Arabidopsis
Arabidopsis
Arabidopsis thaliana
Snill
Arabidopsis Heynh. , 1842
Fylogenetisk klassifisering
Arabidopsis er en slekt av urteaktige planter av familien av Brassicaceae . De er små planter som ligner på kål og sennep. Denne slekten er av stor interesse siden den inneholder Arabidopsis thaliana , Thalius krabbe eller damer krabbe , modellorganisme anvendes i plantebiologi og grunnleggende biologi.
Etymologi
Latinsk "arabis", fra Arabia, Arabia: planter som ofte vokser i tørre og sandjord, som Arabias ørkener. "(Flora of Hippolyte Coste ) Gresk" opsis ", aspekt: port of an arabis" (Flora of Paul Fournier )
Omklassifisering
For tiden har slekten Arabidopsis ni arter og åtte ekstra anerkjente underarter . Denne klassifiseringen er ganske fersk og er basert på fylogeniske morfologiske og molekylære studier av O'Kane & Al-Shehbaz (1997, 2003).
Analysene deres bekrefter at artene som tidligere var klassifisert i slekten Arabidopsis var polyfyletiske . Den siste omklassifiseringen omplasserer to arter som tidligere var plassert i slektene Cardaminopsis og Hylandra og tre arter av Arabis i slekten Arabidopsis , men ekskluderer 50 arter som er omklassifisert i de nye slektene:
Beringia , Crucihimalaya , Ianhedgea , Olimarabidopsis , Pseudoarabidopsis , ... Se listen nedenfor )
Alle Arabidopsis- arter er hjemmehørende i Europa, mens to av artene har store områder som også strekker seg til Nord-Amerika og Asia .
Siden 1980-tallet har Arabidopsis thaliana dukket opp som en modellorganisme som brukes i det vitenskapelige samfunnet for genetiske og molekylærbiologiske studier. Denne lille planten har et lite genom (ca. 120 Mb) hvis DNA-sekvens av disse fem kromosomene har vært fullt kjent siden 2000.
Liste over arter og varianter
Distribusjon: Europa: hjemmehørende i Tyskland, Østerrike, Hviterussland, Bosnia-Hercegovina, Bulgaria, Kroatia, Tsjekkia, NE Frankrike, Ungarn, N Italia, Latvia, Litauen, Makedonia, Polen, Romania, Slovakia, Slovenia, Sveits, Ukraina og Jugoslavia; naturalisert i Belgia, Danmark, Estland, Finland, Nederland, Norge, Russland og Vest-Sibir og Sverige; fraværende i Albania, Hellas, Sentral- og Sør-Italia og Tyrkia.
- A. arenosa subsp. Borbasii
Distribusjon: Øst-Belgia, Tsjekkia, NE Frankrike, Tyskland, Ungarn, Polen, Romania, Slovakia, Sveits, Ukraina. ubekreftet tilstedeværelse i Danmark.
Distribusjon: SE Frankrike.
Distribusjon: Bosnia, Kroatia.
Distribusjon: Østerrike, Kroatia, Tsjekkia, Tyskland, Italia, Polen, Romania, Slovakia, Slovenia, Sveits og Ukraina. Sannsynligvis introdusert i Frankrike og utryddet i Belgia.
-
Arabidopsis halleri subsp. Ovirensis (Wulfen)
Distribusjon: Albania, Østerrike, NE Italia, Romania, Slovakia, Slovenia, SO Ukraina, Jugoslavia.
-
Arabidopsis halleri subsp. Gemmifera (Matsumura)
Distribusjon: Russisk Fjernøsten, NE Kina, Korea, Japan og Taiwan.
Distribusjon: NE Europeisk Russland, Alaska, Canada (Western Ontario til British Columbia), SE, C USA.
Distribusjon: Østerrike, Tsjekkia, England, Tyskland, Ungarn, Island, Irland, N. Italia, Norge, NO Russland, Sibir og Russisk Fjernøsten, Skottland, Sverige, Ukraina, Alaska og Yukon. Tilsynelatende utryddet i Polen.
-
Arabidopsis lyrata subsp. Kamchatica (Fischer ex DC)
Distribusjon: Boreal Alaska, Canada (Yukon, Mackenzie District, British Columbia, NE Saskatchewan), Aleutian Islands, E Siberia, Russian Far East, Korea, N China, Japan og Taiwan.
Distribusjon: Karpaterne, Polen, Romania, Slovakia og E Ukraina.
Distribusjon: INGEN Italia og sannsynligvis utryddet i Sveits.
