utviklet tester, inkludert det bretonske selskapet NG Biotech, som vant det franske markedet. Denne SMB indikerer imidlertid at den har en månedlig produksjonskapasitet på 500 000 tester fra begynnelsen av mai, som bare vil dekke en veldig liten del av behovene som er involvert i massiv screening under dekonfinering.

Tester basert på Cas12-enzymet

En metode basert på enzymet cas12 tillater på 40 minutter, bare med reagensene i testen for å visualisere eller ikke forurensningen. Studien involverte 83 pasienter og ville gi en positiv prediktiv verdi på 95% og negativ på 100%.

RT-LAMPE

Den reverserte transkripsjonsløyfemedierte isotermiske amplifiseringen (isotermisk amplifikasjon mediert av en revers transkripsjonsløyfe) eller RT-LAMP, er en teknikk for å amplifisere nukleinsyrer i et enkelt trinn som kombinerer den isotermiske amplifikasjonen formidlet av løkkene (LAMP) og revers transkripsjon . Testing kan utføres uten isolasjon av RNA, ved å oppdage tilstedeværelsen av SARS-CoV-2 direkte fra vattpinner eller spytt.

Diagnose ved lungeskanner

Den lunge skanner , en rutine bildebehandling verktøy for diagnostisering lungebetennelse , er rask og relativt enkel å utføre som et supplement til klinisk undersøkelse, uten å være en ekte virustest. Forskning fant at metodens følsomhet for å påvise Covid-19 var 98%, sammenlignet med en følsomhet på 71% for RT-PCR. For denne studien satte forskere ved Tongji Hospital i Wuhan , Kina, seg for å studere den diagnostiske verdien og konsistensen av bildebehandling av brystet mot RT-PCR-testing for diagnosen Covid-19.

Deteksjon i spytt av hunder

En pilotstudie utført med hunder viste en påvisningsgrad på 94%.

Symptomatisk diagnose

Den manglende evne til å gjenkjenne den søte smaken av salt kan være en indikasjon tegn på en infeksjon.

Analyse av utåndet luft

Det er elektroniske Sars-Cov2-detektorer i inneluft, men kostnadene er fortsatt høye, spesielt hvis de bruker et massespektrometer . Kostnadene ved bruk vil imidlertid være lavere enn for PCr-testene.

Omfanget av testing

Testene kan brukes av forskjellige interessenter: leger som vil ha et diagnoseperspektiv eller bekreftelsesperspektiv, helsepersonell som ønsker å gjennomføre en screeningkampanje, epidemiologer som ønsker å vurdere nivået av spredning av epidemien for å gi råd til beslutningstakere om kollektivet eller individuelle isolasjonstiltak som skal foreskrives.

Diagnostisk

Fra et diagnostisk perspektiv er en test av større interesse, jo større er den positive prediktive verdien . Den generelle oppfatningen fra legeprofesjonen er at den diagnostiske koronavirus-testen ikke har stor nytte, at man kan være fornøyd med en evaluering av symptomene . Faktisk, hvis pasienten ikke manifesterer de karakteristiske symptomene på infeksjonen, er det a priori av liten interesse for legen i den grad det ikke på forhånd krever noen handling fra hans side. I tillegg, overfor mangelen på deteksjonstester, i forhold til epidemien, kreves det ikke deteksjon av offentlige myndigheter som en mulig forebyggende behandling. I begynnelsen av mai 2020 , er det dessuten ingen behandling av påviste tilfeller, i den pre-symptomatiske fasen, som er anerkjent av akademiet for medisin .

Den ganske dårlige følsomheten til PCR-tester, nær 60% i befolkningen generelt, ser ut til å ha bidratt til å tvile på effektiviteten og derfor nytten av testene for diagnose i den generelle befolkningen, selv om et flertall av forurensede er asymptomatiske. Ved å bruke spesifisitetsverdiene (99,2%) og sensitiviteten (60,2%) av virusantigen-testen, og en prevalens i midten av april på 2,38%, finner vi en positiv prediktiv verdi per test. Er 0,65 og en negativ prediktiv verdi 0,99. Ved å bruke spesifisitet (75%) og sensitivitet (55%) av Rt-PCR-testen, og en prevalens i midten av 2,38%, finner vi en positiv prediktiv verdi på 0,49 og en negativ prediktiv verdi på 0,985.

Verdien 0,49 for den positive prediktive verdien, tatt i betraktning den estimerte prevalensen i begynnelsen av april, viser viktigheten av inklusjonskriteriene hvis vi ønsker å sammenligne effektiviteten av behandlingene i to studier, for å unngå en seleksjonsskjevhet . På den datoen var det faktisk en gjennomsnittlig andel på minst 1/2 av falske positive hvis inklusjonskriteriet bare er basert på en Pcr-test. Hvis mer enn 80% av pasientene kommer seg uten symptomer, beholder det eneste utvalget av symptomatiske pasienter spesifikke profiler, med lavere sjanser for restitusjon, enn hvis utvalget beholder andre typer pasienter.

Likheten mellom symptomene på epidemien og influensa betyr dessuten at testene i praksis har blitt brukt systematisk for å bekrefte den kliniske diagnosen for å tilsynelatende unngå unødvendige sykehusinnleggelser, mens integreringen av nye Sars-Cov2 i en MultiPlex PCr-test er kanskje mer berettiget, spesielt om vinteren. Å fullføre PCR-testen med en lungescanner vil utvilsomt gi en positiv prediktiv verdi, høyere med 0,74, enn en Pcr-test alene som er individuelt ikke veldig effektiv sammenlignet med en diagnose fra en lungescanner. Assosiert med bildebehandling (følsomhet 94%, spesifisitet 98%) eller en multiplex Pcr-test (følsomhet 99%, spesifisitet 98%). For å unngå en falsk negativ som følge av en PCr-test i nærvær av symptomer, kan en brystskanner vurderes.

En kinesisk retrospektiv studie, publisert den 11. april 2020i Journal of Clinical Virology , relatert til 301 innlagte pasienter med moderat eller alvorlig form (men ingen av dem krevde overføring til ICU), ble 1113 RT-PCRs utført hos disse pasientene på nese- eller strupehalspinner (nese og munn). Denne studien gjør det mulig å etablere dynamikken til RT-PCR:

0−7 dager 8-14 dager 15−21 dager 22−28 dager Mer enn 28 dager
97,9% 68,8% 36,3% 30% 26,3%

En metaanalyse publisert den 13. mai 2020i Annals of Internal Medicine nevner også falske negativer fra 38% på D5 (gjennomsnittlig dag for symptomdebut) til 20% på D8 for å stige til 21% på D9 og deretter 66% på D21.

Screening

Den andre bruken av en test er å sortere ut det forurensede for å unngå spredning av epidemien så mye som mulig. Fra dette perspektivet er testen desto mer interessant hvis den har minst en betydelig positiv eller negativ prediktiv verdi . Det er mer beslutningstakerne: helsepolitiske ledere, sykehusdirektører, ledere av eldreboliger , bedriftsledere som er opptatt av dette formålet. Hvis serologiske eller Rt-Pcr-tester brukes, avhenger påliteligheten av en sortering særlig av den gode negative prediktive verdien som oppnås, spesielt hvis reseptene fornyes regelmessig.

Hvilken test skal du bruke?

Den negative prediktive verdien er ganske kompleks å evaluere, fordi den i teorien avhenger av testens deklarerte verdier ( sensitivitet , spesifisitet ) og av prevalensen . Men i praksis er den viste følsomheten et gjennomsnitt, som varierer veldig avhengig av pasientens situasjon på tidspunktet for testen: inkubasjon , serokonvertering . Den sveitsiske Foundation Find  (en) viser verdiene av de særegenheter og følsomhet tester for påvisning av SARS-CoV-2. Det kan sees av dataene gitt at mens de fleste serologiske tester tilbyr en spesifisitet som er større enn 90%, er det få som har en følsomhet større enn 90% og ingen i løpet av de første 7 dagene av infeksjonen; at det også er få tilbud om antigene tester.

Den negative prediktive verdien på 0,985 i teorien tillater bruk av Rt-Pcr-tester for sortering, men i praksis vil imidlertid en betydelig andel fra 30% til 75% av falske negativer bli observert , noe som kan forklares med de praktiske vanskelighetene under prøven som ble brukt til testen. De er i Frankrike, i slutten av april, de eneste typene tester som har blitt brukt til screening.

De serologiske testene har en høyere frekvens av falske negativer enn antigentester, som virker de enkleste og mest pålitelige å bruke, selv om de ikke produseres i Frankrike i midten av april. I praksis er de nesten ubrukelige for screening . Faktisk er formålet med en screeningtest å velge den delen av befolkningen som potensielt er forurensende og å isolere den i løpet av denne perioden. Imidlertid betyr det positive resultatet av en serologisk test med en sannsynlighet sannsynligvis større enn 50% at pasienten har blitt forurenset, men ikke lenger er, at han oftest ikke lenger har virusbelastning, og han har derfor liten interesse i gjennomsnitt til sette ham i isolasjon (selv om vi ikke kan snakke for den falske positive testen ). Dermed ville det ikke være veldig fornuftig å sette i isolasjon i tre uker, de 5% av befolkningen som er immun mot viruset, og derfor blir oppdaget positivt for testen. Motsatt har de som ble oppdaget positivt for mer enn en måned siden, ingen objektive grunner til å bli tvunget av inneslutningstiltak som kan avgjøres i et territorium, fordi de har svært stor sannsynlighet for å være immun og ikke-forurensende. I tillegg, på grunn av inkubasjonsperioden som kan vare i 20 dager, betyr et negativt resultat heller ikke med en betydelig sannsynlighet (fordi følsomheten er dårlig i denne perioden) at pasienten ikke lenger forurenser fremtiden: andelen falske negativer er derfor viktig spesielt i denne perioden. Politikken, som ble bestemt i midten av mai, bestående i å gi medisinsk personale resept på en serologisk test, kan ikke sammenlignes med en screeningpolitikk, men snarere med epidemiologisk overvåking, selv om den også kunne vært utført ved undersøkelser. Imidlertid gjør det positive resultatet av en serologisk test det mulig å sikre med en meget høy sannsynlighet for immuniteten til den testede, og for eksempel nytteløsheten til å gjennomgå vaksinasjon eller en periode med isolasjon etter en positiv Pcr-test.

