I anatomi er et apparat et sett med organer hvis funksjon bidrar til en felles kompleks oppgave.
Vi skiller oppfatningen av apparatet fra den i system : et apparat består av veldefinerte organer, mens systemet kan bestå av dårlig definerte og diffuse strukturer i hele kroppen (slik som de nerver i nervesystemet , som er uadskillelig fra organene, eller de mobile cellene i immunforsvaret ).