Den rike (fra latin “ regnum ”, i flertall “ regna ”) er, i taksonomi av Carl von Linné (som klassifiserer biologisk mangfold i henhold til felles felles kjennetegn), det høyeste nivået av klassifisering av levende vesener . I de siste klassifiseringene er regjeringen bare det andre klassifiseringsnivået, etter domenet eller imperiet .
Hvert kongerike er delt inn i grener (eller noen ganger divisjoner , i botanikk ), som også kalles fylum på latin som på engelsk. De viktigste nivåene av taksonomisk klassifisering er levende verden, imperium eller domene, rike, fylum eller divisjon , klasse , orden , familie , slekt og art .
En kontroversiell revisjon av klassifiseringen ble foreslått av Carl Woese i 1990, etter å ha observert det som så ut til å være store forskjeller på molekylært nivå i bakterier og archaea , selv om begge gruppene er sammensatt av prokaryote organismer . Woese satte seg deretter for å etablere et klassifiseringssystem med tre domener: bakterier, archaea og eukaryoter (dette tredje domenet består av planter, dyr, protister og sopp). Den nåværende bruken av syv-rike-systemet er et kompromiss mellom det klassiske fem-rike-systemet til Robert Harding Whittaker og tre-domenesystemet til Woese. Dette syv-rike-systemet, der prokaryoter er delt inn i bakterier og arkeaer, har blitt standard i mange verk.
Den tradisjonelle klassifiseringen av Linné (1735) i to grupper (vegetabilsk / dyr) har utviklet seg til dannelsen av de seks kongerikene i henhold til biologi :
I henhold til klassifiseringen i seks riker ( Carl Woese , 1977), blir det tatt i betraktning, på grunnlag av analysen av ribosomale RNA-sekvenser (16S eller 18S), forslaget om å dele den levende verden i tre " primære riker ", de av arkeobakterier , eubakterier og eukaryoter.
Under organismenes cellulære utvikling har det vært et grunnleggende brudd som skiller gruppen eukaryoter og prokaryoter .
Prokaryoter ( Procaryota ) er encellede, men kan være flercellede (eksempel: Trichodesmium , en slekt av trådformede cyanobakterier ), og deres genetiske materiale er ikke omsluttet av en kjerne. De har enzymer plassert i celleveggen og multipliserer med fissiparitet . De utgjør de to første kongedømmene.
Alle andre organismer kalles "eukaryoter" ( Eukaryota ). Deres genetiske materiale er omsluttet av en kjerne; de har cellulære organeller, cellemultiplikasjon finner sted ved mitose, og de viser ofte seksuell reproduksjon .
Eukaryoter kan være encellede eller flercellede. Encellet eukaryoter kalles "protister" og utgjør det tredje riket.
Til slutt er flercellede eukaryoter delt inn i tre riker, drømmene (sopp), metafytter (klorofyllplante) og metazoans (flercellede dyr).
Skillet mellom rikene av dyr og planter dukket opp fra antikkens greske, men det var ikke før midten av XVIII th århundre at den formelle anerkjennelse av disse to rikene har dukket opp i nomenklaturen av pennen Linné .
I antikken var de greske filosofene interessert i klassifiseringen av naturen . De skilte mellom livløse vesener, mineraler, " animerende vesener" ( zên ) det vil si utstyrt med liv . Blant disse skilte de de ganske enkelt levende, nemlig planter ( zôn ), fra den animerte ( zôon ). Den Zoia var et konsept som dekket hele den ikke-vegetal "animere vesener", det vil si dyrearter, mannen inkludert, og gudene. Disse tre naturlige klasser, dyr, mennesker og gud ble referert til som fauner.
Aristoteles (384-322 f.Kr.) var en av de første som var interessert i dyreklassifisering. Vi skylder ham grupperingen av dyr med lignende tegn i en slekt, et begrep som hadde en bredere betydning enn begrepet som brukes i dag i biologi , samt skillet mellom forskjellige arter innen samme slekt. Aristoteles delte dyr i to typer: dyr som har blod og de som ikke har, i det minste ikke har rødt blod. Dette skillet passer ganske godt med vårt skille mellom virveldyr og virvelløse dyr . Dyr som har blod, tilsvarende hvirveldyr, er gruppert i fire slekter: viviparous quadrupeds ( pattedyr ), fugler , oviparous quadrupeds ( reptiler og amfibier ), Fiskene (inkludert hval fordi Aristoteles ikke hadde forstått at de var pattedyr). Blodfrie dyr ble klassifisert som blæksprutter , krepsdyr , insekter (som inkluderte arachnids ), avskallede dyr (de fleste bløtdyr og pigghuder ) og plantedyr ( svamper og coelenterates ).