Befolkningsscreening er desto mer effektiv jo tidligere i løpet av epidemien, fordi den negative prediktive verdien avtar når forekomsten øker. Ved å beregne den prediktive verdien av en serologisk test på grunnlag av en prevalens på 0,10 (verdi som skal beholdes i midten av april ifølge helseministeren), finner vi en negativ prediktiv verdi på 0,97, som viser at sortering blir mindre effektiv enn ved starten av epidemien (3% av de testede var falske negativer). Tvert imot er forekomsten som for eksempel er lavere i målpopulasjonen til medisinsk personell enn i den generelle befolkningen (3,6% versus 5%), den negative diagnostiske verdien i denne populasjonen for antigendeteksjonstesten av viruset. , er bedre enn i befolkningen generelt. Det virker derfor som en prioritet å utføre screeningtester i regioner der prevalensen er høyest, eller i utvidelse, fordi sortering risikerer å være desto mindre effektiv med den naturlige spredningen av epidemien i disse regionene eller blant publikum med de mest sosiale interaksjonene. I tillegg antyder prevalensstudien som ble publisert av Pasteur Institute i midten av april at den mest aktive sirkulasjonen av viruset er i Île-de-France , spesielt gitt den høye bruken av offentlig transport assosiert med høy prevalens. Barn under 10 år er asymptomatiske bærere som er så sannsynlige å bli smittet som voksne, og ikke signifikant mindre enn de mellom 10 og 19 år. Med tanke på mangelen på deteksjonstester, ville det være mulig å reservere PCr-tester som andre linje, i den grad en enkel blodanalyse av biologiske parametere allerede kan oppdage 70% av Sars-Cov2-infeksjoner.

Rask screeningtest (TROD) kan gjøres på legekontor, på apotek eller i et selskap av helsepersonell. En selvtest nesten lik TROD eksisterer. Testen utføres ved å ta en dråpe blod, ofte fra tuppen av en finger, og sette den i kontakt med et reagens.

Nasal vattpinneprøver, slik som PCR-testen og antigen-testen, må utføres med forsiktighet av en helsepersonell som tidligere har fått opplæring i denne testen. I USA gjennomboret en nesetest slimhinnen i pasientens hjerne, dette er en veldig lav risiko. Pasienten hadde et udiagnostisert problem, og testen kan ha blitt gitt feil for hennes tilstand. Personer som har hatt bihuleoperasjon, bør vurdere å bestille muntlige tester hvis mulig.

Gruppe

Det er også mulig å utføre tester ved å slå sammen etter sone eller ved å samle gruppe for å lagre antall tester som skal utføres. PCR-tester tar ganske lang tid å utføre, og det ser ut til å være praktiske problemer med å slå sammen prøvene utover noen få enheter. Imidlertid er det allerede utført tester basert på grupper på opptil 30 prøver, in vitro og in vivo. Noen grupperingsstrategier lar deg også lage overlappende grupper. For å utføre PCR-tester i stort antall står vi imidlertid overfor problemet med mangel på reagenser. Serologiske tester anbefales ikke for screening fordi de ikke måler tilstedeværelsen av viruset og derfor ikke smitter. Teknikken vil være spesielt godt egnet for raske blodantigenprøver.

Den poolage kan generaliseres til å sikre rask ikke smitte av en gruppe individer førte til noen sameksistens: hjemmene pasienter for eldre (der 50% av registrerte dødsfallene skjedde), passasjerer om bord et fartøy, arrestert etter å ha gjort et anslag over utbredelsen Faktisk viser påvisning av klynger ved å spore kontaktkjedene til de som blir oppdaget positive i praksis å være ineffektiv i mange tilfeller, mens digital sporing på frivillig basis forblir delvis innen eksperimentering. I sammenligning med andre land virker kontaktsporing ineffektiv i Frankrike, mens det samlede påvisningsnivået var utilstrekkelig i slutten av juni 2020. Kontaktsporing er virkelig vanskelig å implementere i fase 3 av epidemien, når prevalensen har overskredet en viss terskel . Klyngeovervåking vil også være en generelt utilstrekkelig metode, 80% av forurensningene er faktisk forårsaket av 10% av pasientene ( superinfektor ), noe som sannsynligvis gjør det nødvendig å bruke nye påvisningsmetoder som detektorer eller raske tester. Deteksjonen av superinfektorer er imidlertid vanskelig, spesielt hvis man avstår fra å bruke gruppering, eller hvis man ikke mer systematisk i mindre grad bruker kvantitativ PCR eller enda bedre en analyse av nivået av Interleukin 6 eller immunglobulin G , som gir informasjon om smittsomhetsnivået til et individ. Ellers er begrensningen av situasjoner. der superinfektorene sannsynligvis vil være mest forurensende, virker passende. Omvendt, gitt en median dødsalder på 84 år, ville det være legitimt å kreve at alle eldste identifiserte kontakter utførte tester som beviste at de ikke smittet, for eksempel ved å pålegge ukentlig overvåking av medisinsk personell. Å oppnå PCR-testnummer er allerede implementert i teknikker som digital PCR  (in) . Den digitale PCR, utført på en enkelt prøve, har en bedre følsomhet for påvisning av viruset enn PCR. Vi kan vurdere å gjøre gruppetester av prøver med Digital Pcr, med en veldig god påvisning av forurensning eller ikke gruppe. En tilnærming basert på metagenomics ville tillate 19 200 prøver å bli testet samtidig. Det er mer generelt en teoretisk støtte som kan gi opphav til mange praktiske teknikker for gruppering av tester  (in) . 17. mai 2020 avga Høye rådet for folkehelse imidlertid en negativ uttalelse om bruk av pooling for screening, i motsetning til praksis i mange andre land ( Liste over land som praktiserer pooling for påvisning av Covid-19  (in) ). Selv om myndigheten erkjenner at fremgangsmåten kan redusere antall tester som skal utføres, har den utelukkende utelukket fordi amplifiseringsverktøyene som er tilgjengelige for laboratorier, ikke er direkte egnet for denne typen praksis (fraksjonering og gruppering av prøver). , og fordi det ville gjøre det vanskelig for laboratoriene å fakturere trygd for PCR-testene . I motsetning til dette vil metoden utvides til Israel fra begynnelsen av oktober 2020. Samtidig har 9 millioner kinesere blitt testet på fem dager med gruppering ved å anvende en metode som allerede er validert i andre. Kinesiske tettsteder. Bruk av gruppering virker desto mer rettferdiggjort, siden i midten av mai i gjennomsnitt er mindre enn 4% av Pcr-testene utført på sykehuset positive og noen ganger mye mindre. Praksisen ville gjøre det mulig å redusere analysetiden for ugrupperte tester betydelig, som i slutten av september 2020 var veldig ofte i Frankrike mer enn 24 timer og i en sone med høy sirkulasjon av viruset (rødt) nær en uke. Risikoen for at epidemien sprer seg øker med gjennomsnittlig tid det tar å utføre testene.

Bruken av tester er fortsatt det beste verktøyet som er tilgjengelig for å målrette hvilken populasjon som skal isoleres: den som har testet positivt. Dette, selv om tilgjengelige tester sannsynligvis vil oppdage en ganske stor andel av falske positive , vil dette ikke nødvendigvis redusere dets evne til effektivt å identifisere den virkelig ikke-forurensende befolkningen. På den annen side, hvis positiviteten i forhold til en test ikke for eksempel er ledsaget av isolasjonstiltak (for eksempel må du trekke deg tilbake på profesjonelt nivå), vil screening miste målene. I Frankrike, gitt antallet daglige dødsfall på 60 i begynnelsen av juni, blir epidemien kontrollert ved å overvåke klynger og opprettholde barrierer. Det ser faktisk ut til å være avvik mellom uttalelsene fra det vitenskapelige rådet som anbefaler "massiv screening ved det minste symptom" , og forholdene fra Helsedepartementet som er begrenset, uten medisinsk resept, til screening på grunnlag av '' sporing av antatte kontakter av symptomatiske bærere, oppdaget som sådan (unntatt i tilfeller av falske negativer), og på grunnlag av disse kontakternes frivillige karakter. Frem til slutten av juni og på nasjonalt nivå var det derfor ingen endring i betingelsene som kreves for å dra nytte av en screeningtest. Fra slutten av juni endrer imidlertid helsedepartementet sin policy for å godkjenne screening for alle som ønsker å gjøre det i klynger eller perifere områder, og deretter 25. juli for alle som ønsker å gjøre det.

Epidemiologisk overvåking

Mens systematisk screening er den mest ønskelige, gjør mangelen på deteksjonstester det nødvendig å være fornøyd med mindre ambisiøse mål som målrettet screening (på grunnlag av sannsynlige kriterier for tilstedeværelse) eller epidemiologisk overvåking. Å bruke en test med en følsomhet på i beste fall 70% for å estimere spredningen (eller prevalensen ) av epidemien vil ha en usikkerhetsmargin. På den annen side, på grunn av den høye spesifisiteten, vil vi kunne vurdere med større presisjon andelen av befolkningen som ikke er forurenset. Serologiske tester har blitt brukt med suksess for denne typen screening fordi de er svært effektive til å måle individer som har serokonvertert (immunisert).

