EF nr. | EC |
---|
IUBMB | IUBMB-oppføring |
---|---|
IntEnz | IntEnz-visning |
BRENDA | BRENDA inngang |
KEGG | KEGG-inngang |
MetaCyc | Metabolisk vei |
PRIAM | Profil |
FBD | Strukturer |
EF nr. | EC |
---|
IUBMB | IUBMB-oppføring |
---|---|
IntEnz | IntEnz-visning |
BRENDA | BRENDA inngang |
KEGG | KEGG-inngang |
MetaCyc | Metabolisk vei |
PRIAM | Profil |
FBD | Strukturer |
De helikaser er proteiner som benytter den hydrolysen energi av ATP eller GTP for å katalysere åpning av nukleinsyrer ( DNA eller RNA ) sammenkoblede dobbelttrådet form. De har evnen til å bevege seg på en orientert måte på nukleinsyrer i dobbelt- eller enkeltstrenget form og har derfor translokaseaktivitet (løsner proteiner festet til DNA). Egenskapene som kjennetegner disse molekylmotorene er deres retningsretning (fra 5 'til 3' eller omvendt), deres prosessivitet , den oligomere statusen (mono, di eller heksamerisk) av den aktive formen, og størrelsen på "trinnene" ( i nukleotid) utført for hvert hydrolyserte nukleotid. Hver organisme har flere helikaser, spesialisert i viktige cellulære prosesser som replikasjon , transkripsjon , rekombinasjon , ribosombiogenese , oversettelse og DNA- reparasjon , og regulert av egne domener. Helikasene som er involvert i DNA-replikering er en del av et multiproteinkompleks kalt replisome .
Det finnes mange helikaser i alle organismer som er studert så langt. Det er 14 forskjellige i E. coli- bakterier , og 24 hos mennesker. Deres biologiske betydning understrekes av de mange genetiske sykdommene som tilskrives en defekt i disse proteinene ( Werner-syndrom , Bloom-syndrom , Fanconi-anemi ).
Helikaser ble opprinnelig klassifisert i familiene (SF1 og 2) og familier (F3, F4 og F5) på grunnlag av deres konservert primære aminosyre- sekvens . Denne klassifiseringen har blitt stilt i tvil siden anskaffelsen av strukturelle data og biokjemiske egenskaper til disse helikassene.
Den tredimensjonale strukturen bestående av 141 terminale aminosyrer av DNA B helicase ble bestemt av høyoppløselig kjernemagnetisk resonans i løsning og av røntgenstråler i krystallografi . Dette er domenet som er viktig for interaksjonen med proteiner som primase eller C DNA . Dette er en 6-boot propell med et aldri før sett lukkemønster. Hvis vi observerer krystallstrukturen, merker vi at den er en dimer.
M. Uhring og A. Poterszman , " DNA-helikaser og assosierte sykdommer ", Med. Sci. , vol. 22,2006
Lohman TM, Tomko EJ, Wu CG. Ikke-heksameriske DNA-helikaser og translokaser: mekanismer og regulering. Nat Rev Mol Cell Biol . 2008 mai; 9 (5): 391-401.