En tverreligiøs dialog mellom den ortodokse kirken og islam har eksistert siden slutten av 1980-tallet med sikte på å forbedre deres forhold.
Denne dialogen gjennomføres spesielt gjennom internasjonale akademiske møter organisert i samarbeid mellom på den ene siden Royal Academy for Research of Islamic Civilization of Amman i Jordan (fra 1986 til 1998) og deretter Kongeriket Bahrain (siden 2001) og derimot, det ortodokse senteret for det økumeniske patriarkatet i Chambésy, deretter kontoret for interreligiøse og interkulturelle anliggender for det økumeniske patriarkatet (siden 2001).