Evalueringen av prevalensen er viktig fordi den er involvert i beregningen av testens prediktive verdier. Oppdaterte geografiske estimater av utbredelsen i fravær av grunnleggende reproduksjonshastighet (dvs. ) kan utvilsomt gjøre det mulig å etablere en geografisk stopp-og-gå- inneslutningspolitikk, slik det opprinnelig ble praktisert i ' Oise . Det er faktisk mer dynamikken i forurensningen enn nivået det er interessant å overvåke. Overvåkingen som kan komme på plass er imidlertid bare et middel for å evaluere behovet for inneslutningstiltak, nivået på kravet til sperringstiltakene som skal iverksettes, men kan neppe gå i mot eksisterende faktorer som befolkningen tetthet, medisinsk utstyr tilgjengelig, tilbøyeligheten til å overholde inneslutningstiltak, sanitærnivå, overbelegg osv.

Produksjon av testsett

Kina har kunngjort at de produserer 1,7 millioner nukleinsyrebaserte tester og 350 000 antistofftestsett hver dag i 25. februar 2020.

Den Canada godkjent en bærbar DNA test, kalt "kuben Spartan" av selskapet basert på bioteknologi Ottawa som utviklet, Spartan Bioscience. Den Quebec regjeringen har allerede bestilt 200 000 av disse testene.

Den Algerie er den andre afrikanske land til å produsere tester, etter Sør-Afrika . Testene er produsert av legemiddelfirmaet Vital Care, med base i Alger med en produksjonskapasitet på 200 000 tester per uke.

Samle prøver

RT-PCR-testing i sanntid kan utføres på luftveisprøver oppnådd ved en rekke metoder, inkludert nasopharyngeal vattpinne eller sputumprøve . Resultatene er vanligvis tilgjengelige innen noen timer til to dager.

Hong Kong har et system på plass som gjør at mistenkelige pasienter kan holde seg hjemme: legevakten gir pasienten et prøverør, pasienten spytter inn i den, sender den tilbake og får et testresultat kort tid etter.

Det britiske NHS har også kunngjort at det vil begynne å teste mistenkte tilfeller hjemme, noe som unngår risikoen for å smitte andre på sykehus og måtte desinfisere ambulansen hvis den er i bruk.

Steder og betingelser for forskrivning av tester

I Frankrike ble for eksempel påvisningen gjort i mars 2020 på sykehus. Forsinkelsen var relativt lang fordi det var nødvendig å sende prøvene til et av de 120 deteksjonssentrene og utføre PCR-testen som tar en halv dag. I følge Imperial College London ville det faktisk være nødvendig å blokkere "mer enn 60% av forurensningen ved hjelp av kontrolltiltak for å kontrollere epidemien" . Den Været spilte ikke for en reduksjon av diffusjon, i motsetning til hva som skjer for sesonginfluensa kjent , minst til 2022. Dette synes også bekreftet av fordelingen observert i land som Iran eller Australia, som opplevde våren temperaturer for nord halvkule på begynnelsen av året .

Andelen infiserte, men asymptomatiske pasienter er mellom 1 og 50%, ifølge kildene. Ungdomspopulasjonen ville være for noen en smittevektor fordi smittet like mye som den voksne befolkningen, for andre ville det være lite, spesielt for barn under 14 år.

En systematisk deteksjonsprotokoll målrettet mot fokus eller mikrofokus av infeksjon, slik den har blitt brukt i asiatiske land ( Surveillance-containment  " -metode ), favoriseres ikke av Helsedepartementet i Frankrike, på grunn av manglende tilstrekkelige tester og deteksjonssentre og å lykkes med å mestre de relaterte problemene med mangel på beskyttelsesmasker, reagenser (som respiratorer i intensivbehandling), særlig på grunn av utilstrekkelig nasjonal produksjon. Eksemplene på forurensning av EHPAD i Vill'alizé eller ledelsen av AP-HP som erkjente at det fortsatt var mulig for omsorgspersoner å jobbe "når symptomene er ekstremt beskjedne" viser faren for å utsette implementeringen av en screeningtest til den symptomatiske fasen av sykdommen når den gjennomsnittlige inkubasjonstiden før symptomene er 6 dager. Disse feilene i screening for tilveiebringelse av verneutstyr til pleiepersonell, som er blitt utsatt for eller som følge av uaktsomhet, vil juridisk sett være ansvarlig for å engasjere staten og ledelsen av visse aldershjem , innenfor rammen av den prinsipielle forholdsregelen , manglende anvendelse av angreretten eller fare for andres liv . Dermed hvis helseministeren erklærte i sin pressekonferanse av 28.3.20: "Jeg vil be om at vi kan teste personalet på sykehjem som en prioritet" , synes hans forespørsel vanskelig å oppnå. Når man tar i betraktning en arbeidsstyrke på sykehjem på 430 000 mennesker, en produksjon av tester i slutten av mars, per dag på nasjonalt nivå på 12 000, med en inkubasjonsperiode på viruset på 7 dager, vil dette innebære å utføre 430 000 tester per uke, dvs. godt over tilgjengelig kapasitet (sammenlignet med Tyskland der det utføres 500 000 tester per uke). Dette mens det også blir gitt instruksjoner om ikke å innlegge innbyggere på aldershjem i tilfelle smitte, og at tallet på 100.000 dødsfall som kommer anses som sannsynlig.

Den daglige testing tallet i Frankrike er svak effekt i forhold til andre land : landet ville bare 8 th posisjon i rangeringen av landene etter antall tester utført, basert på befolkningen (8 ganger mindre enn det som tester 'i Korea med en befolkning på rundt 52 ​​millioner). Ifølge New England Journal of Medicine , i en studie av mer enn 1000 pasienter med koronavirus og innlagt på sykehus i Kina, hadde bare 43,8% av pasientene feber ved innleggelse, og en annen studie indikerer at asymptomatiske tilfeller er årsaken til forurensning på 79 % av tilfellene oppdaget.

Evalueringen av dødeligheten som viruset gir (fra 0,6% til 5% avhengig av land og sannsynligvis 1% i gjennomsnitt) ser ut til å være knyttet til reseptfrekvensen av utførte tester per innbygger, og i mindre grad til kvaliteten på behandlingene som tilbys. Faktisk, hvis dødstallene er kjent med god presisjon, er de av infiserte mennesker veldig omtrentlige på grunn av den høye andelen asymptomatisk, spesielt hvis testreseptene er reservert for symptomatiske pasienter i en tilstand av åndedrettsnød. Sammenligning av forurensningskurvene for Korea og andre land antyder en undervurdering av antall reelle tilfeller av forurensning i Frankrike. Spesielt er den tilsynelatende dødeligheten ti ganger høyere i Frankrike enn i Tyskland (hvis screeningkapasitet er 6 ganger høyere enn i Frankrike) sannsynligvis i stor grad knyttet til en undervurdering av antall reelle tilfeller i Frankrike. Oppdagelseskapasitet i Frankrike er hovedsakelig begrenset av utstyret til termosyklister for offentlig domene, bare tilgjengelig i de 120 deteksjonssentrene. Dessuten, til tross for dekretet fra7. mars 2020tillatelse til åpning av nye screeningsentre, i praksis var det relativt få åpninger av sentre, som i første halvdel av 2020 var rundt 150 i Frankrike, nesten utelukkende på sykehus, noe som øker risikoen for nosokomiale sykdommer , (mot for eksempel 540 for Korea). de16. mars, WHO ber om å teste hvert mistenkte tilfelle. Spesielt Frankrike, ifølge avisen Le Point, ville på grunn av regulatoriske begrensninger være privatapril 2020, med en ukentlig kapasitet på minst 150 000 tester. Imidlertid forblir screeningpolitikken midt imars 2020, ifølge landene veldig forskjellige, mens responsen på planetepidemien ikke kan gjøres effektivt uten samordnet handling fra statene, og uten å bli inspirert av politikken for screening av landene som har lyktes i å gi en bøyning av kurven i sakene oppdaget. På europeisk nivå er det mangel på produksjon av beskyttelsesmasker som risikerer å fortsette forurensninger, mens Europa allerede er det første globale fokuset i epidemien. de20. mars 2020, mener presidenten for det vitenskapelige rådet at generalisert screening vil være nødvendig på slutten av innesperringsperioden. Imidlertid ser det ut til at fransk testproduksjonskapasitet ikke er tilstrekkelig i midten av april, for denne målsettingen og testordrer som er gjort i utlandet, er underlagt farene som følge av betydelig global etterspørsel. Dette mens de tilgjengelige dataene i midten av mars 2020 antyder at utviklingen av epidemien i Frankrike vil følge, med liten forskjell, den i Italia med et forsinkelse på 6 til 9 dager forsinket, og at effekten av inneslutningstiltak bestemt i sistnevnte land er sakte å føle på. Dødsfallskurven gir imidlertid håp om en stabilisering i begynnelsen av mai.

Antall tester avhengig av land

I følge avisen Le Monde , kl20. mars 2020, i Tyskland utførte vi “160 000 tester per uke” (= 22 857  / dag ), mens vi i Frankrike gjorde mindre enn 2000  / dag til8. mars, og 4000  / dag fra13. mars.

I England, ifølge The Guardian ,18. mars 2020, vi utførte 4000  tester / dag og regjeringen kunngjorde at de raskt ville nådd 20.000  tester / dag .

I USA, ifølge The New York Times , LabCorp kunngjorde at det kunne utføre 10.000  tester / dag pr23. mars 2020, deretter 20 000  tester / dag i slutten av mars; den offentlige sektoren har bare utført 30 000 tester de fem siste ukene, ifølge data fra Johns Hopkins University . de24. mars, kunngjorde koordinatoren for Coronavirus task force i Det hvite hus at 50.000 til 70.000 daglige tester ble utført.

