De Great Lakes vassdrag danne et system av kanaler som gjør navigering gjennom store sjøene i Nord-Amerika. De viktigste anleggsarbeidene på disse rutene er Welland Canal , som tillater forbikjøring av Niagara Falls mellom Lake Ontario og Lake Erie , og Sault Locks mellom Lake Superior og St. Mary's River . Kanaler tillater navigering på St. Clair River og Detroit River mellom Lake Huron og Lake Erie. En isbryter for den amerikanske kystvakten opprettholder den klareste luftdyktighetsvinteren mens du navigerer kontinuerlig i 2 til 3 måneder hvert år.
The Great Lakes vannveier blir supplert med St. Lawrence Seaway som tillater navigering på St. Lawrence River fra Montreal til Kingston i Ontario. Siden Great Lakes vannveier er dypere og har større låser enn St. Lawrence Seaway, er noen båter begrenset til de store innsjøene fordi de er for store til å passere St. Lawrence Seaway og ut til havet.
Great Lakes vannveier administreres samtidig av Canada og USA .