Den ribosomale RNA ( rRNA ) er hovedkomponenten i ribosomet , hvor den avgir navn. Selv om det noen ganger er feil kalt ribosomalt RNA av anglisisme ( ribosomalt RNA på engelsk), er det franske navnet på dette molekylet ribosomalt RNA .
De forskjellige rRNAene er både ryggraden og hjertet i ribosomet , et ribonukleoproteinkompleks (sammensatt av proteiner og RNA ) som brukes til oversettelse av genetisk informasjon kodet på et messenger-RNA (mRNA). Dette kommer fra transkripsjonen av en del av genomet , hvorfra det syntetiserer proteiner i cellen . I tillegg til rRNA, består ribosomet av rundt 50 proteiner som kalles ribosomale proteiner .
Ribosomale RNA produseres selv fra gener kodet i DNA . De transkriberes i form av lengre forløpere som deretter spaltes for å gi de forskjellige rRNAene. I eukaryoter foregår denne modning / spaltingsprosessen i nucleolus . Fra ribosomer som ligger i cytosolen , brettes rRNA på seg selv og danner en kompakt tredimensjonal struktur . Denne strukturen beskytter rRNA, som er veldig stabile, i motsetning til messenger-RNA, som generelt har en kort levetid.
I eukaryoter transkriberer RNA polymerase I 5.8S, 18S og 28S RNA forløperen (45S forløper) som deretter modnes under forskjellige kjemiske modifikasjoner.
Det blir deretter spaltet av snoRNPs (lite nukleosomalt RiboNucleoProtein eller "Small nucleosomal ribonucleoprotein"), som er ribonukleoproteinkomplekser (komplekser dannet av ribonukleinsyre og proteiner).
Som de fleste RNA er kodet ribosomalt RNA av gener. Det er mange kopier i genomet (200) som ligger i nucleolus på 5 akrosentriske kromosomer . Genene som koder for RNA er ordnet i par, og som i prokaryoter, atskilt av ikke-transkriberte avstandsstykker, regioner av DNA som ikke koder.
Den 28S rRNA , rRNA 5.8S og 18S rRNA er syntetisert i nucleolus mens det 5S rRNA syntetiseres utenfor nucleolus i nukleoplasma , men likevel i kjernen .
Enheten S er Svedbergs symbol som tilsvarer en sedimenteringskonstant.
RNA til den lille underenheten er involvert i lesingen av messenger RNA. Det er han som sjekker at interaksjonen mellom kodonet i A-stedet for ribosomet og antikodonet til tRNA er riktig. RNA til den lille underenheten er derfor kontrolleren for troskapen til oversettelsen til protein av det genetiske budskapet.
Det store RNA av den store underenheten til ribosomet er involvert i dannelsen av peptidbindinger . Det er han som er den direkte katalysatoren for proteinbiosyntese . Det aktive sentrum av ribosomet, kalt peptidyltransferase , består utelukkende av ribosomalt RNA. Den krystallografiske strukturen til ribosomet viste at det ikke var noe protein innen 50 til 60 Å av dette aktive stedet. RRNA til den store underenheten er derfor et ribozym .
Bakterielle ribosomale RNA ( prokaryoter ) er målet for nesten halvparten av antibiotika som brukes i human eller veterinærbehandling. Disse antibiotika, hovedsakelig avledet av naturlige produkter, fungerer enten ved å blokkere oversettelse eller ved å få ribosomet til å gjøre feil.
Viktigste familier av antibiotika som virker på rRNA:
Ribosom liten subenhet RNA er et molekyl hvis sekvens er mye brukt i fylogenistudier ved hjelp av verktøy for bioinformatikk. Det finnes bevart i alle levende organismer. Ved å sammenligne gensekvensene til dette RNA i forskjellige arter, er det mulig å vurdere deres evolusjonære slektning. "Ribosomal databaseprosjekt" rdp.cme.msu.edu- databasen viser 16S eller 18S ribosomale RNA-sekvenser fra mer enn 270.000 levende arter. Disse dataene gjør det mulig å rekonstruere et fylogenetisk tre av arter.