Cytokrom c

Cytokrom c
Illustrasjonsbilde av varen Cytochrome c
Strukturen av cytokrom c av en celle av den myocardium av hesten som viser heme koordinert med et kation av jern ( PDB  1HRC )
Hovedtrekkene
Godkjent navn Somatisk cytokrom c
Symbol CYCS
Synonymer CYC, THC4, HCS
Funksjon Cellular respirasjon
Homo sapiens
Locus 7 s 15.3
Molekylær vekt 11 749  Da
Antall rester 105  aminosyrer
Kom inn 54205
HUGO 19986
OMIM 123970
UniProt P99999
RefSeq ( mRNA ) NM_018947
RefSeq ( protein ) NP_061820.1
Sammen ENSG00000172115
FBD 1J3S , 2N9I , 2N9J , 3NWV , 3ZCF , 3ZOO

GENATLAS • Genetests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega

Koblinger tilgjengelig fra GeneCards og HUGO .

Den cytokrom c er en liten hemoprotein inneholder hundre rester av aminosyrer til en masse på omtrent 12  kDa . Det er meget oppløselig i vann, ved en hastighet på omtrent 100  g · L -1 under fysiologiske betingelser, som skiller den fra andre cytokromer , som er ganske lipo .

Roll i cellulær respirasjon

Cytokrom c er involvert i cellulær respirasjon på nivået av luftveiskjeden , der den bærer ett elektron per molekyl. For å gjøre dette er det assosiert med den indre mitokondrie membranen og sikrer overføring av elektroner mellom koenzym Q - cytokrom c reduktase ( kompleks III ) og cytokrom c oksidase ( kompleks IV ). Hos mennesker er det kodet av CYCS- genet på kromosom 7 .

Det kan også katalysere flere reaksjoner, så som hydroksyleringer og aromatisk oksidasjon , og utviser også peroksidaseaktivitet gjennom oksydasjon av forskjellige elektrondonorer som ABTS , 2-keto-4-tiometylsmørsyre og 4-aminoantipyrin. Det er også involvert i minst en form for nitrittreduktase .

Roll i cellesyklusen

En reaktiv nitrogenart , peroksynitrit, kan reagere direkte med proteiner som inneholder overgangsmetallsentre . Ved å oksidere jernholdig heme til dets tilsvarende jernformer, kan det således påvirke cytokrom c (så vel som essensielle proteiner som hemoglobin eller myoglobin ).

Cytokrom c kan ta aktiv del i apoptose . Aktivering av mitokondriell apoptotisk vei fører til at megaporer vises slik at cytokrom c kan passere inn i cytosolen , der den binder seg til den aktiverende faktoren av apoptotiske proteaser (APAF1). Dette utløser en kaskade av reaksjoner som fører til aktivering av caspaser , proteolytiske enzymer som er direkte ansvarlige for fenomenet apoptose, og til dannelsen av apoptosomet .

Opprinnelse og evolusjon

Cytokrom c er et protein som er sterkt konservert på tvers av alle arter , og spesielt i eukaryoter , hvor forskjellene er begrenset til bare noen få rester. Alt cytokrom c som er undersøkt har et standardpotensial på 0,25  V , og det er for eksempel vist at cytokrom c oksidase mennesket reagerer med cytokrom c av hvete . Den sekvens av cytokrom c i mennesker er identisk med den for den sjimpanse , men forskjellig, for eksempel, fra den til hesten . Den svært brede utbredelsen i dyr , planter og mange unicellularer, i tillegg til dens lille størrelse (12  kDa ), gjør det til et valgverktøy for kladistiske studier som tar sikte på å bestemme fylogenetiske forhold mellom arter innenfor rammen av evolusjonens biologi .