Distribusjon: Fennoskandinavia og Østersjøen.
Distribusjon: Europa og Sentral-Asia, nå naturalisert over hele verden.
Modellorganisme brukt i genetikk.
Cytogenetisk
Cytogenetiske analyser har vist at det haploide antallet kromosomer er variabelt og kan være n = 5, 8, 13 eller 16.
-
Arabidopsis thaliana ; n = 5 og den komplette DNA-sekvensen til denne arten har vært kjent siden 2001.
-
Arabidopsis suecica ; n = 13 og er en amfidiploid art som skyldes hybridisering mellom Arabidopsis thaliana og Arabidopsis arenosa.
-
Arabidopsis neglecta ; n = 8 som de mange underartene til A. halleri.
De mange underarter av A. lyrata og A. arenosa kan ha enten n = 8 (diploid) eller n = 16 (tetraploid).
A. cebennensis, A. croatica og A. pedemontana ble ikke analysert cytologisk (i 2005).
Omklassifiserte arter
Følgende arter som tidligere ble plassert i slekten Arabidopsis, anses ikke lenger å tilhøre denne slekten:
-
A. bactriana =
-
A. brevicaulis = Crucihimalaya himalaica
-
A. bursifolia = Beringia bursifolia
-
A. campestris = Crucihimalaya wallichii
-
A. dentata = Murbeckiella pinnatifida
-
A. drassiana =
-
A. erysimoides = Erysimum hedgeanum
-
A. eseptata = Olimarabidopsis umbrosa
-
A. gamosepala = Neotorularia gamosepala
-
A. glauca = Thellungiella salsuginea
-
A. griffithiana = Olimarabidopsis pumila
-
A. himalaica = Crucihimalaya himalaica
-
A. huetii = Murbeckiella huetii
-
A. kneuckeri = Crucihimalaya kneuckeri
-
A. korshinskyi = Olimarabidopsis cabulica
-
A. lasiocarpa = Crucihimalaya lasiocarpa
-
A. minutiflora = Ianhedgea minutiflora
-
A. mollis = Beringia bursifolia
-
A. mollissima = Crucihimalaya mollissima
-
A. monachorum = Crucihimalaya lasiocarpa
-
A. mongolica = Crucihimalaya mongolica
-
A. multicaulis = Arabis tibetica
-
A. novae-anglicae = Neotorularia humilis
-
A. nuda = Drabopsis nuda
-
A. ovczinnikovii = Crucihimalaya mollissima
-
A. parvula = Thellungiella parvula
-
A. pinnatifida = Murbeckiella pinnatifida
-
A. pumila = Olimarabidopsis pumila
-
A. qiranica = Sisymbriopsis mollipila
-
A. richardsonii = Neotorularia humilis
-
A. russeliana = Crucihimalaya wallichii
-
A. salsuginea = Thellungiella salsuginea
-
A. sarbalica = Crucihimalaya wallichii
-
A. schimperi = Robeschia schimperi
-
A. stenocarpa = Beringia bursifolia
-
A. stewartiana = Olimarabidopsis pumila
-
A. stricta = Crucihimalaya stricta
-
A. taraxacifolia = Crucihimalaya wallichii
-
A. tenuisiliqua = Arabis tenuisiliqua
-
A. tibetica = Crucihimalaya himalaica
-
A. tibetica = Arabis tibetica
-
A. toxophylla = Pseudoarabidopsis toxophylla
-
A. trichocarpa = Neotorularia humilis
-
A. trichopoda = Beringia bursifolia
-
A. tschuktschorum = Beringia bursifolia
-
A. tuemurnica = Neotorularia humilis
-
A. verna = Drabopsis nuda
-
A. virgata = Beringia bursifolia
-
A. wallichii = Crucihimalaya wallichii
-
A. yadungensis =
Kilder
- O'Kane Jr, SL og Al-Shehbaz, IA (1997). En sammendrag av Arabidopsis (Brassicaceae): Novon 7: 323–327.
- Al-Shehbaz, IA, O'Kane, Steve L. (2002). Taksonomi og fylogeni av Arabidopsis (Brassicaceae). The Arabidopsis Book: 1-22. online versjon.
- O'Kane Jr, SL og Al-Shehbaz, IA (2003). Fylogenetisk posisjon og generiske grenser for Arabidopsis (Brassicaceae) basert på sekvenser av kjernefysisk ribosomalt DNA: Annaler fra Missouri Botanical Garden 90 (4): 603-612
Merknader og referanser
-
Tropicos.org. Missouri Botanical Garden., Tilgang 28. juli 2020
Eksterne linker