| Ribotymidin | |
| Struktur av ribotymidin | |
| Identifikasjon | |
|---|---|
| IUPAC-navn | 1 - [( 2R , 3R , 4S , 5R ) -3,4-dihydroksy-5- (hydroksymetyl) oksolan-2-yl] -5-metylpyrimidin-2,4-dion |
| Synonymer |
5-metyluridin |
| N o CAS | |
| N o ECHA | 100.014.522 |
| N o EC | 215-973-9 |
| PubChem | 445408 |
| ChEBI | 30821 |
| SMIL |
CC1 = CN (C (= O) NC1 = O) [C @ H] 2 [C @ H) ([C @ H) ([C @ H] (O2) CO) O) O , |
| InChI |
InChI: InChI = 1 / C10H14N2O6 / c1-4-2-12 (10 (17) 11-8 (4) 16) 9-7 (15) 6 (14) 5 (3-13) 18-9 / h2.5-7.9.13-15H, 3H2.1H3, (H, 11,16,17) / t5-, 6-, 7-, 9- / m1 / s1 Std. InChI: InChI = 1S / C10H14N2O6 / c1-4-2-12 (10 (17) 11-8 (4) 16) 9-7 (15) 6 (14) 5 (3-13) 18-9 / h2,5-7,9,13-15H, 3H2,1H3, (H, 11,16,17) / t5-, 6-, 7-, 9- / m1 / s1 Std. InChIKey: DWRXFEITVBNRMK-JXOAFFINSA-N |
| Kjemiske egenskaper | |
| Brute formel |
C 10 H 14 N 2 O 6 [Isomerer] |
| Molarmasse | 258,228 ± 0,0112 g / mol C 46,51%, H 5,46%, N 10,85%, O 37,18%, |
| Enheter av SI og STP med mindre annet er oppgitt. | |
Den ribothymidine ( rT ) eller 5-metyluridin ( m 5 U ) er et ribonukleosid som består av rester av tymin og ribose kombinert med en glykosid-binding β N- 1 . Dens tilsvarende deoksyribonukleosid er tymidin .
Ribotymidin er et sjeldent ribonukleosid som hovedsakelig finnes i T-armen av RNA t . Det er ikke innlemmet direkte under transkripsjon av RNA-polymerase , i motsetning til hva som skjer for tymidin som er tilstede i DNA ; ved transkripsjon inkorporeres et uridin i forløperen RNA t , som deretter modifiseres av et spesifikt enzym, RNA t (uracil-5 -) - metyltransferase ( EC ).
Ribotymidin er spesielt innarbeidet i posisjon 54 av tRNAene og bidrar til stabilisering av den tredimensjonale strukturen til disse RNAene .