Risgult flekkvirus
Risgult flekkvirus| kongedømme | Riboviria |
|---|---|
| Regjere | Orthornavirae |
| Gren | Pisuviricota |
| Klasse | Pisoniviricetes |
| Rekkefølge | Sobelivirales |
| Familie | Solemoviridae |
| Snill | Sobemovirus |
Den virus av ris gul mottle (RYMV, Rice gul mottle virus ) er en art av plantevirus av slekten Sobemovirus ( familie av Solemoviridae . Det er et RNA-virus lineær enkeltkjedet, positiv forstand , festet til IV gruppe av Baltimore klassifisering Dette viruset smitter hovedsakelig risavlinger i Afrika. Det er viruset som forårsaker mest skade i afrikansk risdyrking, og forårsaker avkastningstap på 20 til 100%.
RYMV tilhører slekten Sobemovirus . Det er en enkel følelse av enkelstrenget lineært RNA-virus . Den viser et høyt nivå av genetisk mangfold med RYMV-nukleotider, estimert til rundt 14%.
Den virionet er et ikke-omhyllet partikkel som består av en kvasi-sfæriske kapsid med tyveflatede symmetri (T = 3), med en diameter på 29 til 32,2 nm. Kapsiden vises med et sekskantet omriss.
Enkeltdelgenomet består av et RNA- molekyl , 4450 nukleotider langt, ikke- polyadenylert . Den har fire åpne leserammer (ORFer). ORF1, lokalisert ved 5'-enden av genomet, koder for et lite protein som er involvert i bevegelsen av viruset og i undertrykkelsen av gendemping . ORF2, som koder for kjernepolyproteinet, har to overlappende ORFer: ORF2a koder for en serinprotease og et protein knyttet til virusgenomet; ORF2b, som reflekteres av en leserammeskiftmekanisme som et fusjonsprotein , koder for RNA-avhengig RNA-polymerase (RNA-replikase). Den kapsidprotein genet (ORF4) uttrykkes ved subgenomisk RNA i 3'-enden av genomet. Genomet omfatter videre tre ikke-kodende regioner (NCR) ved 5 '(5' NCR) og 3 '(3' NCR) ender og mellom ORF1 og ORF2.
Blant Sobemovirusene , som er delt inn i henhold til deres genomiske organisasjon i to grupper nær Southern cowpea mosaic virus (SCPMV) på den ene siden, og Cocksfoot mottle virus (CfMV) på den annen side, har RYMV blitt klassifisert i den andre gruppen.
Serologiske forskjeller mellom RYMV-isolater er rapportert. Fem hovedstammer ble skilt ut i Afrika, tre i Vest-Afrika (S1, S2, S3) og to i Øst-Afrika (S4, S5). Divergensen av nukleotider og aminosyrer mellom de fem stammene av RYMV utgjør opptil 11%.
Risgult variegasjonsvirus er endemisk til det afrikanske kontinentet der det finnes i de fleste risproduserende land . Imidlertid er det også rapportert fra Tyrkia . Dette viruset ble først rapportert i Kenya i 1966 og har blitt oppdaget i mange land i Afrika sør for Sahara . Det har også blitt oppdaget i Sentral-Afrika .
En undersøkelse utført i 2002-2003 ved bruk av serologiske tester i Edirne-regionen avdekket tilstedeværelsen av risgult variegasjonsvirus (RYMV) i Tyrkia .
Utvalget av RYMV- vertsplanter inkluderer bare dyrkede og ville gress som tilhører stammene Oryzeae og Eragrostideae . Blant disse plantene er spesielt inkludert Oryza longistaminata , betraktet som den viktigste verten, Oryza barthii og Oryza glaberrima (afrikansk ris) '.
Ulike studier har vist at, i tillegg til planter av slekten Oryza , er mange gressarter naturlige verter for RYMV og kan utgjøre alternative verter eller reservoarplanter , spesielt: Dinebra retroflexa , Echinochloa colona , Echinochloa crus-galli , Echinocloa crus- pavonis , Echinocloa pyrimidalis , ansikt vaske , Eragrostis ciliaris , Eragrostis tenuifolia , Ischaemum rugosum , Panicum maksimum , repens Panicum .
Streping, flekker, misfarging og misdannelse av blader, samt død av infiserte frøplanter er alle typiske tegn på RYMV-infeksjon.
