Mycobacterium

Mycobacterium Kultur av Mycobacterium tuberculosis på Löwenstein Jensen medium Klassifisering

Regjere	Bakterie
Gren	Aktinobakterier
Klasse	Aktinobakterier
Rekkefølge	Actinomycetales
Underordre	Corynebacterineae
Familie	Mycobacteriaceae

Snill

Mycobacterium
Lehmann & Neumann 1896 emend. Gupta et al. 2018

Mycobacterium , den Mycobacterium er en slekt av bakterier av familien av Myco . De erganske lange og tynne aerobe basiller , asporulerte og kapslede.

Veggen deres har en spesiell struktur, rik på voks ( mykoliske syrer ) som gjør at de kan beholde fargestoffer til tross for den kombinerte virkningen av fortynnet syre og alkohol . Denne veggen gir dem stor motstand mot antiseptika, visse antibiotika og makrofager .

De kalles "syrefast basiller" eller AFB.

Denne særegenheten til veggen brukes til å markere dem under mikroskopisk undersøkelse av Ziehl-Neelsen-flekken .

Generasjonstiden deres er ekstremt lang (nær 20 timer ). Deres % GC er mellom 61 og 71%.

Taksonomi

Taksonomien til slekten Mycobacterium er basert på klassifiseringen av Runyon (1954) basert på vekstrate og pigmentering (4 grupper presentert i følgende tabell).

Men i praksis er det det tuberkuløse mycobacteria-komplekset Mycobacterium tuberculosis inkludert arter som bestemmer tuberkulose human ( M. tuberculosis ), biff ( M. bovis ) eller det som observeres mest i afrikansk sort ( M. africanum ).

Menneskelige patogene arter av tuberkulosegruppen

• Mycobacterium tuberculosis (BK = Koch's bacillus)
• Mycobacterium africanum
• Mycobacterium bovis
• BCG, Calmette og Guérin bacillus , ( M. bovis stamme modifisert av Calmette og Guérin for å oppnå en vaksinestamme)

Arter som er patogene for mennesker utenfor tuberkulosegruppen

• Mycobacterium leprae ( spedalskhetsmiddel )
• Mycobacterium ulcerans ( Buruli ulcer agent)
• Mycobacterium marinum (middel for granulom i akvarier )
• Mycobacterium abscessus

Ikke-patogen for mennesker

• Mycobacterium vaccae

Såkalte "atypiske" mykobakterier

Noen ganger er de patogene for mennesker, spesielt ved nedsatt immunforsvar ( kreft , AIDS )

Liste over arter

I følge NHSP

I 2018 RS Gupta et al. foreslo en større revisjon av Mycobacterium- slekten basert på molekylære fylogenetiske teknikker. Ved å analysere genomet til de 150 arter av Mycobacteria sekvensert på studietidspunktet, gjennom sammenligning av tre serier av proteiner konservert blant dem og på grunnlag av andre samsvarende data, viste dette teamet heterogeniteten til den tidligere unike slekten Mycobacterium . Et stort antall arter ble ekskludert og omklassifisert i fire nye slekter opprettet for anledningen: Mycolicibacter , Mycolicibacillus , Mycolicibacterium og Mycobacteroides .

Slekten Mycobacterium har blitt beholdt, men omkretsen har blitt betydelig redusert og er nå begrenset til følgende arter:

