Apolipoprotein D (ApoD) er et protein som finnes på overflaten av lipoproteiner med høy tetthet (HDL), som transporterer kolesterol til leveren. Lipoproteiner er faktisk komplekser som er ansvarlige for transport av kolesterol i blodet og består av lipider og proteiner. Proteinkomponentene finnes på overflaten av komplekset: apolipoproteiner, som varierer avhengig av typen lipoprotein ( HDL , LDL , VLDL etc.).
I likhet med andre apolipoproteiner deltar ApoD i transport av hydrofobe molekyler . Dens struktur er likevel forskjellig fra andre apolipoproteiner: den ligner heller på lipocaliner , en familie av proteiner som har en rolle i transporten av små hydrofobe molekyler. ApoD kan dermed binde flere molekyler, da kalt ligander , som kolesterol, progesteron , pregnenolon , bilirubin og arakidonsyre .
Det er overuttrykt i flere nevrodegenerative sykdommer som Alzheimers sykdom, Niemann-Pick sykdom , meningoencefalitt, Guillain-Barré syndrom, så vel som hos pasienter med demens , schizofreni eller har hatt en ulykke. Cerebrovaskulær.
ApoD er et protein som består av en kjede på 189 aminosyrer . Denne primære strukturen tilsvarer den for andre apolipoproteiner. Imidlertid ligner den tredimensjonale tertiære strukturen den til lipokaliner. Faktisk har den en sylindrisk form som kalles en beta-fat , hvor den ene enden er lukket. Den andre siden, åpen, presenterer bindingsstedene til de hydrofobe molekylene som den transporterer. Molekylvekten til ApoD er estimert til 29 kilo Dalton (kDa), men kan variere avhengig av glykosyleringen. ApoD er virkelig et glykoprotein, det vil si at et karbohydrat (sukker) har blitt tilsatt sin primære struktur under produksjonen av proteinet. Glykosylering representerer således omtrent 18% av massen av ApoD.
Genet som koder for ApoD er lokalisert på kromosom 3 hos mennesker og på kromosom 6 hos mus. Den gen -promoteren reguleres ved hjelp av steroidhormoner slik som androgener , østrogen og glukokortikoider , i tillegg til å bli påvirket av hastigheten av celleproliferasjon. Det har faktisk blitt vist at ApoD ble overuttrykket i senescent eller ikke-proliferative celler.
I motsetning til andre apolipoproteiner som uttrykkes i leveren og tarmene, er ApoD generelt bare svakt uttrykt i disse vevene. I tillegg varierer uttrykket av ApoD avhengig av arten. Dermed hos mennesker, aper og kaniner finner vi signifikant uttrykk for ApoD i hjernen, binyrene, nyrene, bukspyttkjertelen, morkaken, milten, lungene, eggstokkene, testiklene og perifere nerver. I motsetning til dette, hos mus og rotter, uttrykkes ApoD hovedsakelig i sentralnervesystemet, dvs. i ryggmargen, lillehjernen og hjernen.
Kronologisk ble apolipoprotein D først identifisert som en forbindelse av HDL og deretter analysert i cystisk brystvæske (brystkreft). Proteinet ble deretter kalt GCDFP-24 og karakteriseringen av det viste at det binder progesteron med høy affinitet, så vel som pregnenolon , noe som vil gi det en rolle i transporten av disse hormonene i melkekjertlene. Første karakterisering, ApoD ble ansett å være være en forbindelse av HDL: den ble tilskrevet en rolle som transporterer kolesterol, fra perifert vev til leveren.
I tillegg ser det ut til at ApoD har en rolle i regenereringen av skadede nerver, og at det ville være en tumorundertrykker i visse kreftformer som bryst eller spiserør.