På 24. mars 2020, Frankrike har utført 101 046 tester mot 500 000 tester per uke i Tyskland, Sør-Korea, etter å ha utført nesten 400 000 tester siden epidemien startet. Ved å relatere antall tester til størrelsen på den nasjonale befolkningen, det vil si antall tester som er utført per 10 000 innbyggere i hvert land, utfører Frankrike for tiden 15. Fem ganger mindre enn Tyskland (80) eller Sør-Korea ( 77).

Vi kan understreke vanskeligheten med å ha pålitelige og sammenlignbare tall på antall tester som er utført i hvert land. Startapril 2020begynner Worldometer-nettstedet å publisere det totale antallet tester per land: på datoen 7. april, er tallene 918.460 for Tyskland (som ikke stemmer overens med antallet 500.000 per uke som er publisert i media) og 224.254 for Frankrike. Sammenlignet med befolkningen gir dette omtrent 3 ganger flere tester i Tyskland enn i Frankrike, og denne andelen holder seg stabil gjennom ukene. Samtidig begynner også OurWorldInData-siden å presentere grafer over antall tester etter land; i sine forklaringer forklarer dette nettstedet at dataene er veldig delvis, og spesielt at det ofte ikke er kjent om det offisielle antallet gjelder antall testede personer eller antall testede prøver.

I de publiserte tellingene for hvert land er det usikkerhet om arten av testene (typen - RT-PCR virologisk test eller antistofftest - ikke angitt).

På 19. april 2020, ifølge Worldometer, testet landene som utførte flest test 1-3% av den totale befolkningen - bortsett fra noen få land som Island, som rapporterer 12% av befolkningen som ble testet, og antar at hver test samsvarer med et annet individ. skanning av datatabellen viser at det er en viss grad av korrelasjon mellom det totale antallet tester per million innbyggere og det totale antallet rapporterte tilfeller. Korrelasjonen virker svakere mellom det totale antallet tester per million innbyggere og det totale antallet dødsfall per million innbyggere (det er faktisk nødvendig å identifisere pasientene for å relatere dem til et dødsfall av covid-typen).

Det antall tester utført  (i) i forhold til den populasjonen (per million innbygger), kan være en kvantitativ indikator på kapasiteten til en tilstand for å identifisere infiserte pasienter, men er ikke systematisk så. Denne evnen er også relatert til måten testene utføres på. I midten av april ble det for eksempel utført fem ganger færre tester per million innbyggere i Japan enn i Frankrike, men Japan har mer systematisk orientert seg mot å identifisere klynger og bruke en maske enn mot en systematisk screening. Innenfor rammene av en screeningpolitikk som også må integrere mangel på tester, er det viktig å prøve å maksimere forholdet på et gitt smittenivå ved å definere sannsynlighetskriterier (livsstil, yrker, kontakter, regioner osv. .) sannsynlig å målrette den sannsynligvis infiserte befolkningen så mye som mulig, for å redusere de tilgjengelige testene så mye som mulig.

