DPANN
STIFT
Nanoarchaeum equitans (de små symbiotene nederst til høyre)
| Regjere | Archaea |
|---|
C. Rinke et al. (2013)
Nedre rang taksa
- Aenigmarchaeota
- Altiarchaeota
- Diapherotritis
- Mamarchaeota
- Micrarchaeota
- Nanoarchaeota
- Nanohaloarchaeota
- Pacearchaeota
- Parvarchaeota
- Woesearchaeota
De DPANNs danner en clade utgjør en super-forgrening av archaea . Han identifiserte i 2013. Den regnes i dag som den mest basale grenen av Archaea-treet.
DPANN er et akronym basert på navnene på de fem første gruppene oppdaget, Diapherotrites , Parvarchaeota , Aenigmarchaeota , Nanoarchaeota og Nanohaloarchaeota . Deretter ble Woesearchaeota , Pacearchaeota deretter Altiarchaeota , Micrarchaeota og Mamarchaeota lagt til.
DPANNs grupperer forskjellige grener etter miljø og metabolisme , alt fra symbiotiske og termofile former som Nanoarchaeota , acidophiles som Parvarchaeota og ikke- ekstremophiles som Aenigmarchaeota og Diapherotrites . DPANNs har også blitt oppdaget i grunnvann rik på nitrater , på vannoverflaten, men ikke under, noe som indikerer at disse taksene fremdeles er ganske vanskelige å lokalisere.
Cladogram
I følge Tom A. Williams et al. , 2017 og Castelle & Banfield, 2018 (DPANN):
| Neomura |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Merknader og referanser
- (en) Rinke C, Schwientek P Sczyrba A, Ivanova NN, Anderson IJ, Cheng JF, Darling A, Malfatti S, Swan BK, Gies EA, Dodsworth JA, Hedlund BP Tsiamis G, Sievert DM, Liu WT, Eisen JA, Hallam SJ, Kyrpides NC, Stepanauskas R, Rubin EM, Hugenholtz P, Woyke T, “ Insights into the fylogeny and coding potential of microbial dark matter ” , Nature , vol. 499, nr . 7459,juli 2013, s. 431–437 ( PMID 23851394 , DOI 10.1038 / nature12352 , les online )
- (in) Tom A. Williams et al. , Integrativ modellering av gen- og genomutvikling røtter livets arkeiske tre , publisert i 2017 DOI : 10.1073 / pnas.1618463114
- Castelle CJ, Wrighton KC, Thomas BC, Hug LA, Brown CT, Wilkins MJ, Frischkorn KR, Tringe SG, Singh A, Markillie LM, Taylor RC, Williams KH, Banfield JF, “ Genomisk utvidelse av domene archaea fremhever roller for organismer from new phyla in anaerobic carbon cycling ”, Current Biology , vol. 25, n o 6,mars 2015, s. 690–701 ( PMID 25702576 , DOI 10.1016 / j.cub.2015.01.014 )
- Anja Spang, Eva F. Caceres og Thijs JG Ettema, " Genomisk utforskning av mangfoldet, økologien og evolusjonen av livets arkeologiske domene ", Science , vol. 357, nr . 6351,11. august 2017, eaaf3883 ( PMID 28798101 , DOI 10.1126 / science.aaf3883 )
- (i) Castelle, CJ, Banfield, JF, " Major Groups Expand New Microbial Diversity and Alter our Understanding of the Tree of Life " , Cell , vol. 172, n o 6,2018, s. 1181-1197 ( PMID 29522741 , DOI 10.1016 / j.cell.2018.02.016 )
- Ludington WB, Seher TD, Applegate O, Li X, Kliegman JI, Langelier C, Atwill ER, Harter T, DeRisi JL, “ Evaluering av biosyntetisk potensial for jordbruks grunnvann gjennom metagenom sekvensering: Et mangfoldig anammox samfunn dominerer nitratrikt grunnvann ” PLOS ONE , vol. 12, n o 4,6. april 2017, e0174930 ( PMID 28384184 , PMCID 5383146 , DOI 10.1371 / journal.pone.0174930 )
- (in) Kiley W. Seitz, Nina Dombrowski, Laura Eme, Anja Spang, Jonathan Lombard et al. , " Asgard archaea i stand til anaerob hydrokarbonsykling " , Nature Communications , vol. 10,23. april 2019, Nr . 1822 ( DOI 10.1038 / s41467-019-09364-x ).