Utviklet av | Beijing Institute of Genomics |
---|---|
Siste versjon | r240 |
Miljø | UNIX ( Linux , Mac OS X ) |
Type | Bioinformatikk |
Tillatelse | GPL versjon 3.0 |
Nettsted | [1] |
SOAPdenovo er programvare for de novo- samling av korte DNA- sekvenser produsert av en gensekvenser . Dette verktøyet er en del av programvarepakken SOAP ( Short Oligonucleotide Analysis Package ).
SOAPdenovo ble utviklet i 2009 av Beijing Institute of Genomics. Denne programvaren ble brukt for første gang i et prosjekt med sikte på de novo å samle sekvensen til det menneskelige genomet på en rask og økonomisk måte. Den samme programvaren ble brukt et år senere for å montere det gigantiske panda- genomet på samme måte .