Det som ble gjort av Aristoteles for dyreriket, ble også gjort for vegetariket av Theophrastus . Theophrastus deler planter i fire grupper i henhold til formen: trær , busker , underbusker og urteaktige planter . På III th århundre f.Kr.. AD , Theophrastus laget en liste over 500 arter i sine to hovedverk: Historia plantarum ("Plantenes historie") og " Årsakene til planter "). Selv om han hovedsakelig var interessert i planter av medisinske årsaker, ble han ledet til å klassifisere dem i henhold til deres reproduksjonsmåte.
I det jeg st århundre e.Kr., Dioscorides beskrevet i hans Materia Medica mer enn 600 ulike planter. Denne boken ble "redigert" i nesten tusen år.
I det XVIII th århundre, Carl Linné , populært den binomial system av nomenklatur som refererer til en art som ved dens generiske navn (genus) og dens spesifikke Epitet (arter). Et sammenlignbart binomialsystem ble opprettet to århundrer tidligere av den sveitsiske naturforskeren Gaspard Bauhin som Linné hyllet ham ved å tilegne artsnavnet Bauhinia bijuga til ham . Linnés ambisjon var å navngi og beskrive alle dyrene, plantene og mineralene som var kjent i sin tid, ved en taksonomisk setning på et dusin ord. Faktisk regjerer begrepet på Linnés tid ikke fra det som har dominert siden antikken. Det var alltid mer en naturalistisk beskrivelse enn en biologisk , og det er derfor vi fremdeles finner mineralriket så kjært for alkymister .
Usikker grense mellom planter og dyrAntikken og middelalderen var naturforskernes æra . De greske filosofene betraktet naturen som et kontinuum mellom det inerte, det levende og det åndelige. De betraktet koraller som mellomorganismer mellom mineralet og de levende, akkurat som organismer som svamper og coelenterates er i deres øyne mellomledd mellom planten og dyret. Denne monistiske, men bipolare plantedyrsoppfatningen vil fortsatt vedvare i Linné, som i 1767 betraktet det "kaotiske rike" ( Regnum chaoticum ) for å klassifisere dyreplanter. Treviranus , i XIX E århundre, vil kalle dem " zoofytter " og vil klassifisere dem i Amphorganicums regjeringstid ved siden av kongerikene av planter og dyr. Styret til Treviranus Amphorganicum inneholdt zoofytter så vel som sopp , bryophytes , bregner , Confervae ( trådalger ), fuci og Najadales . I 1824 skapte Bory de Saint-Vincent psykodiaries (for zoofytter, vorticellider og diatomer ).
I midten av XIX E- tallet ble det anerkjent at visse organismer, som euglena , ikke kunne klassifiseres som dyr eller lignende planter. Et tredje styre ble nødvendig for å klassifisere dem: protistene .
Livsverdenen vil forbli delt inn i dyre- og planteriket til tidlig på XIX - tallet . De første observasjonene av mikroskopiske organismer takket være oppfinnelsen av mikroskopi ( Leeuwenhoek , 1683) nødvendiggjorde klassifisering av dem i den levende verden. Den encellede eukaryote ble deretter klassifisert i dyreriket som protozoer ved Owen (1859). De bakterier som ble først forbundet med Arten av Linné Verms . Les Vermes , som betyr ormer, samlet alle ikke- leddyr hvirvelløse dyr , dette kom sammen var på grunn av stangformen og flagellær mobilitet av basillene . I 1838 klassifiserte Ehrenberg , som var den første som kalte dem bakterier, dem som vibrioer i dyreriket. Imidlertid Cohn endret sin regel i 1872 for å klassifisere dem blant planter etter demonstrerer at blågrønne alger er nær bakterier. Cohn klassifiserte dem som underordnede planter i phylum Schizophytes.
For å unngå en vilkårlig fordeling av encellede organismer i det ene eller det andre riket, har noen forfattere ( J. Hogg , R. Owen, TB Wilson , J. Cassin og Ernst Haeckel ) foreslått å klassifisere lavere organismer i et tredje styre. Haeckel foreslo i 1866 å klassifisere disse organismene i protistenes regjeringstid . I 1866-versjonen samlet protister også sopp. Haeckel reviderte systemet sitt i 1894. Protistene var nå lavere, encellede, ikke-vevsdannende organismer. Bakterier var en undergruppe av monerne. De bakterier og Cyanophyta ble rangert blant de lavere protister mens protozoer , unicellulære alger, sopp og encellede formene ble klassifisert som høyere protister. I et siste versjon i 1904, Haeckel redusert sitt system til to riker: Protistriket for ikke- vevs- dannende organismer og Histonia for organismer med vev.