Merknader og referanser

  1. (in) "  Wuhan coronavirus  "www.european-virus-archive.com (åpnet 4. mars 2020 ) .
  2. (in) Cormac Sheridan, "  Coronavirus og løpet for å distribuere pålitelige diagnoser  " , Nature Biotechnology ,19. februar 2020, d41587–020–00002-2 ( ISSN  1087-0156 og 1546-1696 , DOI  10.1038 / d41587-020-00002-2 , lest online , åpnet 3. mars 2020 ).
  3. (in) Institut Pasteur, Paris, "  Protokoll: RT-PCR-analyser i sanntid for påvisning av SARS-CoV-2  " [PDF] , WHO ,2. mars 2020.
  4. Soyoun Kim , Dong-Min Kim og Baeckseung Lee , "  Utilstrekkelig følsomhet for RNA-avhengig RNA-polymerase fra SARS-CoV-2 viralt genom som bekreftende test ved bruk av koreansk COVID-19 tilfeller  ", preprints.org (prepublication) ,28. februar 2020( DOI  10.20944 / preprints202002.0424.v1 , les online ).
  5. "  Deteksjon av høy følsomhet av coronavirus SARS-CoV-2 ved bruk av multiplex PCR og en multiplex-PCR-basert metagenomisk metode, p 3/28  ", biorxiv ,19. mars 2020( les online ).
  6. (kb ) Kogenebiotech
  7. (in) "  [NEWS / GenomeWeb] Det første settet 'PowerChek ™ 2019-Ncov Real-time PCR Kit' for EUAL by KFDA & KCDC  " , Kogene,11. februar 2020.
  8. (in) "  [Nytt produkt] Covid-19 KIT  " , Kogene,27. februar 2020.
  9. (in) Seegene - Offisielt nettsted.
  10. (kb) (no) Solgent - Offisielt nettsted.
  11. (in) "  Informasjon om autorisasjon til nødbruk for 2019 Novel Coronavirus (2019-Ncov) Real-Time RT-PCR Diagnostic Panel  " , CDC,13. februar 2020.
  12. (in) "  Transkripsjon for CDC Telebriefing Update on Covid-19  " , CDC,8. februar 2020.
  13. (in) "  HKUST Research Team Invents World's Fastest Coronavirus Detection Device Offering Diagnosis Results in 40 Minutes  " , The Hong Kong University of Science and Technology (åpnet 4. mars 2020 ) .
  14. (in) "  Laboratory guidance  " , WHO (åpnet 4. mars 2020 ) .
  15. "  WHO viser to COVID-19 tester for bruk i nødstilfeller  " ,7. april 2020
  16. "  WHO Emergency Use Listing for In vitro diagnostics (IVDs) Detecting SARS-CoV-2  " ,22. september 2020
  17. (no-US) “  SARS-CoV-2 diagnostic pipeline  ” , på FINN (åpnet 17. april 2020 ) .
  18. "  Liste over diagnostiske reagenser  " .
  19. "  Rollen til bildebehandling i romanen coronavirus lungebetennelse i 2019 (COVID-19)  ", europeisk radiologi ,15. april 2020( les online ).
  20. "  Covid-19 RT-PCR-tester viser seg å være veldig dårlige smittsomhetstester  ", ny fabrikk ,1 st september 2020( les online )
  21. (en) “  COVID Diagnose with PCR Misinterpreting results Cycle terskel forklart  ” , på YouTube ,19. september 2020
  22. (no) Anika Singanayagam , Monika Patel , Andre Charlett og Jamie Lopez Bernal , "  Varighet av smittsomhet og korrelasjon med terskelverdier for RT-PCR-syklus i tilfeller av COVID-19, England, januar til mai 2020  " , Eurosurveillance , flight.  25, n o  32,13. august 2020, s.  2001483 ( ISSN  1560-7917 , PMID  32794447 , PMCID  PMC7427302 , DOI  10.2807 / 1560-7917.ES.2020.25.32.2001483 , lest online , åpnet 22. november 2020 )
  23. Emma Donada , "  Covid-19: er antall sykluser brukt i Tyskland for RT-PCR-tester lavere enn i Frankrike?"  » , På Liberation.fr ,9. november 2020(åpnet 22. november 2020 )
  24. "  Råd nr. 8: Forbered deg på å forutse at viruset kommer tilbake om høsten, p31 / 42  ", vitenskapelig råd ,27. juli 2020( les online )
  25. (i) Michelle Hennessy , "  Explainer: Why our positive Covid-19 numbers from Irish labs and These from a German lab are Reported separate  "TheJournal.ie (åpnet 19. april 2020 ) .
  26. "  Covid: spyttprøver, når og for hvem?  » , On France 3 Occitanie (åpnet 23. mars 2021 )
  27. (in) Cormac Sheridan , "  Coronavirus og løpet for å distribuere pålitelige diagnoser  " , Nature Biotechnology ,19. februar 2020, d41587–020–00002-2 ( ISSN  1087-0156 og 1546-1696 , DOI  10.1038 / d41587-020-00002-2 , leses online , åpnet 4. mars 2020 ).
  28. "  Covid 19 Ag Respi-Strip  ", nettside ,2020( les online ).
  29. "  Frankrike har bestilt 5 millioner, Belgia bruker dem allerede: fokus på raske tester  ", Industrie-techno ,2020( les online ).
  30. "  Oppdatering av teststrategi, oktober 2020 - bruk av spytt og raske antigentester  " , på side 12: sensitivitet, spesifisitet av antigentester. .
  31. "  Positivt for Covid-19 derfor immune mot sykdommen?" Vi vil forklare deg hvorfor det ikke er så enkelt  ”, Le Soir ,25. mars 2020( les online ).
  32. (in) "  Utvikling av antistofftester for SARS-CoV-2, p1 / 2  " , Lancet ,25. mars 2020( les online ).
  33. "Å  heve innesperring uten strenge tester og isolasjonstiltak ville være ineffektivt, ifølge en Inserm-studie  ", Le Mondes ,12. april 2020( les online ).
  34. "  American Abbott vinner implementeringen av Covid-19 antigentester i Frankrike  ", Usine nouvelle ,30. oktober 2020( les online )
  35. "  Har rask gjennomgang av antigene deteksjonstester for SARS-CoV-2-virus, p 6/42  " , på Has ,8. 20. oktober
  36. Netgen , “  Ytelse av nasopharyngeal smear-PCR for diagnose av Covid-19. Praktiske anbefalinger basert på de første vitenskapelige dataene  ” , om Revue Médicale Suisse (konsultert 3. november 2020 )
  37. APHP, "  antigen trod rapport  " , om APHP ,7. oktober 2020(åpnet 10. desember 2020 )
  38. "  Med sine raske serologiske tester skiller den franske NG Biotech seg ut i løpet av pålitelighet  ", Industrie Techno ,8. april 2020( les online ).
  39. "  Covid-19: hvordan en dobbel teststrategi vil gjøre det mulig å komme ut av inneslutning og gjenopplive økonomien  ", magasinet Santé ,20. april 2020( les online ).
  40. (en) Anna Petherick , “  Developing antody tests for SARS-CoV-2  ” , The Lancet , vol.  395 n o  10230,april 2020, s.  1101–1102 ( DOI  10.1016 / S0140-6736 (20) 30788-1 , leses online , åpnes 3. april 2020 ).
  41. Agency for Quality Living, "  Parvovirus B19, p2 / 18  ", Journal des femmes ,2020( les online ).
  42. (in) "  Raske, mobile tester kommer online for å dempe koronaviruspandemi  " , Nature ,23. mars 2020( les online ).
  43. Zhang, Du, Li og Zheng, “  Molekylær og serologisk undersøkelse av 2019-nCoV-infiserte pasienter: implikasjon av flere kasteveier  ”, Emerging Microbes & Infections , vol.  9, n o  1,1 st januar 2020, s.  386–389 ( PMID  32065057 , DOI  10.1080 / 22221751.2020.1729071 ).
  44. (en) NormileFeb. 27, 2020 og Pm, "  Singapore hevder første bruk av antistofftest for å spore koronavirusinfeksjoner  " , på Science | AAAS ,27. februar 2020(åpnet 2. mars 2020 ) .
  45. (en-US) "  Mobidiag - En komplett løsning for rask diagnostisering av coronavirusinfeksjon (se omtale på slutten av videoen: EIB ga 2 (millioner til Mobidiag i 2019)  " , på Mobidiag (åpnet 3. april 2020 ) .
  46. (no-US) "  Mobidiag - En komplett løsning for rask diagnostikk av coronavirusinfeksjon  " , på Mobidiag (åpnet 3. april 2020 ) .
  47. (in) "  Duke-NUS brukte Covid-19 antistofftester for å passe les link entre kirkeklynger i en verdens første  "NAC (åpnet 2. mars 2020 ) .
  48. (in) "  EUROIMMUN tilbyr nå en full testpakke for direkte påvisning av det nye coronavirus og SARS-CoV antistoffer contre-2  "EUROIMMUNBlog ,12. mars 2020(åpnet 3. april 2020 ) .
  49. "  Coronavirus: race for innovation in rapid diagnostic tests  ", BfmTv ,1 st april 2020( les online ).
  50. "  Video  ", Sciences et Avenir Video ,9. april 2020( les online ).
  51. SciencePost, "  Dogs detect Covid-19 with 94% success rate  " , på sciencepost.fr ,29. juli 2020(åpnet 16. august 2020 ) .
  52. “  CRISPR - Cas12-basert deteksjon av SARS-CoV-2  ”, Nature ,16. april 2020( les online ).
  53. (zh) Bin Xiao , Quan Zhou , Ting Lei og Yongyin He , "  [Anvendelse av laboratoriediagnostiske teknologier for SARS-CoV-2: nåværende fremgang og utsikter]  " , Journal of Southern Medical University , vol.  40, n o  4,30. april 2020, s.  601–605 ( ISSN  1673-4254 , PMID  32895122 , DOI  10.12122 / j.issn.1673-4254.2020.04.24 )
  54. Matthew A Lalli , S Joshua Langmade , Xuhua Chen og Catrina C Fronick , “  Rask og ekstraksjonsfri påvisning av SARS-CoV-2 fra spytt med kolorimetrisk LAMPE  ”, medRxiv ,6. august 2020( PMID  32511508 , PMCID  7273276 , DOI  10.1101 / 2020.05.07.20093542 )
  55. Mayu Nagura-Ikeda , Kazuo Imai , Sakiko Tabata og Kazuyasu Miyoshi , “  Klinisk evaluering av selvoppsamlet spytt ved kvantitativ revers transkripsjon-PCR (RT-qPCR), direkte RT-qPCR, omvendt transkripsjon-sløyfemediert isoterm forsterkning, og en rask antigen-test for å diagnostisere COVID-19  ”, Journal of Clinical Microbiology , vol.  58, n o  9,24. august 2020( ISSN  1098-660X , PMID  32636214 , PMCID  7448663 , DOI  10.1128 / JCM.01438-20 )
  56. (in) "  CT gir best diagnose for Covid-19  " , Science Daily ,26. februar 2020.
  57. SciencePost, "  Dogs detect Covid-19 with 94% success rate  " , på Sciencepost ,29. juli 2020(åpnet 16. august 2020 ) .
  58. "  Gjør denne enkle COVID-19 smakstesten med Dr. Stern  ", YouTube ,25. mars 2020( les online ).
  59. "  Tap av lukt og smak i kombinasjon med andre symptomer er en sterk prediktor for COVID-19-infeksjon  ", MedRxiv ,7. april 2020( les online ).
  60. "  Endringer i lukt eller smak hos mildt symptomatiske polikliniske pasienter med SARS-CoV-2-infeksjon  ", Jama Network ,22. april 2020( les online ).
  61. "  Coronavirus: Kan en kanadisk enhet hjelpe til med å oppdage coronavirus i luften? - YouTube  ” , på www.youtube.com (åpnet 20. desember 2020 )
