Antiparallelisme (biokjemi)

I biokjemi sies det at to biopolymerer er antiparallelle hvis de er orientert parallelt med hverandre, men i motsatt retning. De to hovedeksemplene på denne molekylære konfigurasjonen er den dobbelte helix av DNA og β-arket med proteiner .

Nukleinsyrer

Retningen av de molekyler av nukleinsyren blir vanligvis definert ved hjelp av atomer av karbon av ribose (for RNA ) og deoksyribose (for DNA ) som bærer en gruppe fosfat -PO 3- 2-ved 5 'og en hydroksylgruppe –OH ved 3'. Dermed syntetiserer RNA-polymeraser og DNA-polymeraser disse nukleinsyrene alltid i 5 'til 3' retning .

Imidlertid er de to DNA-strengene som utgjør den dobbelte helixen, orientert i motsatt retning: hver ende av den dobbelte helixen består av 5'- enden av den ene strengen og 3'-enden av den andre strengen. Dette er viktig under DNA-replikering  : en av strengene i den dobbelte helixen, kalt den avanserte strengen , er orientert i 3 'til 5' retning, noe som innebærer en progresjon av den nyopprettede strengen i 5 'retning. 3', som er polymerasepolymerisasjon, som deretter kan replikere den kontinuerlig, mens den andre strengen, kalt laggingstreng , er orientert i motsatt retning, slik at polymeriseringen av den ny dannede strengen for ham finner sted i 3 'til 5 'retning, som bare kan gjøres i fragmenter, kalt Okazaki- fragmenter, hvor hvert fragment blir produsert i 5' til 3 '-retningen:

Polypeptider

De polypeptider som har en ende N -terminal og ende C -terminal er definert av funksjonell gruppe fri til enden på spørsmål: amin -NH 2N- terminal side og karboksyl -COOH -COOH C- terminal side . Den biosyntesen av proteiner skjer fra ende N -terminal til enden C -terminal , og det er i den samme retning som konvensjonelt representeres av sekvensen i aminosyrer av peptidene .

Mange proteiner har såkalte " β-ark " domener  i sin sekundære struktur . Slike ark består av polypeptidkjeder orientert parallelt med hverandre, i samme retning eller i motsatt retning: i sistnevnte tilfelle sies det at polypeptidkjedene til β-arket er antiparallelle.

Merknader og referanser