RNA-polymerase II

Den RNA polymerase II ( rnap II eller Pol II ) er en nukleotidyltransferase til stede i celler av eukaryoter . Det er en av RNA-polymerasene til disse organismer, sammen med RNA-polymerase I , RNA-polymerase III og RNA-polymerase IV . Hun innser transkripsjonen av DNA for å produsere RNA før messenger og de fleste av de små kjernefysiske RNAene og mikroRNAene . Det er et 550  kDa proteinkompleks som krever et stort antall transkripsjonsfaktorer for å binde seg til promotoren og starte transkripsjonen.

RNA-polymerase II består av 10 til 12 underenheter (12 i gjær og hos mennesker ), mellom hvilke ulike interaksjoner er identifisert:

• Den DNA-avhengige RPB1 RNA-polymerase II-underenheten - Kodet hos mennesker av POLR2A- genet og i gjær av RPO21- genet . Det er den største underenheten av RNA-polymerase II. Den inneholder et domene C -terminal omfattende opptil 52 gjentakelser av et mønster av syv  rester av aminosyre Tyr - Tjen - Pro - Thr - Tjen - Pro - Ser vesentlig for aktiviteten polymerase . Det danner, sammen med andre underenheter, domenet som binder seg til DNA, i form av en spalte der DNA-malen blir transkribert til RNA. Det samhandler sterkt med PRB8-underenheten.

• Den PRB2 subenheten - Dette er den nest største subenheten av enzymet. Sammen med minst to andre underenheter, utgjør den strukturen som holder kontakten, i det aktive stedet av enzymet, DNA-malen og det nylig syntetiserte RNA.

• Den PRB3 subenheten - Dette er den tredje største subenheten av enzymet. Den eksisterer som en heterodimer med en annen polymerase-underenhet, og danner en underenhet med POLR2J-kjeden. Det samhandler sterkt med RPB1-5, 7 og 10-12 underenhetene.

• Den subenheten RPB4 (gen POLR2D ) - Det ville ha en beskyttende rolle mot stress.

• Den subenheten RPB5 (gen POLR2E ) - Hver RNA polymerase II i betraktning duplikat. Det samhandler sterkt med RPB1, 3 og 6 underenheter.

• Den RPB6 subenheten - sammen med minst to andre subenheter, danner den en struktur som stabiliserer polymerasen på DNA-templaten under transkripsjon.

• Den subenheten RPB7 (gen POLR2G ) - Det kan spille en regulerende rolle. Det samhandler sterkt med RPB1 og 5 underenheter.

• Den subenheten RPB8 (gen POLR2H ) - Den kommuniserer med subenheter RPB1-3, 5 og 7.

• Den RPB9 subenhet ( POLR2I gen ) - sammen med den RPB1 subenheten, utgjør den sprekken hvor DNA-matrisen er fastklemt under transkripsjon.

• Den subenheten RPB10 (gen POLR2L ) - Den kommuniserer med den subenheter RPB1-3 og 5, og i sterk RPB3.

• Den RPB11 subenheten - Det er i seg selv består av tre underenheter hos mennesker: POLR2J (RPB11-a), POLR2J2 (RPB11-b) og POLR2J3 (RPB11-c)

• Den subenheten RPB12 (gen POLR2K ) - Den kommuniserer også med den subenheten RPB3.

Merknader og referanser

1. (i) Peter A. Meyer, Ping Ye, Zhang Mincheng, Man-Hee Suh og Fucorrespondenceemail Jianhua , "  Phasing RNA polymerase II using Intrinsically bound Zn Atoms: an updated structural model  " , Structure , vol.  14, n o  6, juni 2006, s.  973-982 ( PMID  16765890 , DOI  10.1016 / j.str.2006.04.003 , les online )
2. (in) Roger D. Kornberg , "  Eukaryotic transcriptional control  " , Trends in Cell Biology , Vol.  9, n o  12 Desember 1999, M46-M49 ( PMID  10611681 , DOI  10.1016 / S0962-8924 (99) 01679-7 , les online )
3. (in) Robert J. Sims III Subhrangsu S. Mandal og Danny Reinberg , "  Recent highlights of RNA polymerase II transcription-mediated  " , Current Opinion in Cell Biology , Vol.  16 n o  3, Juni 2004, s.  263-271 ( PMID  15145350 , DOI  10.1016 / j.ceb.2004.04.004 , les online )
4. (i) Vic E. Myer og Richard A. Young , "  RNA Polymerase II and holoenzymes subcomplexes  " , Journal of Biological Chemistry , vol.  273, n o  43, 23. oktober 1998, s.  27757-27760 ( PMID  9774381 , DOI  10.1074 / jbc.273.43.27757 , les online )
5. (en) Joël Acker, Michael de Graaff, Isabelle Cheynel, Vladimir Khazak, Claude Kedinger and Marc Vigneron , “  Interactions between the Human RNA Polymerase II Subunits  ” , Journal of Biological Chemistry , vol.  272, n o  27 4. juli 1997, s.  16815-16821 ( PMID  9201987 , DOI  10.1074 / jbc.272.27.16815 , les online )
6. (in) WJ Brickey og AL Greenleaf , "  Functional Studies of the carboxy-terminal repeat domain of Drosophila RNA Polymerase II in Vivo  " , Genetics , vol.  140, n o  to Juni 1995, s.  599-613 ( PMID  7498740 , PMCID  1206638 , les online )