  62. "  Sveitsisk sensor oppdager koronavirus i luften  " , på www.heidi.news (åpnet 20. desember 2020 )
  63. CEA , "  Det er i utåndingsluften en spesifikk signatur for COVID-infeksjoner hos pasienter  " , på CEA / Espace Presse ,10. desember 2020(åpnet 20. desember 2020 )
  64. Céline Deluzarche , Pustetester for å diagnostisere koronavirus på mindre enn et minutt snart  " , på Futura (åpnet 20. desember 2020 )
  65. “  Nye tall fra Kina tyder på at fire av fem pasienter kan ende opp med å være asymptomatiske, men det er ingenting ennå å generalisere disse resultatene til pandemien.  ", Futura Science ,3. april 2020( les online ).
  66. “  Coronavirus. Nesten 1,6 millioner franskmenn kunne ha blitt smittet  ”, Ouest France ,9. april 2020( les online ).
  67. "  Positiv prediktiv verdi, s 37/41  ", Sannsynlighet og biostatistikk, Upmc ,2020( les online ).
  68. Har, “  Rask gjennomgang av antigene deteksjonstester for SARS-CoV-2-virus, p17 / 42  ”, har ,oktober 2020( les online )
  69. “  Evaluering av screeningprosedyrer, s. 6/11  ”, Univ Tls ,2020( les online ).
  70. (in) Tai Ai & Other, "  Bidrag fra en ny multiplex PCR-test for påvisning av luftveisvirus  " , 40. nasjonalt symposiumbiologssykehus ,26. september 2011( les online ).
  71. (i) "  Nåværende teknikker for diagnostisering av respiratoriske virusinfeksjoner i intensivavdeling, P4 / 10  " , 40. nasjonale konferansen biologer Sykehus ,2007( les online ).
  72. (in) Tai Ai og andre, "  Korrelasjon av CT og RT-PCR-test i brystet i 2019 Coronavirus Disease (Covid-19) i Kina: En rapport om 1014 tilfeller  " , Radiologi ,26. februar 2020( les online ).
  73. (in) Ophir Gozes & Other, "  Coronavirus Detection and Analysis on Chest CT with Deep Learning  " , arXiv ,6. april 2020( les online ).
  74. (in) Ai Tang Xiao , Yi Xin Tong Chun Gao og Li Zhu , "  Dynamisk profil av RT-PCR-funn fra 301 pasienter Covid-19 i Wuhan, Kina: en beskrivende studie  " , Journal of Clinical Virology ,11. april 2020, s.  104346 ( ISSN  1386-6532 , PMCID  PMC7151472 , DOI  10.1016 / j.jcv.2020.104346 , lest online , åpnet 16. april 2020 ).
  75. (i) Lauren M. Kucirka, MD, PhD, Stephen A. Lauer, PhD, Laeyendecker Oliver, PhD, MBA, Denali Boon, PhD, Justin Lessler, PhD, "  Variasjon i falskt negativt Valuta revers transkriptase Polymerase Chain Reaction –Baserte SARS-CoV-2-tester etter tid siden eksponering  ” , på Annals of Internal Medicine , Annals of Internal Medicine ,13. mai 20(åpnet 19. mai 20 ) .
  76. Vingtcinq , “  Variation in False-Negative Rate of Reverse Transcriptase ...  ” , på Bibliovid (åpnet 19. mai 2020 ) .
  77. "  Coronavirus. Grand Est forbereder seg på å kjøpe millioner av tester med tanke på avfinansiering  ”, Ouest France ,9. april 2020( les online ).
  78. (in) "  Basisprotokoll for sanntidsovervåking av aktiv tilfeldig koronavirus sykdom (Covid-19) - Tilpasning av metodikk til veterinær folkehelse  " , Inist ,28. mars 2011( les online ).
  79. "  Coronarivus: mer enn 6000 helsepersonell forurenset siden starten av krisen i Frankrike  ", Lci ,10. april 2020( les online ).
  80. "  Coronavirus: nødanmodning mot sortering av pasienter  ", France Inter ,10. april 2020( les online ).
  81. "  Coronavirus: 600 ansatte fjernarbeid etter en bekreftet sak i Merck i Bas-Rhin  ", Le journal des entreprises ,3. mars 2020( les online ).
  82. (in) "  Test performance, Find  " , Find Fundation ,2020( les online ).
  83. "  Coronavirus: High Authority for Health utsteder en forsiktig mening om serologiske tester  ", Le Monde ,2. mai 2020( les online ).
  84. "  Deteksjon av høy følsomhet av coronavirus SARS-CoV-2 ved bruk av multiplex PCR og en multiplex-PCR-basert metagenomisk metode, p 3/28  ", biorxiv ,19. mars 2020( les online ).
  85. "  Korrelasjon av bryst-CT og RT-PCR-testing ved koronavirus sykdom 2019 (COVID-19) i Kina: En rapport om 1014 tilfeller  ", radiologi ,26. februar 2020( les online ).
  86. "  Positivt for Covid-19 derfor immune mot sykdommen?" Vi vil forklare deg hvorfor det ikke er så enkelt  ”, France Info ,12. april 2020( les online ).
  87. (en) "  I Frankrike ville Covid-19 ha forurenset mindre enn 5% av befolkningen, langt fra kollektiv immunitet  " , Le Monde ,13. mai 2010( les online ).
  88. "  Coronavirus og immunitet: de første potensielle kunder og mange ukjente  ", Le Monde ,28. april 2020( les online ).
  89. "  Coronavirus: Salomon husker bruksanvisningen fra A til Å for å bli testet  ", Le Monde ,19. mai 2020( les online ).
  90. "  Coronavirus:" 10% av befolkningen ville ha immunitet ", sier Olivier Véran på RTL  ", Rtl ,14. april 2020( les online ).
  91. "  Covid-19: er det sant at mer enn 20 000 helsepersonell har blitt smittet i Frankrike?  », Slipp ,10.054 2020( les online ).
  92. "  Coronavirus, sykepleierpersonell  ", Ouest Frankrike ,5. april 2020( les online ).
  93. "  Diagnostiske egenskaper ved biologiske tester, s. 5/6  ", inist ,17. mars 2011( les online ).
  94. "  Regioner spart: hvorfor viruset ikke sirkulerer der mye  ", Nantes Sector West ,30. april 2020( les online ).
  95. “  Virussirkulasjonskort  ” , på solidarites-sante.gouv.fr ,04 0 2020.
  96. "  Utvikling av gjennomsnittlig antall dødsfall per dag fra 1. til 13. april 2020 sammenlignet med gjennomsnittlig antall dødsfall per dag fra 16. til 31. mars 2020 etter avdeling  ", Insee ,30. april 2020( les online ).
  97. "  Sosiale nettverk i kampen mot Covid-19  ", La vie des idées ,21. april 2020( les online ).
  98. Innbyggere ibruker offentlig transport like mye som bilen for å komme til jobb, p3 / 6, fig 4  ", Insee ,30. mars 2020( les online ).
  99. "  Kina / coronavirus epidemien: Offentlig transport avbrutt i Wuhan og Icou  ", AA ,23. januar 2020( les online ).
  100. (in) "  Hvordan Coronavirus sprer seg på offentlig transport. Dette sjokkerende eksperimentet avslører hvor lett det skjer.  " , Le Figaro ,30. mars 2020( les online ).
  101. “  Coronavirus: Nye fakta om infeksjonsmekanismer - NHK Documentary  ”, NHK WORLD-JAPAN ,3. april 2020( les online ).
  102. (in) "  Covid-19: en første serologisk studie i Frankrike og mange leksjoner  " , Pasteur Institute pressemelding ,23. april 2020( les online ).
  103. (in) "  Epidemiologi og overføring av Covid-19 i 1286 og 391 bokser med deres nære kontakter i Shenzhen, Kina: en retrospektiv kohortestudie; p7 / 9 fig3,  " , The Lancet ,27. april 2020( les online ).
  104. (in) "  SARS-CoV-infeksjon hos barn 2: Overføringsdynamikk og kliniske egenskaper,  " , Journal of the Formosan Medical Association ,2. mars 2020( les online ).
  105. (i) "  Epidemiology of Covid-19 blant barn i Kina  " , Pediatrics ,april 2020( les online ).
  106. "  Kawasakis sykdom og koronavirus: symptom, behandling hos barn  ", Journal des femmes ,4. mai 2020( les online ).
  107. (in) "  Nøkkelfunn fra det kinesiske senteret for sykdomskontroll og forebyggingsrapport  " , jamanetwork ,24. februar 2020( les online ).
  108. "  Rutinemessige blodprøver som et potensielt diagnostisk verktøy for COVID-19  ", klinisk kjemi og laboratoriemedisin ,16. april 2020( les online ).
  109. "  Covid-19 av TROD serologiske tester utført på apotek  " , på demarchesadministratives.fr .
  110. "  TDR, TROD eller Autotest serologiske tester for Covid 19  " , på testscovid19.fr ,11. mai 2020(åpnet 27. november 2020 )
  111. "  Coronavirus: raske tester nå tilgjengelig på apotek  " , på Les Echos ,12. juli 2020.
  112. "  Covid-19: hans nesetest gjennomborer hjerneveggen hans, en veldig lav risiko  "
  113. (in) "  Group Testing Covid contre-19  " , Univ Toulouse ,29. mars 2020( les online ).
  114. "Gruppetester  : finne mer med mindre !! COVID 4  ”, YouTube ,27. april 2020( les online ).
  115. (in) "  Tapestry: A Single-Round Smart Pooling Technique for Covid-19 Testing  " , YouTube ,2020( les online ).
  116. (in) "  Asymptomatiske bekymringer: Eksempelpooling brukt i blodbank vil øke kapasitetstesting av coronavirus  " , Scintific Blogging ,29. april 2020( les online ).
  117. "  Coronavirus: ny screeningmetode med samlede tester i Israel  ", Alliance ,22. mars 2020( les online ).
  118. "  møtt med mangel på tester, en løsning: gruppescreening  ", Pour la science ,2020( les online ).
  119. (in) "  Effektiv SARS-CoV-2-testing med høy gjennomstrømning for å oppdage asymptomatiske bærere  " , research gate ,2020( les online ).
  120. "  Er serologiske tester pålitelige?"  », Slipp ,21. april 2010( les online ).
  121. (no-GB) "  Covid-19: Kinas Qingdao skal teste ni millioner på fem dager  " , BBC News ,12. oktober 2020( les online , konsultert 24. oktober 2020 ).
  122. "  Coronavirus på sykehjem: tallene for tragedien som foregår i Paris, Lyon, Nîmes Mougins ...  ", Internett-brukeren ,4. mai 2020( les online ).
  123. (in) "  Analyse og anvendelser av ikke-adaptive og adaptive metoder for gruppetesting Covid-19  " , medrXiv ,5. april 2010( les online ).
  124. "  Polytechnique: Covid-19: Group testing, key for a faster recovery  ", Covid-19: Group testing, key for a faster recovery ,2. april 2020( les online ).
  125. (in) "  Coronavirus: kurven skremmer Japan  " , Les Echos ,15. april 2020( les online ).
  126. (in) "  Implementeringen StopCovid sporer historien om sosiale forhold": sporene til myndighetene for digital sporing av syke  " , Journal the World ,23. april 2020( les online ).
  127. (in) "  StopCovid-prosjektet må forlates  " , Libération ,27. april 2020( les online ).