Walton opprettet i 1930 det unike riket Bionta for å nevne alle levende ting. Denne taksonen ble delt inn i tre underkongeriker : Protistodeae , Metaphytodeae (flercellede planter) og Zoodeae (flercellede dyr).
I 1937 foreslo Édouard Chatton en klassifisering av den levende verden i to celletyper som han kalte prokaryoter (organismer med celler uten en kjerne) og eukaryoter (organismer med celler med en kjerne). Begrepet prokaryoter dekker da begrepet lavere protister.
I 1939 foreslo Conard å dele levende organismer i tre riker, Phytalia , Animalia og Mycetalia for planter, dyr og sopp.
I revisjonen av sitt naturlige system, i 1894, fulgte Haeckel en firedeling og samlet levende organismer i fire riker: I. Protophyta , II. Metaphyta , III. Protozoer , IV. Metazoa .
I 1948 brukte Rothmaler begrepene Anucleobionta , Protobionta , Cormobionta , Gastrobionta for å definere de fire kongedømmene.
I 1956 ga Copeland ut sitt arbeid med tittelen Klassifiseringen av lavere organismer . Han ber deretter om fire riker: Mychota (blågrønne alger og bakterier), protoktister (eukaryote alger, sopp, mugg og protozoer), planter ( embryofytter og grønne alger) og dyr (inkludert svamper).
I 1959 utviklet Whittaker et klassifiseringssystem for organismer som består av fire riker: Protista , Plantae , Fungi og Animalia . Protistriket deles deretter inn i to underkongeriker , Monera for bakterier og blågrønne alger og Eunucleata for encellede organismer med en kjernemembran .
Leedale i 1974 foreslo en flerfoldig klassifisering av levende ting og foretrakk "pteropod" -ordningen basert på fire riker: Monera , Plantae , Fungi og Animalia .
I 1939 grupperte Barkley virus i et bestemt rike slik at han etablerte et system med levende natur i fem riker: sopp, monera, protister, planter og dyr.
I 1969 foreslo Whittaker en nomenklatur med fem riker: monera (prokaryoter), protister (encellede eukaryoter), planter (fotosyntetiske multicellular eukaryoter), sopp (sopp) (ikke-fotosyntetiske multicellular eukaryoter) og dyr (multicellular eukaryoter) heterotrofer ). Det fremhever også tre nivåer av cellulær organisering: prokaryot, encellulær eukaryot og flercellulær eukaryot. Hvert av disse nivåene er forskjellige i ernæringsmåte. Monera - planter aksen har en fotosyntetisk ernæringsmåte , monera - soppaksen er en modus for ernæring ved absorpsjon, og protistene - dyr akser en modus for ernæring ved inntak, inntak er fraværende i monera.
I 1971 vedtok Margulis den taksonomiske klassifiseringen av levende ting med fem riker.
Jeffrey i 1982 foreslo en klassifisering med to superkongeriker utviklet seg til fem riker, med to riker Bacteriobiota og Archeobacteriobiota i superkongeriket Prokaryota (prokaryoter) og tre riker Phytobiota , Mycobiota og Zoobiota (for planter, sopp og dyr) i Eukaryota ( eukaryotisk) superriket .
På slutten av XX th århundre fylogenetisk klassifikasjon basert på cladisme tar mer foran tradisjonelle klassifikasjoner basert på valg ansett som mer subjektiv (morfologisk sammenligning kriterier, anatomiske, økologiske eller atferds). Den fylogenetiske tilnærmingen får oss til å betrakte som de eldste skillene mellom bakterier , archaea og eukaryoter .
I 1977 foreslo Woese å anerkjenne arkebakteriene som et resultat av sine studier på ribosomalt RNA . Deretter syntes fylogenetiske analyser å vise at arkabakterier er kladistisk nærmere eukaryoter enn eubakterier. Woese omdøpte dem deretter til archaea og bakterier for å understreke på den ene siden at det er betydelige molekylære forskjeller mellom archaea og eubacteria, og på den andre siden for å bryte med ideen om en organisasjonsplan som er felles for alle prokaryoter., Svarende til den brede følelsen av begrepet "bakterier". I dette tre- domenet system , Woese foreslått i 1990 to nye hersker blant archaea: den Crenarchaeota og Euryarchaeota og til hvilken den Korarchaeota vil senere bli tilsatt . I bakterier foreslår han å heve Phyla til rike. I eukaryoter antar Woese at kongedømmene til dyr, planter og sopp kan bevares. Når det gjelder protistene som ikke utgjør en monofyletisk gruppe, forutser Woese at de deler seg i flere riker.
