Etidiumbromid | |||
Identifikasjon | |||
---|---|---|---|
IUPAC-navn |
3,8-Diamino-1-etyl-6-fenylfenantridiniumbromid 3,8-Diamino-5-etyl-6-fenylfenantridiniumbromid |
||
N o CAS | |||
N o ECHA | 100.013.622 | ||
N o EC | 214-984-6 | ||
ATC-kode | " QP51AX06 " | ||
Utseende | solid: rødbrun i oppløsning: mørkerød til oransje avhengig av konsentrasjonen |
||
Kjemiske egenskaper | |||
Brute formel |
C 21 H 20 Br N 3 [Isomerer] |
||
Molarmasse | 394,308 ± 0,02 g / mol C 63,97%, H 5,11%, Br 20,26%, N 10,66%, |
||
Fysiske egenskaper | |||
T ° fusjon | 511-513 K ( 238 til 240 ° C ) | ||
Løselighet | ved 20 ° C : 50 g · L -1 av vann, 1,3 g · L -1 kloroform | ||
Forholdsregler | |||
SGH | |||
![]() ![]() Fare H302, H330, H341, H302 : Farlig ved svelging H330 : Dødelig ved innånding H341 : Mistenkes for å forårsake genetiske defekter (angi eksponeringsvei hvis det er endelig bevist at ingen annen eksponeringsvei gir samme fare) |
|||
Direktiv 67/548 / EØF | |||
![]() T + Symboler : T + : Meget giftig R-setninger : R22 : Farlig ved svelging. R26 : Meget giftig ved innånding. R68 : Mulighet for irreversible effekter. R36 / 37/38 : Irriterer øynene, luftveiene og huden. S-setninger : S26 : I tilfelle kontakt med øynene, skyll umiddelbart med mye vann og kontakt lege. S28 : Vask umiddelbart og rikelig med ... (egnede produkter skal angis av produsenten) etter hudkontakt. S45 : I tilfelle en ulykke eller hvis du føler deg uvel, kontakt lege umiddelbart (vis etiketten der det er mulig). S36 / 37 : Bruk egnede verneklær og hansker. R-setninger : 22, 26, 36/37/38, 68, S-setninger : 26, 28, 36/37, 45, |
|||
Transportere | |||
66 : meget giftig stoff UN : 2811 : toksisk organisk fast, nos Klasse: 6,1 Label: 6,1 : Giftige stoffer emballasje: Emballasje gruppe I : meget farlige stoffer; ![]() |
|||
Enheter av SI og STP med mindre annet er oppgitt. | |||
Den ethidiumbromid (synonym: homidium , mindre vanlig Novidium , babidium eller R & D 1572 ), forkortet til BET , BET eller EtBr , er en organisk forbindelse aromatisk som har en kvaternær ammoniumforbindelse med kjemisk formel C 21 H 20 brn 3 . Det er et giftig og mutagent produkt som brukes som et medikament og en molekylær markør.
Skjematisk består molekylet av kjernen fenantridin substituert på hver side av to funksjoner amin , N- etylert og med fenyl på atomet av karbon 6.
Ethidium ble utviklet på 1950-tallet som et middel for å bekjempe infeksjoner av storfe på grunn av trypanosomer (ansvarlig for søvnmangel ) i Afrika , og brukes fortsatt i dag i denne indikasjonen. En dose på 1 mg · kg -1 brukes til å behandle infiserte dyr.
Denne dosen har også en profylaktisk effekt for å forhindre infeksjon i tre måneder.
Allerede i 1965 ble effekten av etidiumbromid for DNA- merking brakt frem. Den ble først brukt i 1973 av Sharp et al. For å oppdage DNA-fragmenter etter elektroforese .
Etidiumbromid er et salt som brukes mot parasittene Trypanosoma congolense og Trypanosoma vivax , midler til søvnløshet som hovedsakelig smitter storfe; imidlertid er etidiumklorid, mer løselig enn bromidet ( 200 g - L- 1 mot 50 g - L- 1 ), foretrukket siden det tillater fremstilling av mer konsentrerte oppløsninger og derfor gir de samme doser med reduserte volum.
Etidiumbromid er et interkalerende middel som ofte brukes som en nukleinsyremarkør i molekylærbiologilaboratorier .
Når den utsettes for ultrafiolett stråling , fluorescerer den med en rødoransje farge, 20 ganger mer intens når den er bundet til DNA . Denne effekten vil være på grunn av økningen i hydrofobiciteten i miljøet, snarere enn en avstivning av benzenringen , hvor sistnevnte ikke er lokalisert mellom baseparene .
Den vanligste bruken er farging av geler beregnet på separasjon av DNA-fragmenter ved elektroforese . BEt kan blandes med agarosen under gelpreparasjon, eller gelen kan senkes i en BEt-løsning (vanligvis i 20-30 minutter) etter at migrasjonen er fullført. I begge tilfeller er den endelige BEt-konsentrasjonen rundt 0,5 μg · ml -1 (konsentrasjonen av stamløsningen er vanligvis 10 mg · ml -1 ). Når det gjelder polyakrylamidgelelektroforese , kan fargingen bare gjøres etter migrering, idet BEt hemmer polymeriseringen av akrylamid .
Etidiumbromid gjør det også mulig å flekke RNA ved å sette seg inn i basene i korte komplementære regioner. Men siden de fleste RNA ikke er dobbeltstrengede, er fargingen av RNA markert mindre intens ved like masser enn DNA.
Etidiumbromid, som har evnen til å binde seg til DNA, har en sterk mutagen effekt og kan også være kreftfremkallende og teratogen . Imidlertid har ingen studier vist kreftfremkallende effekt.
I Frankrike, de nasjonale forsknings and Safety Institute tilbyr propidiumjodid- som en erstatning.
Etidiumbromid er et farlig kjemikalie som må håndteres med forsiktighet.
Rester som inneholder den, må kastes som farlig avfall .
Se også: "filtreringskolonne" i kolonneartikkelen om molekylærbiologi .
Indikasjonene på etikettene anbefaler bruk av BEt å bruke vinyl- eller nitrilhansker . Faktisk er latexen porøs mot BEt som passerer gjennom den på mindre enn 5 minutter.