  128. (i) Dyani Lewis , "  Hvorfor har mange land mislyktes med Covid-kontaktsporing - men noen fikk det riktig  " , Nature , vol.  588, n o  7838,14. desember 2020, s.  384–387 ( DOI  10.1038 / d41586-020-03518-4 , leses online , åpnes 15. desember 2020 )
  129. (i) Giulia Pullano Laura Di Domenico Chiara E. Sabbatini og Eugenio Valdano , "  Underdetection av Covid-19 bokser i Frankrike truer epidemi kontroll  " , Nature ,21. desember 2020, s.  1–9 ( ISSN  1476-4687 , DOI  10.1038 / s41586-020-03095-6 , lest online , åpnet 28. desember 2020 )
  130. (i) Giulia Pullano Laura Di Domenico Chiara E. Sabbatini og Eugenio Valdano , "  Underdetection av Covid-19 bokser i Frankrike truer epidemi kontroll  " , Nature ,21. desember 2020, s.  1–9 ( ISSN  1476-4687 , DOI  10.1038 / s41586-020-03095-6 , lest online , åpnet 29. desember 2020 )
  131. "  Covid-19: hvordan noen pasienter blir superkontaminatorer  " , på lemonde.fr ,15. august 2020.
  132. (in) "  Company That Could wholesensors oppdager Covid-19-partikler i luft  "youtube ,26. august 2020.
  133. "  n ultrahurtigtest for å detektere coronavirus  " , på Futura-vitenskap ,15. september 2020.
  134. (in) "  Tidlig oppdagelse av superspredere ved massegruppeprøvebasseng kan redusere Covid 19-pandemi  " , medrxiv ,2020( les online ).
  135. "  Lavere deteksjonsterskelen for RT-PCR-tester for Covid-19 for å bedre detektere smittsom individer  ", Industry og Techno ,15. september 2020( les online )
  136. (in) "  Detekterbart serum alvorlig akutt respiratorisk syndrom Coronavirus 2 Viral belastning (RNAemia) er nært korrelert med drastisk forhøyet Interleukin 6-nivå hos kritisk syke pasienter med 2019 Coronavirus sykdom  " , IDSA ,17. april 2020( les online )
  137. (i) David W. Denning , Anthony Kilcoyne og Cemal Ucer , "  Ikke-smittsom status Indisert av påvisbart IgG-antistoff mot SARS-CoV-2  " , British Dental Journal , vol.  229, n o  8,oktober 2020, s.  521-524 ( ISSN  1476-5373 , DOI  10.1038 / s41415-020-2228-9 , lest online , åpnet 28. november 2020 )
  138. "  7 trinn for å identifisere risikable COVID-19 situasjoner  " , om medisin fra Nebraska
  139. Journal des femmes, "  Ofre for Covid-19 i Frankrike: profil, alder, kvinner / menn  " .
  140. "  Undersøkelse. Koronavirus. Hvorfor har sykepleiesykepleiere blitt så forurenset i Hauts-de-France?  » , On France 3 Hauts-de-France (konsultert 23. oktober 2020 ) .
  141. "  Covid-19: Hvorfor nye tester kan endre alt?"  » , På fr.news.yahoo.com (åpnet 24. oktober 2020 ) .
  142. (in) "  Sammenligning av Droplet Digital PCR til Real-Time PCR for Quantitative Detection of Cytomegaloviruss  " , NCBI ,5. februar 2013( les online ).
  143. (in) "  ddPCR et mer følsomt og nøyaktig verktøy for SARS-CoV-22 påvisning i prøver med lav viral belastning  " , medrxiv ,2020( les online ).
  144. (in) "  Bio-Rad Laboratories ddPCR Nøyaktighet viser fordeler i Covid-19 påvisningsstudier  " , medrxiv ,29. mars 2020( les online ).
  145. (in) "  Hvorfor gå digital i PCR? 8min / 40  ” , Youtube ,15. februar 2026( les online ).
  146. (i) "  En Massively Parallell Covid-19 diagnostisk analyse for samtidig testing av 19200 pasientprøver  " , Pennsylvania State University ,2020( les online ).
  147. (in) "  Coronavirus SARS-CoV-2: poolage RT-PCR tests  " , High Council of Public Health ,2020( les online ).
  148. (in) "  Forebygging av interessekonflikter i helsekompetanse, s. 34/91  ” , Revisionsretten ,2016( les online ).
  149. (en-US) David M. Halbfinger , "  For Coronavirus Quick Testing, Israel Turns to a Smart Algorithm  " , The New York Times ,21. august 2020( ISSN  0362-4331 , les online , konsultert 28. september 2020 ).
  150. (in) Youtube, "  Kina massetesting  " .
  151. (i) Dr. Carmen Wiley, "  Vil" Pooled Testing "fungere i Amerika?  » , På Youtube .
  152. "  COVID-19, Ukentlig epidemiologisk punkt 14. mai 2020, fig 4 p5 / 32  ", Folkehelse Frankrike ,2020( les online ).
  153. "  Coronavirus: halvparten av Marseille skoleansvarlige screenet, ingen positive tilfeller  ", Le Figaro ,2020( les online ).
  154. "  Tester: Frister for resultater eksploderer  " (åpnet 25. september 2020 ) .
  155. "  Médiapart - Screening tester: kostbare forsinkelser for Social Security, en blomstrende virksomhet for produsenter  ", MediaPart ,oktober 2020( les online ).
  156. "  Hvorfor vente på en PCR test varierer fra land til land - YouTube  " , på www.youtube.com (åpnes 2 november 2020 ) .
  157. "  Covid-19 screeningtest: leger beklager for lange forsinkelser - YouTube  " , på www.youtube.com (åpnet 2. november 2020 ) .
  158. Cécile Thibert , "  Covid-19 screening: laboratorier overveldet av en eksploderende etterspørsel  " , på Le Figaro.fr ,4. september 2020(åpnet 3. november 2020 )
  159. "  Deconfinement: Sporing" brigader", det beste våpenet i ansiktet av coronavirus?  ", HuffingtonPost ,1 st juni 2020( les online ).
  160. "  COVID 8 superkontaminatorer  " , på Youtube , Youtube ,1 st juni 2020.
  161. Le Figaro , "  Coronavirus: fire døde og hundre smittet etter en konsert i Amsterdam  " , på Le Figaro.fr ,12. mai 2020(tilgjengelig på en st juni 2020 ) .
  162. "  Deconfinement:" Massive screening ved den minste symptom "advarer presidenten i Scientific Council  ", Le Parisien ,19. april 2020( les online ).
  163. "  Regjeringen nekter bedrifter omfattende screening for Covid-19  ", Le Monde ,5. mai 2020( les online ).
  164. "  Coronavirus: Renault-anlegget i Sandouville tvunget av rettferdighet til å stenge  ", Le Parisien ,7. mai 2020( les online ).
  165. "  Covid-19 koronavirus screeningtest: hvem, hvor og hvordan?"  », Santemagazine ,2020( les online ).
  166. "  " Kontakt Covid ": stoppe kjeder av overføring av viruset for å stoppe epidemien  ", Ameli ,6. mai 2020( les online ).
  167. "  Coronavirus: mangel på tester hindrer forebyggende screening på sykehjem  ", Le Monde ,4. mai 2020( les online ).
  168. "  E COVID-19: The coronavirus fortsatt sirkulerer, er det nødvendig å teste mye mer utbredt  ", Le Monde ,26. mai 2020( les online ).
  169. "  Olivier Véran beskriver strategien for å unngå en ny bølge  ", Le Monde.fr ,25. juni 2020( les online , konsultert 25. juni 2020 ).
  170. (in) "  Nøyaktige konfidensgrenser for utbredelse av en sykdom med en ufullkommen diagnostisk test p3 / 5  " , Epidemiologi og infeksjon ,3. mars 2010( les online ).
  171. (in) "  Rapport: Grenser og forsinkelser i estimert antall avl  " , Modeling Group Team SOMMER ,7. april 2020( les online ).
  172. (in) "  Implementering av tiltak for å begrense overføring av mennesker (barrierer)  " , Helsedepartementets influensaplan ,0 2011( les online ).
  173. (i) Emmi Laine, "  Kina lager over 1,7 millioner Covid-19 testsett per dag, offisielt sier  " , Yicai Global,25. februar 2020.
  174. Stéphanie Marin, "  En rask og bærbar screeningtest godkjent av Health Canada  " , på La Presse , The Canadian Press ,13. april 2020(åpnet 13. april 2020 ) .
  175. "  Algerie lanserer sin produksjon av screening-sett: en første i Maghreb  " , på www.beurfm.net .
  176. "  2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV) Situation Summary  " [ arkiv av26. januar 2020] , om sentre for sykdomskontroll og forebygging ,30. januar 2020(åpnet 30. januar 2020 ) .
  177. "  Real-Time RT-PCR Panel for Detection 2019-nCoV  " [ arkiv av30. januar 2020] , om sentre for sykdomskontroll og forebygging ,29. januar 2020(tilgjengelig på en st februar 2020 ) .
  178. "  Curetis Group Company Ares Genetics and BGI Group Collaborate to Offer Next-Generation Sequencing and PCR-based Coronavirus (2019-nCoV) Testing in Europe  " [ arkiv du31. januar 2020] , på GlobeNewswire News Room ,30. januar 2020(tilgjengelig på en st februar 2020 ) .
  179. (in) "  In Age of Covid-19 Hong Kong Innovates To Test And Thousands Quarantine  "NPR.org .
  180. (in) "  NHS bunker hjemmetesting for koronavirus  "MobiHealthNews ,24. februar 2020.
  181. Laurent Le Goff, “  Coronavirus. I Rennes, fire timer på å oppdage (eller ikke) viruset  ” , på Ouest-France.fr ,28. februar 2020.
  182. "  Le journal de 13h Replay en Streaming - TF1  " , på MYTF1 .
  183. "  Inkubasjon, smittsomhet, dødelighet ... Ordene som teller for å beskrive Covid-19 coronavirus  " , på Sciences et Avenir .
  184. (en) "  Potensiell innvirkning av sesongmessig tvang var SARS-CoV-2 pandemi, p6 / 8  " , NA ,2020( les online ).
  185. (i) Aria Bendix, "  En person kan bære og overføre Covid-19 uten å vise symptomer, bekrefter forskere  "ScienceAlert .
  186. "  Disse 4 tilfellene av coronavirus som utfordrer forskere  " , på The HuffPost ,28. februar 2020.
  187. (in) "  MedRixv: Estimater av forholdet mellom asymptomatiske nye coronavirusinfeksjoner (Covid-19)  " .
  188. (in) "  Er barn faktisk ess sannsynlig" for å få Covid-19 som voksne?  " , MedicalNewsToday ,2020( les online ).
  189. "  Arnaud L'Huillier:" Barn ser ikke ut til å være motorene i spredningen av viruset "  ", Le temps ,13. mars 2020( les online ).
  190. (in) "  En matematisk modell for estimering av den aldersspesifikke overførbarheten til et nytt coronavirus 4, p 13/31  " , NA ,2020, s.  31 ( les online ).
  191. (in) "  surveillance-containment searching  " , M Library Online Exhibits ,19. mars 2020( les online ).
  192. "  WHO etterlyser økt testing for coronavirus  ", M Library Online Exhibits ,17. mars 2020( les online ).
