Nasjonalt senter for bioteknologisk informasjon

Nasjonalt senter for bioteknologisk informasjon NCBI-logoen fremkaller DNA- dobbeltspiralen . Bilde i infoboks. Historie
Fundament 4. november 1988
Ramme
Forkortelse (en)  NCBI
Type Forskningsinstitutt , biologisk database , databibliotek
Sete Bethesda
Land  forente stater
Kontaktinformasjon 38 ° 59 '45' N, 77 ° 05 '56' V
Organisasjon
Foreldreorganisasjon United States National Library of Medicine
Nettsted (no)  www.ncbi.nlm.nih.gov

The National Center for Biotechnology Information ( NCBI ), på fransk "  American Center for Bioteknologisk Information  ", er en amerikansk nasjonalt institutt for molekylær biologisk informasjon .

Denne organisasjonen, som ble grunnlagt i 1988 og ligger i Bethesda i Maryland , er en del av US Library of Medicine , et av US Institutes of Health .

Oppdrag

NCBI forsker i beregningsbiologi, utvikler programvare for å analysere genomdata og gi biomedisinsk informasjon.

NCBI er ikke en database, men den utvikler også offentlige databaser som:

Det er på en måte det amerikanske motstykket til European Institute of Bioinformatics (EBI).

NCBI tilbud og inneholder en NCBI taksonomi database som er omtrentlig. NCBI-nettstedet spesifiserer at denne databasen ikke er en pålitelig kilde for nomenklatur eller klassifisering, og at man bør konsultere relevant vitenskapelig litteratur for å få den mest pålitelige informasjonen. NCBI-taksonomien representerer omtrent 10% av levende arter på planeten. Denne taksonomien er en kuratert klassifisering og foreslås som en organisert nomenklatur for sekvenser av organismer i offentlige databaser. TaxID (unik identifikator i NCBI-taksonomien) fungerer som en lenke mellom de tre databasene i International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC, "International Collaboration in Nucleotide Sequence Databases ") som DNA- databanken i Japan er medlem av. ( DDBJ), NCBI (USA) og European Institute of Bioinformatics (EMBL-EBI, Europe).

Merknader og referanser

  1. (in) Ansvarsfraskrivelse: NCBI-taksonomidatabasen er ikke en autoritativ kilde for nomenklatur eller klassifisering - vennligst se relevant vitenskapelig litteratur for å få den mest pålitelige informasjonen.  » (Se bunntekst på dette forskningseksemplet .)
  2. "  Hjem - taksonomi - NCBI  " , på www.ncbi.nlm.nih.gov (åpnet 30. august 2017 )
  3. (in) Scott Federhen Karen Clark , Tanya Barrett og Helen Parkinson , "  Mot rikere metadata for mikrobielle sekvenser: Erstatter belastningsnivå NCBI taksonomitaksider med Bioproject, BioSample records and Assembly  " , Standards in Genomic Sciences , vol.  9, n o  3,15. juni 2014, s.  1275 ( ISSN  1944-3277 , DOI  10.4056 / sigs.4851102 , lest online , åpnet 30. august 2017 )
  4. (in) "  Internasjonal nukleotidsekvensdatabasesamarbeid | INSDC  ” , på www.insdc.org (åpnet 30. august 2017 )

Se også

Relaterte artikler

  • Gå inn , NCBI Global Cross-Database Search System.
  • BLAST , en NCBI-programvare, som muliggjør sammenligning av nukleotid- og proteinsekvenser.
  • Listen over Wikipedia-sider som beskriver en taxon ved hjelp av en NCBI-referanse .

Eksterne linker