• Mycobacterium tuberculosis (Zopf 1883) Lehman & Neumann 1896: type art beskrivelse av slekten
  • Mycobacterium tuberculosis var. africanum  : omklassifisering av M. africanum Castets et al. 1969
  • Mycobacterium tuberculosis var. bovis  : omklassifisering av M. bovis Karlson & Lessel 1970
  • Mycobacterium tuberculosis var. caprae  : omklassifisering av M. caprae (Aranaz et al. 1999) Aranaz et al. 2003
  • Mycobacterium tuberculosis var. microti  : omklassifisering av M. microti Reed 1957
  • Mycobacterium tuberculosis var. pinnipedii  : reklassifisering av M. pinnipedii Cousins et al. 2003
• Mycobacterium alsense Tortoli et al. 2016
• Mycobacterium angelicum Pourahmad et al. 2015
• Mycobacterium arosiense Bang et al. 2008
• Mycobacterium asiaticum Weiszfeiler et al. 1971
• Mycobacterium avium Chester 1901
  • Mycobacterium avium subsp. avium (Chester 1901) Thorel et al. 1990: omklassifisering av M. avium
  • Mycobacterium avium subsp. paratuberkulose (Bergey et al. 1923) Thorel et al. 1990: omklassifisering av M. paratuberculosis
  • Mycobacterium avium subsp. silvaticum Thorel et al. 1990 subsp. Nov.
• Mycobacterium bohemicum Reischl et al. 1998
• Mycobacterium botniense Torkko et al. 2000
• Mycobacterium bourgelatii Guérin-Faublée et al. 2013
• Mycobacterium branderi Koukila-Kähkölä et al. 1995
• Mycobacterium celatum Butler et al. 1993
• Mycobacterium colombiense Murcia et al. 2006
• Mycobacterium conspicuum Springer et al. 1996
• Mycobacterium cookii Kazda et al. 1990
• Mycobacterium europaeum Tortoli et al. 2011
• Mycobacterium fragae Ramos et al. 2013
• Mycobacterium florentinum Tortoli et al. 2005
• Mycobacterium gastri Wayne 1966
• Mycobacterium genavense Böttger et al. 1993
• Mycobacterium gordonae Bojalil et al. 1962
• Mycobacterium haemophilum Sompolinsky et al. 1978
• Mycobacterium heckeshornense Roth et al. 2001
• Mycobacterium heidelbergense Haas et al. 1998
• Mycobacterium interjectum Springer et al. 1995
• Mycobacterium intermedium Meier et al. 1993
• Mycobacterium intracellulare korrigert. (Cuttino & McCabe 1949) Runyon 1965
  • Mycobacterium intracellulare subsp. intracellulare  : omklassifisering av M. intracellulare Cuttino & McCabe 1949
  • Mycobacterium intracellulare subsp. chimaera (Tortoli et al. 2004) Nouioui et al. 2018: omklassifisering av M. chimaera
• Mycobacterium kansasii Hauduroy 1955
• Mycobacterium kubicae Floyd et al. 2000
• Mycobacterium kyorinense Okazaki et al. 2009
• Mycobacterium lacus Turenne et al. 2002
• Mycobacterium lentiflavum Springer et al. 1996
• Mycobacterium leprae (Hansen 1880) Lehmann & Neumann 1896
• Mycobacterium lepraemurium Marchoux & Sorel 1912
• Mycobacterium malmoense Schröder & Juhlin 1977
• Mycobacterium mantenii van Ingen et al. 2009
• Mycobacterium marinum Aronson 1926
• Mycobacterium marseillense Ben Salah et al. 2009
• Mycobacterium montefiorense Levi et al. 2003
• Mycobacterium nebraskense Mohamed et al. 2004
• Mycobacterium noviomagense van Ingen et al. 2009
• Mycobacterium palustre Torkko et al. 2002
• Mycobacterium paraense Fusco da Costa et al. 2015
• Mycobacterium paraffinicum ( ex Davis et al. 1956) Toney et al. 2010
• Mycobacterium paragordonae Kim et al. 2014
• Mycobacterium parascrofulaceum Turenne et al. 2004
• Mycobacterium paraseoulense Lee et al. 2010
• Mycobacterium parmense Fanti et al. 2004
• Mycobacterium persicum Shahraki et al. 2017
• Mycobacterium pseudoshotsii Rhodes et al. 2005
• Mycobacterium riyadhense van Ingen et al. 2009
• Mycobacterium saskatchewanense Turenne et al. 2004
• Mycobacterium scrofulaceum Prissick & Masson 1956
• Mycobacterium seoulense Mun et al. 2007
• Mycobacterium sherrisii van Ingen et al. 2011
• Mycobacterium shimoidei ( ex Tsukamura et al. 1975) Tsukamura 1982
• Mycobacterium shinjukuense Saito et al. 2011
• Mycobacterium shottsii Rhodes et al. 2003
• Mycobacterium simiae Karassova et al. 1965
• Mycobacterium stomatepiae Pourahmad et al. 2008
• Mycobacterium szulgai Marks et al. 1972
• Mycobacterium timonense Ben Salah et al. 2009
• Mycobacterium triplex Floyd et al. 1997
• Mycobacterium ulcerans MacCallum et al. 1950
• Mycobacterium xenopi Schwabacher 1959

Merknader og referanser

1. Gupta RS et al. “Fylogenomics og Comparative Genomic Studies Robustly Support Division of the Genus Mycobacterium into an Emended Genus Mycobacterium and Four Novel Genera” Front Microbiol. 2108 feb; 9: 67. Fri tilgang.
2. https://lpsn.dsmz.de/genus/mycobacterium , tilgang 01/15/21
3. Riojas MA et al. "Fylogenomisk analyse av arten av Mycobacterium tuberculosis- komplekset viser at Mycobacterium africanum , Mycobacterium bovis , Mycobacterium caprae , Mycobacterium microti og Mycobacterium pinnipedii er senere heterotypiske synonymer for Mycobacterium tuberculosis  " Int J Syst Evol Microbiol. 2018 januar; 68 (1): 324-332.