  193. "  Coronavirus screeningtester: hvordan fungerer de i Frankrike?  » , På lci.fr ,6. mars 2020.
  194. "  Coronavirus, analyse av epidemidata over hele verden: diagnose må være prioritert  ", YouTube ,17. mars 2020( les online ).
  195. (in) "  Hva er det beste materialet for å lage DIY-masker?  " , SmartAir ,8. mars 2020( les online ).
  196. (in) "  Hvordan lage din egen beste mikrofiber ansiktsmaske med filter og berøringsavstand på 90 sekunder  " , Youtube ,16. mars 2020( les online ).
  197. (in) "  N95 Respirator Filtering Facemask Ultraviolet Germicidal Irradiation (UVGI) Process for Decontamination and Reuse  " , Nebraskamed ,2020( les online ).
  198. "  Expert mening om strategien for å bygge opp et lager av medisinske mottiltak i ansiktet av en influensapandemi, s. 7/55  ”, SantePubliquefrance ,Mai 2019( les online ).
  199. "  Coronavirus: I Kina vokser maskefabrikker som sopp  ", LeParisient ,27. mars 2020( les online ).
  200. "  Masker  ", seenthis ,26. mars 2020( les online ).
  201. "  Screening av Covid-19: hva er disse reagensene vi mangler?"  », Slipp ,26. mars 2020( les online ).
  202. "  Italia: dykkermasker forvandlet til respiratorer  ", Liberation ,24. mars 2020( les online ).
  203. Béligh Nabli, “Ta av  deg maskene!  », Slipp ,19. mars 2020( les online ).
  204. Dupont Aignan, "  Coronavirus: intervensjon av Nicolas Dupont-Aignan på nasjonalforsamlingen  ", YouTube ,19. mars 2020( les online ).
  205. "  Coronavirus: 10 eldre mennesker begrenset til Thise sykehjem  " , på macommune.info .
  206. "  Covid-19: elleve døde på et sykehjem i Doubs  ", Liberation ,19. mars 2020( les online ).
  207. "  Liberation 03/27/20: 241 sykehjem av 600 rammet av Covid 19  ", Liberation ,27. mars 2020( les online ).
  208. "  Coronavirus: hvorfor dødsfall på sykehjem ikke telles i balansen  ", BfmTv ,2. mars 2020( les online ).
  209. "  COVID-19: Inkubasjonsperiode, siste data  ", SantéLog ,25. mars 2020( les online ).
  210. "  Mangel på masker: et ansvar for statens skyld?  », Advokatklubben ,24. mars 2020( les online ).
  211. "  Mangel på masker: Mangel på masker: et ansvar som deles av påfølgende regjeringer  ", det offentlige senatet ,23. mars 2020( les online ).
  212. "  Sykehjemmene i frykt for massakren  ", Befrielse ,24. mars 2020( les online ).
  213. "  Forsiktighetsprinsippet før konstitusjonelle råd  ," konstitusjonelle råd ,25. november 2014( les online ).
  214. "  INRS Occupational Health and Safety: Under hvilke omstendigheter kan ansatte utøve sin angrerett?  », Inrs ,2020( les online ).
  215. "  Kjole: Ansatte og rekrutteringsvansker på sykehjem  ", Kjole ,2018( les online ).
  216. "  Lcl må sortere, sortere, sortere ... permanent": hvorfor Frankrike sliter med å multiplisere testene for Covid-19  ", LCI ,27. mars 2020( les online ).
  217. "  Tilgang til intensivomsorg: har offisielle instruksjoner blitt gitt for sykehjemsbeboere?  », Slipp ,29. mars 2020( les online ).
  218. "  Coronavirus: alarmrop fra sykehjem , 100.000 fryktede dødsfall  ", LePoint ,21. mars 2020( les online ).
  219. (in) "  Nåværende Covid-19 testdekningsestimater  "ourworldindata.org Global Change Data Lab13. mars 2020.
  220. "  Journal France 2, 7min  ", Youtube ,6. mars 2020( les online ).
  221. (in) "  Clinical Characteristics of Coronavirus Disease in 2019 in China  "New England Journal of Medicine .
  222. "  Coronavirus: 18:00 oppdatering på Covid-19, onsdag 18. mars  ", ScienceEtAvenir ,18. mars 2020( les online ).
  223. (in) "  WHO Mortality Estimated Covid-19 til 3.4%. That Don't Tell the Whole Story  ” , på tid .
  224. (in) "  2019-Ncov: foreløpige estimater av bekreftet tilfelle dødsfall og infeksjonsdødelighetsforhold, og innledende pandemirisikovurdering  "institutefordiseasemodeling.github.io .
  225. "  Hvorfor er Italia så påvirket av coronavirus?"  » , På HuffPost ,9. mars 2020.
  226. "  Hvorfor tallene for antall Cornaviruses er falske i Frankrike  ", Altissima ,19. mars 2020( les online ).
  227. "  Coronavirus-tester vil være flere i Frankrike  ", YahooNews ,24. mars 2020( les online ).
  228. “  Dekodere: Øver Frankrike nok tester?  ", Le Monde ,20. mars 2020( les online ).
  229. "  Coronavirus: hvorfor er dødsraten så lav i Tyskland?"  », FranceInfo ,mars 2020( les online ).
  230. "  Covid-19: den umulige beregningen av dødsraten  ", FranceCulture ,19. mars 2020( les online ).
  231. "  I Marseille, leger og forskere" på krigsfot "i møte med coronavirus  ", Le Point ,26. februar 2020( les online ).
  232. "  Dekret av 7/3/20  " , på Légifrance ,7. mars 2020.
  233. "  Covid-19: kan vi nå testes i bylaboratorier?  » , On CheckNews , Liberation ,11. mars 2020.
  234. "  Covid-19 test i byen: mangel på masker, laboratorier nekter å teste pasienter  ", Pharmacies Monitor ,11. mars 2020( les online ).
  235. "  vrede av en genetiker som ikke kunne utføre tester for coronavirus  ", YahooNews ,25. mars 2020( les online ).
  236. "  Lombard helsevesen er et offer for sin fortreffelighet  ", Liberation ,22. mars 2020( les online ).
  237. (in) "  Praktiske erfaringer og forslag på den ørnøyede klokken, en roman lovende rolle for å kontrollere nosokomiell infeksjon av utbruddet Covid-19  " , journalofhospitalinfection ,februar 2020( les online ).
  238. (in) "  Maskiner for ultrafiolett lys kjemper mot Coronavirus: Slik gjør du det  " , youtube ,18. mars 2020( les online ).
  239. "  Coronavirus: hva om Sør-Korea hadde funnet den rette strategien?"  », Frankrike syktyre ,12. mars 2020( les online ).
  240. "  Stilt overfor coronavirus, burde Frankrike være inspirert av Sør-Korea?  ", Huffingtonpost ,13. mars 2020( les online ).
  241. (in) "  Big data against big viruses: applications stalk people in quarantine  " , Rfi ,9. mars 2020( les online ).
  242. "  WHO etterlyser testing av alle mistenkte tilfeller  ", 7sur7 ,16. mars 2020( les online ).
  243. "  Eksklusivt. Hvordan Frankrike frarøver seg 150.000 til 300.000 tester per uke  ”, Le Point ,3. april 2020( les online ).
  244. "  Midt i en epidemi nekter staten hjelp fra et veterinærlaboratorium for Covid-19-tester  ", Sputniknews ,27. mars 2020( les online ).
  245. "  Coronavirus-tester: hvordan fungerer det i utlandet?"  ", The Parisian ,18. mars 2020( les online ).
  246. "  COVID-19: massescreening, Sør-Koreas vinnende oppskrift  ", Radio Canada ,18. mars 2020( les online ).
  247. "  Inneholder coronavirus uten inneslutning, Sør-Korea gjorde det  ", huffingtonpost ,19. mars 2020( les online ).
  248. "  The Afnor lanserer en webplattform for å tilby eller finne masker  ", Fashion Network ,10. april 2020( les online ).
  249. "  Stilt overfor coronavirus er det bare fire europeiske land, inkludert Frankrike, som er i stand til å produsere et stort antall masker  ", Usine nouvelle ,16. mars 2020( les online ).
  250. "  Massiv screening vil være nødvendig etter innesperring, ifølge presidenten for det vitenskapelige rådet  ", Liberation ,20. mars 2020( les online ).
  251. "  Coronavirus. Er Italia eksemplet på hva som venter Frankrike?  », Vest-Frankrike ,12. mars 2020( les online ).
  252. "  Coronavirus: følger virkelig kurven i Frankrike den i Italia med ni dager for sent?"  », Slipp ,12. mars 2020( les online ).
  253. "  Coronavirus: følger Frankrike den samme banen som Italia?  », BFM TV Santé ,12. mars 2020( les online ).
  254. "  Utviklingen av dødsfall i Frankrike og Italia  ", frigjøring ,27. mars 2020( les online ).
  255. (no) "  Coronavirus-dødsfall i Italia, Spania og Us øker raskere enn de gjorde i Kina (Grafikk)  " , FinancialTimes ,2020( les online ).
  256. Johnson planlegger å øke koronavirustester til 25 000 om dagen , The Guardian, 03-18-2020.
  257. Kjendiser får virustester, reiser bekymringer for ulikhet , nytimes.com, 03-19-2020.
  258. (in) Peter Sullivan, "  Birx: USA HAR gjort mer testing på 8 dager enn 8 uker i Sør-Korea  " , The Hill ,24. mars 2020.
  259. "  Frankrike tester befolkningen mye mindre enn andre land  " , på bfmtv.com .
  260. "  Tyskland utfører 500 000 tester per uke  " , på bfmtv.com .
  261. (in) "  Coronavirus Update (Live): 2,333,240 Cases and Deaths from 160,818 Covid-19 Virus Pandemic - Worldometer  "www.worldometers.info (åpnet 19. april 2020 ) .
  262. (in) "for  å forstå den globale pandemien, trenger vi omfattende testing - Our World in Data Covid-19 Testing dataset  " , ourworldindata ,9. april 2020( les online ).
  263. (i) Max Roser , Hannah Ritchie , Esteban Ortiz-Ospina og Joe Hasell , "  Disease coronavirus (Covid-19) - Statistics and Research  " , Our World in Data ,4. mars 2020( les online , konsultert 19. april 2020 ).
  264. "  Japan mot epidemien  ", bøker og ideer ,17. april 2020( les online ).
  265. “  Ansiktsmasker mot COVID-19: En evidensgjennomgang, Fig1  ”, fortrykk ,12. april 2020( les online ).
  266. "  Hvorfor bruker så mange japanere sanitære masker?"  ", Nippon.com ,24. januar 2016( les online ).

Bibliografi

  • (no) Parham Habibzadeh, Mohammad Mofatteh, Mohammad Silawi, Saeid Ghavami og Mohammad Faghihi, "  Molecular diagnostic assays for COVID-19: an overview  " , Critical Reviews in Clinical Laboratory Sciences ,17. februar 2021( les online ).

Se også

Relaterte artikler

Eksterne linker


<img src="https://fr.wikipedia.org/wiki/Special:CentralAutoLogin/start?type=1x1" alt="" title="" width="1" height="1" style="border: none; position: absolute;">