En palindrom sekvens er en sekvens av nukleinsyre - DNA eller RNA - identisk når den leses i retning 5 '→ 3' på en streng eller i retning 5 '→ 3' på den komplementære strengen. Dette er for eksempel tilfelle i den følgende sekvensen, som er gjenkjent av enzymet kalt Eco RI , et restriksjonsenzym av E. coli :
5'- G AA TT C -3 ' 3'- C TT AA G -5 'Definisjonen av et palindrom i genetikk er forskjellig fra den klassiske definisjonen for tegn. I følge sistnevnte er et palindrom faktisk en serie tegn som presenterer en symmetri, som er godt illustrert på latin av torget Sator : SATOR AREPO TENET OPERA ROTAS .
På den annen side består nukleinsyrer av nukleotider for RNA og deoksynukleotider for DNA som er i stand til å pares ved å danne komplementære basepar : følgelig sies en genetisk sekvens å være palindromisk når den har symmetri med sin komplementære sekvens og ikke med seg selv; således vil ACCTAGGT-sekvensen sies å være palindromisk, selv om den ikke i seg selv er symmetrisk, siden den er symmetrisk med TGGATCCA-sekvensen, som er komplementær til den.
Denne særegenheten har effekten av å fremme dannelsen av strukturer som kalles "hårnål" eller stammesløyfe : De komplementære og symmetriske sekvensene pares ved å danne en spiralformet stang med en sløyfe rundt symmetripunktet for den palindromiske sekvensen. Slike palindromiske sekvenser finnes i de fleste genomer .
Palindromiske sekvenser finnes også i proteiner . Det er da symmetri av den sekundære strukturen , og dermed sekvensen i aminosyrer . Deres rolle er imidlertid fortsatt uklar. Det har nylig blitt antydet at eksistensen av palindromiske sekvenser i proteiner er relatert til tilstedeværelsen av regioner med lav kompleksitet, siden palindromer ser ut til å være assosiert med regioner med lav kompleksitet. De kan også være knyttet til α helices eller til dannelsen av protein / proteinkomplekser.