In silico (hvis bokstavelig oversettelse til fransk er på silika ) er en latininspirert neologisme som angir en forskning eller et essay utført ved hjelp av komplekse datastyrte beregninger eller datamodeller .
Dette uttrykket brukes hovedsakelig innen genomikk og bioinformatikk .
Uttrykket er en neologisme (den ble ikke brukt på latin) som ville blitt oppfunnet i 1989 , analogt med de latinske uttrykkene in vivo (på fransk "in life"), in vitro ("in test tube"), in utero (bokstavelig talt "i livmoren") eller in situ ("på stedet") ofte brukt til å beskrive hvordan man utfører et eksperiment som involverer en eller flere levende organismer; det refererer til silisium , en viktig komponent i transistorer som brukes i datamaskiner .
I følge G. Gallezot (forsker ved GRESI, Research Group on Information Services); ifølge "et søk på titler og sammendrag av artiklene det er referert til i PubMed " , ville det ha blitt brukt i den vitenskapelige litteraturen for første gang i 1991 , av danske mikrobiologer i en gjennomgang av Institut Pasteur . Den ble deretter brukt i tre andre artikler i 1993, og deretter ble bruken utbredt fra 1996 .
Fordi i silico- forskning produserer og prekvalifiserer potensielle medikamenter, har den makten til å akselerere funnhastigheten og redusere behovet for dyre laboratorieeksperimenter eller kliniske studier. I 2010 brukte for eksempel forskere en algoritme for å finne, i silico , mulige hemmere av et enzym knyttet til kreftaktivitet, hvorav 50% senere viste seg å være sanne hemmere i laboratoriet. Denne tilnærmingen skiller seg fra den for screeninglaboratorier med høyt gjennomstrømning der tusenvis av forbindelser blir fysisk testet hver dag med lavere suksessrate.
Det har vært anstrengelser for å etablere datamodeller for mobil oppførsel.
For eksempel utviklet forskere i kampen mot tuberkulose i 2007 en in silico- modell av denne sykdommen, som gjør det mulig å simulere utviklingen av visse fakta på få minutter i stedet for en periode på måneder. Imidlertid representerer dette arbeidet ikke en helt presis modell for oppførselen til hele cellen. Begrensninger i vår forståelse av molekylær dynamikk og cellebiologi, i tillegg til mangel på beregningskapasitet, fører til forenkling av antagelser som begrenser bruken av strøm i silico- modeller.
Digital genetisk sekvensering kan lagres i en database , studeres, digitalt modifiseres og brukes som mal for opprettelsen av "nytt DNA" gjennom syntesen av "kunstige gener".
In silico er mye brukt i bioinformatikk , for eksempel for å søke etter gener som kan gjøres i silico via gendeteksjonsprogrammer, deretter in situ for å eksperimentelt validere spådommer gjort av datamaskiner.