Unge frøplanter (3- til 4-blads vekststadium) er de mest følsomme - eldre planter har generelt mindre åpenbare bladsymptomer og mindre stunt enn yngre planter. Symptomer ser opprinnelig ut som lineære gulgrønne flekker ved foten av de yngre bladene. Etter hvert som infeksjonen utvikler seg, strekker flekkene seg parallelt med bladårene og ser ut som gule eller oransje striper; disse kan variere i bredde, men kan være kontinuerlige opptil 10 cm.
Berørte planter har gule eller oransje blader i de tidlige stadiene av dyrking. I alvorlige tilfeller krøller bladene og tørker ut. Andre symptomer er stuntede planter, redusert tilering og dårlig fylling av panicle. Resultatet er liten eller ingen kornproduksjon og dårlig kornkvalitet.
RYMV-infeksjon kan ha bivirkninger i form av soppangrep av forskjellige sopparter: Cochliobolus miyabeanus ( risskader ), Monographella albescens ( bladskold ), Sarocladium oryzae ( slirråte ) og Pyrenochaeta oryzae (= Phoma leveillei , skjede flekker).
RYMV-viruset overføres av leddyr, nærmere bestemt av insekter av ordenen Coleoptera , hovedsakelig av familien Chrysomelidae . Disse inkluderer: Sesselia pusilla , Chaetocnema pulla , Trichispa serica og Dicladispa viridicyanea . Overføring skjer i en semi-vedvarende modus. Viruset ikke replikere i vektoren organismen og går tapt ved den insekt-vektoren under hamskifte , og er ikke congenitally overført til avkommet av vektoren. Det krever ikke et hjelpervirus for vektoroverføring. Gresshopper av slekten Conocephalus (familie Tettigoniidae ) har vist seg å være en mulig vektor for RYMV i Uganda.
Det antas at viruset kan overføres av andre dyr, for eksempel rotter, ved bladkontakt under påvirkning av vinden og av abiotiske faktorer (for eksempel vanningsvann). Dette viruset overføres ikke av frø eller av nematoder .
I fravær av direkte behandling mot viruset, innebærer kontrollen av gul variegation i ris profylaktiske tiltak, insektmiddelbehandlinger mot insektvektorer og bruk av resistente varianter.
Motstandsdyktige og tolerante varianter er tilgjengelige
Ingen kjemisk bekjempelsesmetode for å stoppe spredningen av RYMV er tilgjengelig, men insektmidler kan brukes til å kontrollere virusvektorer i noen land og derved redusere hastigheten på virusinokulum. Passende kjemikalier varierer i henhold til lokale forskrifter. Imidlertid har bruken av insektmidler spesifikke ulemper i afrikansk sammenheng. Det er en kostbar, ikke-spesifikk metode (som derfor også kan eliminere gunstige insekter), og som utgjør en risiko for toksisitet for vann og for matavlinger assosiert med risplater.
Disse tiltakene gjelder hovedsakelig dyrkningsmetoder .
For å forhindre spredning av viruset anbefales såing i barnehager som ikke har blitt smittet tidligere eller direkte såing i marken. CABI anbefaler å plante avlinger så tidlig som mulig for å unngå toppperioden for insektvektorer av viruset. I tillegg kan tidspunktet for planting i forskjellige felt forhindre at viruset sprer seg til yngre avlinger.
Den luke vanlige barnehager og rismarker, rengjøring av diker og vanningskanaler og de omkringliggende rismarker, spesielt i lavsesongen, kan eliminere alternative verter av viruset. Å rydde busker rundt felt begrenser avlssider for insektvektorer og kan også forhindre spredning av RYMV. Under vedlikeholdsoperasjoner anbefales det å unngå å berøre sunne planter etter at hendene har kommet i kontakt med infiserte planter. Rengjøring av gårdsmaskiner etter hver bruk kan redusere virusets mekaniske spredning.
Den rensing av kulturene består i å identifisere så tidlig som mulig buntene viser symptomer på variegation, både i planteskoler og på ris felt, og for å ødelegge dem ved forbrenning.
Den vekselbruk , alternerende risavlinger og andre avlinger, er også anbefalt for å bryte infeksjon av virus og insekt vektorer.