Korarchaeota

Korarchaeota Beskrivelse av bildet Korarchaeota.jpg. Klassifisering
Regjere Archaea

Gren

Korarchaeota
Barns et al. 1996

Synonymer

Fylogenetisk klassifisering

Posisjon:

Den korarchaeota eller Xenarcheota er en rekken ( rekken ) av archaeal termofil identifisert ved sekvensanalyse av 16S rRNA fra miljøprøver fra varme kilder av Yellowstone .

Disse organismene ville ha skilt seg ganske tidlig fra Crenarchaeota og Euryarchaeota , slik genetiske studier antyder . Deres fylogenetiske mangfold ser ut til å ha blitt understøttet av den geografiske spredningen og forskjellene i temperatur og saltholdighet i de koloniserte miljøene. De er aldri til stede i overflod i miljøene som er studert så langt.

Bare en art er blitt foreslått i dette fylket : Candidatus Korarchaeum cryptofilum av Elkins et al. , 2008 .

Merknader og referanser

  1. Barns, Susan M., Fundyga, RE, Jeffries, MW, og Pace, NR "Bemerkelsesverdig arkeisk mangfold oppdaget i et Yellowstone nasjonalpark varmekildemiljø." Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1994) 91: 1609-1613.
  2. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC38617/
  3. (in) SM Barns, CF Delwiche, JD Palmer og NR Pace , "  Perspectives archaeal variety, and thermophily monophyly from environmental rRNA sequences  " , Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , vol.  93, n o  17 20. august 1996, s.  9188-9193 ( les online ) DOI : 10.1073 / pnas.93.17.9188 PMID 8799176
  4. (in) James G. Elkins, Mircea Podar, David E. Graham, Kira S. Makarova, Yuri Wolf, Lennart Randau, Brian P. Hedlund, Celine Brochier-Armanet Victor Kunin, Iain Anderson, Alla Lapidus, Eugene Goltsman, Kerrie Barry, Eugene V. Koonin, Phil Hugenholtz, Nikos Kyrpides, Gerhard Wanner, Paul Richardson, Martin Keller og Karl O. Stetter , "  Et korarchealt genom avslører innsikt i evolusjonen av Archaea  " , Proceedings of the National Academy of Sciences of the Amerikas forente stater , vol.  105, nr .  23, 10. juni 2008, s.  8102-8107 ( les online ) DOI : 10.1073 / pnas.0801980105 PMID 18535141
  5. (no) Thomas A. Auchtung, Galina Shyndriayeva og Colleen M. Cavanaugh , “  16S rRNA fylogenetisk analyse og kvantifisering av Korarchaeota innfødt til de varme kildene i Kamchatka, Russland  ” , Extremophiles , vol.  15, n o  1, januar 2011, s.  105-116 ( les online ) DOI : 10.1007 / s00792-010-0340-5 PMID 21153671
  6. (i) Laila Johanne Reigstad Steffen Leth Jorgensen og Christa Schleper , "  Mangfold og overflod av korarchaeota i terrestriske varme kilder på Island og Kamchatka  " , The ISME Journal , vol.  4, n o  3, 2010, s.  346-356 ( les online ) DOI : 10.1038 / ismej.2009.126 PMID 19956276
  7. (in) Referanse NCBI  : Candidatus Korarchaeum cryptofilum ( inkludert taxa )