Molekylær geometri

Den molekylære geometri eller molekylære struktur refererer til arrangementet 3d av atomer i et molekyl . Den bestemmer flere egenskaper til et stoff, inkludert dets reaktivitet , polaritet , fase , farge , magnetisme og biologiske aktivitet .

Besluttsomhet

Molekylær geometri kan etableres ved hjelp av en rekke verktøy, inkludert spektroskopi og diffraksjon . Spektroskopi IR , rotasjon og Raman kan gi informasjon om geometrien til et molekyl gjennom vibrasjons- og rotasjonsabsorbansen. X -ray , nøytron og elektron diffractometry kan gi informasjon om krystallinske faste stoffer . Den elektrondiffraksjon gass kan benyttes for små molekyler i gassform. Den NMR og FRET kan anvendes for å oppnå annen informasjon, slik relativ avstand, dihédraux vinkler, vinkler og tilkobling. Molekylenes geometri er lettere å oppnå når de har lav temperatur. De største molekylene eksisterer ofte i flere stabile geometriske former ( konformitet ). Geometriene kan også beregnes med stor presisjon ved ab initio-metoden for kvantekjemi . Molekylgeometrien kan også være forskjellig avhengig av fasen i molekylet.

Geometrien til et molekyl avhenger av antall atom (er) eller "ikke-bindende dublett" festet til det sentrale atomet i molekylet. Perifere atomer som gjennomgår elektronisk frastøting, som tvinger dem til å frastøte hverandre, vil posisjonere seg så langt som mulig fra hverandre. Det er fem geometrier, avhengig av antall "komponenter" (atom (er) og ikke-bindende dubletter) av molekylet som er bundet til det sentrale atomet:

• 1 komponent: posisjonering ikke bestemt fordi ingen frastøting mellom de perifere atomer;
• 2 komponenter: lineær posisjonering i en vinkel på 180 ° mellom de perifere atomer hvis molekylet er ikke-polært eller i en bøyning i en vinkel på 120 ° mellom de perifere atomer hvis molekylet er polarisert;
• 3 komponenter: lineær posisjonering i en vinkel på 120 ° mellom perifere atomer;
• 4 komponenter: pyramideplassering i en vinkel på 109 ° mellom perifere atomer. Posisjonering kalt "tetraeder";
• 5 komponenter: diamantposisjonering (dobbel pyramideformet med trekantet base) i en vinkel på 120 ° ekvatorielt og 90 ° aksialt, mellom de perifere atomer;
• 6 komponenter: oktaeder plassering i en vinkel på 90 ° mellom perifere atomer.

Merknader og referanser

• (fr) Denne artikkelen er delvis eller helt hentet fra Wikipedia-artikkelen på engelsk med tittelen "  Molecular geometry  " ( se listen over forfattere ) .

1. (i) John E. McMurry , organisk kjemi , Belmont, Wadsworth, 1992, 3 e  ed. ( ISBN  0-534-16218-5 )
2. (in) F. Albert Cotton , Geoffrey Wilkinson , Carlos A. Murillo og Manfred Bochmann , Advanced Inorganic Chemistry , New York, Wiley-Interscience,1999, 6 th  ed. , 1355  s. ( ISBN  0-471-19957-5 )
3. FRET beskrivelse
4. (in) "  Nylige fremskritt innen FRET: avstandsbestemmelse i komplekst protein-DNA  " , Current Opinion in Structural Biology , 2001, vol.  11, utgave 2, s.  201-207 , DOI : 10.1016 / S0959-440X (00) 00190-1
5. Innføring av FRET-bildebehandling
6. (no) Få takvinkler fra 3 J koblingskonstant , på jonathanpmiller.com
7. www.spectroscopynow.com/FCKeditor/UserFiles/File/specNOW/HTML%20files/General_Karplus_Calculator.htm , Nok en Javascript-lignende NMR-koblingskonstant til dihedral

Vedlegg

Relaterte artikler

• VSEPR teori
• Representasjon av Cram

Eksterne linker

• (in) Opplæring i molekylær geometri og polaritet
• (fr) [1]