Xanthomonas oryzae pv oryzae

Xanthomonas oryzae
pathovar oryzae Beskrivelse av dette bildet, også kommentert nedenfor Symptomer på bakteriell sykdom forårsaket av Xanthomonas oryzae pv oryzae på ris. Klassifisering
Regjere Bakterie
Gren Proteobakterier
Klasse Gammaproteobakterier
Rekkefølge Xanthomonadales
Familie Xanthomonadaceae
Snill Xanthomonas
Arter Xanthomonas oryzae

Pathovar

Xanthomonas oryzae pathovar oryzae
(ex ? Ishiyama 1922 ) Swings et al. , 1990

Xanthomonas oryzae pv oryzae er en av to pathovars festet til Xanthomonas oryzae , arter av Proteobacteria , som tilhører familien av Xanthomonadaceae .

Denne bakterien, hvis viktigste vert er ris ( Oryza sativa ), er ansvarlig for en av de mest alvorlige sykdommene i ris , kalt bakteriell ris sykdom (eller ris bakteriell blight ), eller "  kresek  " i Sørøst-Asia. Den er tilstede i de fleste risdyrkingsregioner i verden, med unntak av Middelhavsområdet .

Under gunstige forhold for sykdommen kan avkastningstap nå 70%.

Den genomet av denne bakterien (MAFF belastningen 311018) ble sekvensert i 2005 av en japansk lag . Dette genomet består av et enkelt sirkulært kromosom og har en størrelse på 4 940 217  bp . Dens struktur er preget av et stort antall effektorgener (avr). Denne bakterien betraktes som en modellorganisme for analyse av plante-patogen-interaksjonen fordi mer enn 30 forskjellige raser er kjent for deres virulens, og at 25 resistensgener er identifisert i ris (hvis genom også er identifisert. Sekvens).

Synonymer

Vert utvalg

I tillegg til dyrket ris innrømmer Xanthomonas campestris pathovar oryzae som vertsplanter forskjellige arter av Poaceae (Grasses) og Cyperaceae (Carex).

Blant Poaceae inkluderer: Cenchrus ciliaris (cenchrus Rhodesia), Cynodon dactylon (Bermuda gress høne), Echinochloa crus-galli (switchgrass foot-cock), Leersia hexandra , Leersia japonica , Leersia oryzoides (leersie falske ris), Leersia sayanuka , Leptocha chinensis , Leptochloa panicea , Oryza sp. (arter av slekten Oryza , særlig Oryza rufipogon og Oryza australiensis i Australia), Panicum maximum (Guinea gress), Paspalum scrobiculatum ( sverdgress ), Urochloa mutica (Para gress), Zizania aquatica (vill ris), Zizania palustris (vill ris) og Zoysia japonica (japansk zoysia);

og blant Cyperaceae  : Cyperus difformis (litenblomstig nøttegress), Cyperus rotundus (nøttegress).

Leersia sayanuka er den viktigste verten i Japan fordi denne arten sørger for at bakteriene overlever om vinteren og ofte finnes i områder der sykdommen er endemisk.

Merknader og referanser

  1. Roskov Y., Ower G., Orrell T., Nicolson D., Bailly N., Kirk PM, Bourgoin T., DeWalt RE, Decock W., van Nieukerken EJ, Penev L. (red.) (2020). Art 2000 & ITIS Catalog of Life , 2020-12-01. Digital ressurs på www.catalogueoflife.org . Art 2000: Naturalis, Leiden, Nederland. ISSN 2405-8858, åpnet 26. oktober 2014
  2. "  Informasjonsark om karantene skadedyr - Xanthomonas oryzae  " , EPPO (åpnet 25. oktober 2014 ) .
  3. (in) Hirokazu Ochiai, Yasuhiro Inoue, Masaru Takeya, Aeni Sasaki og Hisatoshi Kaku, "  Genome Sequence of Xanthomonas oryzae pv. oryzae foreslår bidrag fra store antall effektorgener og innsettingssekvenser til dets rasemangfold  ” , Japan Agricultural Research Quarterly (JARQ) , vol.  39, nr .  4, 2005), s.  275–287 ( les online ).
  4. (in) "  bakteriell bladskade av ris - Xanthomonas oryzae pv. oryzae (f.eks. Ishiyama 1922) Swings et al. 1990  ” , på Invasive.org (åpnet 25. oktober 2014 ) .
  5. (in) "  Xanthomonas oryzae pv. oryzae  ” på Cooperative Agricultural Pest Survey (CAPS) (åpnet 26. oktober 2014 ) .
  6. (in) "  Risikovurdering: Xanthomonas oryzae pv. oryzae, bacterial leaf blight or kresek disease  ” , NCSU / APHIS Plant Pest Forecast (NAPPFAST) (åpnet 26. oktober 2014 ) .
  7. (in) Shu Huang Or, ris sykdommer , CAB International / IRRI ,1985, 380  s. ( ISBN  978-0-85198-545-9 , leses online ) , s.  79.

Eksterne linker