Mange klassifiseringsforslag har dukket opp i litteraturen, men de fleste har ikke fått oppmerksomhet fra det vitenskapelige samfunnet . Dette er tilfellet for Jahn og Jahn i 1949 som lagt til to nye riker, den Sopp og Archetista ( virus ) til pre-eksisterende fire- rike system, nemlig metazoer (dyr), de metaphytes (planter), de protister og moners ( prokaryoter ). Avantgarde-ideen om å foreslå et nytt rike for sopp vil bli tatt opp tjue år senere av Whittaker i en fem-rike klassifisering (se ovenfor).
Evolusjonisten Grant oppfattet i 1963 et diagram over seks riker: dyr, planter, sopp (for slimete former og flere grupper av ekte sopp), protister (kjernede encellede organismer), monera (for bakterier, blåalger) grønne og virus) pluss et hypotetisk styre av enkle prekellulære organismer.
Selv om viruset har vært attraktivt, har det ennå ikke hatt et flott klangbrett. Imidlertid gjenoppretter eksistensen av Mimivirus debatten. Den Mimivirus har det spesielle ved å ha syv gener som er felles for archaea, bakterier og eukaryoter. Derfor blir det mulig å lage et fylogenetisk tre av levende vesener inkludert Mimivirus og derfor potensielt alle virus. Den Mimivirus vises på dendrogrammer på en fjerde gren nær opprinnelsen til eukaryoter og forskjellige bakterier, archaea og eukaryoter. Dette antyder en veldig god ansiennitet. Genomet ble ikke bygget over ulike lån, men er faktisk en struktur som har vært homogen under evolusjonen. Man kan forestille seg at de første DNA-virusene var degenererte celler som tilsvarer veldig gamle linjer som nå har forsvunnet, med eller ikke før LUCA , den siste universelle felles stamfar.
Det eneste systemet med seks regjeringer som for øyeblikket får oppmerksomhet, er Cavalier-Smith . Dette systemet ble opprinnelig utgitt i 1998 og har holdt seg stort sett stabilt gjennom regelmessige oppdateringer. Det er et system av to imperier (prokaryoter og eukaryoter) delt inn i seks riker: bakterieriket i prokaryotens imperium og rikenene til protozoer , kromister , dyr, planter og sopp i imperiet til eukaryoter. Archaea i Cavalier-Smith utgjør en gren i underriket av unibakterier . Singulariteten til eubakterier sammenlignet med arkabakterier og eukaryoter er likevel fortsatt anerkjent siden Cavalier-Smith skiller dem ut ved å gruppere de to sistnevnte sammen i Neomurans- kladen . Denne karakteren Eubacteria og denne Neomura- kladen er imidlertid ikke anerkjent som taxa, det vil si at de ikke formelt hører til den foreslåtte klassifiseringen.
I 2015 kom biologene Ruggiero et al. , inkludert Cavalier-Smith, utvikler en klassifisering av levende organismer delt inn i to superkongeriker ( Prokaryota og Eukaryota ) og syv riker. Deres mønster, unntatt virus, inkluderer to prokaryote riker, Archaea ( Archaebacteria ) og Bacteria ( Eubacteria ), og fem eukaryotic riker, Protozoa , Chromista , Fungi , Plantae og Animalia .
Linné 1735 2 regjerer |
Haeckel 1866 3 regjerer |
Chatton 1925 2 imperier |
Copeland 1938 4 regjerer |
Whittaker 1969 5 regjerer |
Woese et al. 1977 6 regjerer |
Woese et al. 1990 3 domener |
Cavalier-Smith 1993 2 imperier og 8 regjeringer |
Cavalier-Smith 1998 2 imperier og 6 regjerer |
Ruggiero et al. 2015 2 imperier og 7 regjerer |
|||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
(ubehandlet) | Protista | Prokaryota | Monera | Monera | Eubakterier | Bakterie |
P r o k a r y o t a |
Eubakterier |
P r o k a r y o t a |
Bakterie |
P r o k a r y o t a |
Bakterie |
Archaebacteria | Archaea | Archaebacteria | Archaea | |||||||||
Eukaryota | Protoctista | Protista | Protista | Eucarya |
E u k a r y o t a |
Archezoa |
E u k a r y o t a |
Protozoer |
E u k a r y o t a |
Protozoer | ||
Protozoer | ||||||||||||
Chromista | Chromista | |||||||||||
Vegetabilia | Plantae | Plantae | Plantae | Plantae | Chromista | |||||||
Plantae | Plantae | Plantae | ||||||||||
Sopp | Sopp | Sopp | Sopp | Sopp | ||||||||
Animalia | Animalia | Animalia | Animalia | Animalia | Animalia | Animalia | Animalia |
De taksonomiske gradene som brukes systematisk for den hierarkiske klassifiseringen av den levende verden, er som følger (i synkende rekkefølge):