Cytokrom c Beskrivelse av dette bildet, også kommentert nedenfor Struktur av et cytokrom c 2 av Blastochloris viridis  (en) ( PDB  1CRY ) Proteindomene
Pfam PF00034
InterPro IPR003088
LØNNHET PDOC00169
SCOP 1 gråte
OVERFAMILIE 1 gråte
OPM- familien 78
OPM protein 1 time
Cytokrom c ' Beskrivelse av dette bildet, også kommentert nedenfor Struktur av et cytokrom c 'd' Allochromatium vinosum  (en) ( PDB  1BBH ) Proteindomene
Pfam PF01322
InterPro IPR002321
LØNNHET PDOC00169
SCOP 1cgo
OVERFAMILIE 1cgo
Klasse III cytokrom c Beskrivelse av dette bildet, også kommentert nedenfor Desulfovibrio vulgaris (en) Hildenborough Cytochrome c HmcA ( FBB 1H29 )   Proteindomene
Pfam PF02085
Klan Pfam CL0317
InterPro IPR020942
SCOP 2cdv
OVERFAMILIE 2cdv
CDD cd08168

Se også

Relaterte artikler

Bibliografi

Merknader og referanser

  1. (in) Gordon W. Bushnell, Gordon V. Louie og Gary D. Brayer , "  High-resolution dried-dimensional structure of horse heart cytochrome c  " , Journal of Molecular Biology , vol.  214, n o  to 20. juli 1990, s.  585-595 ( PMID  2166170 , DOI  10.1016 / 0022-2836 (90) 90200-6 , les online )
  2. Verdiene for massen og antallet rester som er angitt her, er verdiene til proteinforløperen som er resultatet av translasjonen av genet , før posttranslasjonelle modifikasjoner , og kan avvike betydelig fra de tilsvarende verdiene for funksjonelt protein .
  3. (i) Marco Tafani Natalie O. Karpinich, Kathryn A. Hurster John G. Pastorino Timothy Schneider, A. Matteo Russo og John L. Farber , "  Cytokrom c Slipp på Fas Reseptoraktivering Avhenger Translokasjon av full-lengde Bud og Induksjon av Mitochondrial Permeability Transition  ” , Journal of Biological Chemistry , vol.  277, n o  12 22. mars 2002, s.  10073-10082 ( PMID  11790791 , DOI  10.1074 / jbc.M111350200 , les online )
  4. (i) Jörg Simon og Peter H. Kroneck , "  The Production of Ammonia by Multiheme Cytochromes c  " , Metal Ions in Life Sciences , Vol.  14, 3. mars 2014, s.  211-236 ( PMID  25416396 , DOI  10.1007 / 978-94-017-9269-1_9 , les online )
  5. Pacher P, Beckman JS, Liaudet L “  nitrogenoksid og peroxynitrite på helse og sykdom  ”, Physiol. Rev. , vol.  87, n o  1,januar 2007, s.  315–424 ( PMID  17237348 , PMCID  2248324 , DOI  10.1152 / physrev.00029.2006 )
  6. (i) Xuesong Liu, Caryn Naekyung Kim, Jie Yang Xiaodong Wang og Ronald Jemmerson , "  Induksjon av apoptotisk Program i celle-frie Ekstrakter: Krav til dATP og cytokrom c  " , Cell , vol.  86, n o  1, 12. juli 1996, s.  147-157 ( PMID  8689682 , DOI  10.1016 / S0092-8674 (00) 80085-9 , les online )
  7. (i) Indiana University i Bloomington , "  Cytochrome C Comparison Lab  " [PDF] (åpnet 20. desember 2015 ) .
  8. (i) E. Margoliash , "  Primary Structure and Evolution of Cytochrome C  " , Proceedings of the National Academy of Sciences i De forente stater , vol.  50, n o  4, Oktober 1963, s.  672-679 ( PMID  14077496 , PMCID  221244 , DOI  10.1073 / pnas.50.4.672 , JSTOR  72215 , Bibcode  1963PNAS ... 50..672M , les online )
  9. (in) K. Miki, S. Sogabe, A. Uno, T. Ezoe N. Kasai, Mr. Saeda, Y. Matsuura and Miki , "  Application of molecular-year automatic replacement procedure to crystal structure analysis of cytochrome c2 from Rhodopseudomonas viridis  ” , Acta Crystallographica Seksjon D - Strukturell biologi , vol.  50, Mai 1994, s.  271-275 ( PMID  15299438 , DOI  10.1107 / S0907444993013952 , les online )