Akonitase

Akonitase
Illustrasjonsbilde av artikkelen Aconitase
Struktur av en storfe akonitase ( PDB  1AMI )
Hovedtrekkene
Godkjent navn Akonitase 1
Symbol ACO1
EF nr. 4.2.1.3
Homo sapiens
Locus 9 s 21.1
Molekylær vekt 98.399  Da
Antall rester 889  aminosyrer
Koblinger tilgjengelig fra GeneCards og HUGO .
Kom inn 48
HUGO 117
OMIM 100880
UniProt P21399
RefSeq ( mRNA ) NM_001278352.1 , NM_002197.2
RefSeq ( protein ) NP_001265281.1 , NP_002188.1
Sammen ENSG00000122729
FBD 2B3X , 2B3Y

GENATLAS • Genetests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega

Mitokondrie akonitase
Hovedtrekkene
Godkjent navn Aconitase 2
Symbol ACO2
EF nr. 4.2.1.3
Homo sapiens
Locus 22 q 13.2
Molekylær vekt 85 425  Da
Antall rester 780  aminosyrer
Koblinger tilgjengelig fra GeneCards og HUGO .
Kom inn 50
HUGO 118
OMIM 100850
UniProt Q99798
RefSeq ( mRNA ) NM_001098.2
RefSeq ( protein ) NP_001089.1
Sammen ENSG00000100412

GENATLAS • Genetests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega

Aconitate hydratase Nøkkeldata
EF nr. EF 4.2.1.3
CAS-nummer 9024-25-3
Kofaktor (er) Fe-S
Enzymaktivitet
IUBMB IUBMB-oppføring
IntEnz IntEnz-visning
BRENDA BRENDA inngang
KEGG KEGG-inngang
MetaCyc Metabolisk vei
PRIAM Profil
FBD Strukturer
GÅ AmiGO / EGO

Den aconitase (eller aconitat hydratase eller COA ) er en lyase som katalyserer den reaksjon  :

Citrat.svg        H 2 O + Cis-Aconitat.svg        Isocitrat.svg
Sitrat   cis -Aconitate   Isocitrate

Dette enzym griper i Krebs syklus for å utføre isomeriseringen stereo av citrat i isocitrat via den cis -aconitate . Isomeriseringsreaksjonen involverer dehydrering etterfulgt av rehydrering for å oversette oksygenatomet i hydroksylen på hver side av en forbigående dobbeltbinding .

I motsetning til de fleste jern-svovelproteiner , som fungerer som elektrontransportører , reagerer jern-svovelsenteret i aconitase direkte med enzymets substrat.

Struktur

Aconitase familie Beskrivelse av dette bildet, også kommentert nedenfor Struktur av en storfe akonitase ( PDB  1ACO ) Proteindomene
Pfam PF00330
InterPro IPR001030
LØNNHET PDOC00423
SCOP 1aco
OVERFAMILIE 1aco

Aconitase har to litt forskjellige konfigurasjoner, avhengig av om den er aktivert eller inaktivert.

Den inaktive formen inneholder fire domener . Bare de tre første feltene fra slutten N- terminal interagerer tett med sentrum [3 Fe-4S] , men det aktive stedet involverer rester av de fire områdene, inkludert det store C- terminalen . Fe-S-senteret og et SO 4 2– anion er også plassert i det aktive nettstedet.

Når enzymet aktiveres, skaffer det seg et ekstra jernatom for å danne et [4Fe-4S] senter, mens strukturen til resten av enzymet forblir nesten uendret, med en oversettelse av de andre atomer som ikke overstiger 10  µm .

Regulering

Aconitase har et aktivt senter [Fe 4 S 4] 2+ som kan konvertere til en inaktiv form [Fe 3 S 4] + . Tre rester av cystein ble identifisert som ligander sentrum av [Fe 4 S 4]. I den aktive form av denne klyngen, er kationet av jernet er labil koordineres med vannmolekyler i stedet for cysteinrestene av enzymet.

Aconitase inhiberes ved fluoracetat anionet FCH 2 COO -, Foreliggende særlig natrium fluoracetat FCH 2 COONa, som derfor fungerer som en gift . Jern-svovelsenteret er veldig følsomt for oksidasjon av superoksydanioner O 2 -.

Alternative navn

Isoenzymer

Det er flere isoenzymer av akonitase:

Merknader og referanser

  1. (in) Hanspeter Lauble, Mr. Claire Kennedy, Helmut Beinert og C. David Stout , "  Crystal Structures of Aconitase with Trans -aconitate and Nitrocitrate Bound  " , Journal of Molecular Biology , vol.  237, n o  4, 7. april 1994, s.  437-451 ( PMID  8151704 , DOI  10.1006 / jmbi.1994.1246 , les online )
  2. Verdiene for massen og antall rester som er angitt her er verdiene til proteinforløperen som skyldes oversettelsen av genet , før posttranslasjonelle modifikasjoner , og kan avvike betydelig fra de tilsvarende verdiene for det funksjonelle proteinet .
  3. (in) H. Beinert, MC Kennedy, "  Aconitase, a two-faced protein: enzym and iron regulator factor  " , FASEB J. , Vol.  7, n o  15, Desember 1993, s.  1442-1449 ( PMID  8262329 )
  4. (in) DH Flint RM Allen, "  Iron-Sulphur Proteins with Nonredox Functions  " , Chem. Rev. , vol.  96, n o  7, November 1996, s.  2315-2334 ( PMID  11848829 , DOI  10.1021 / cr950041r )
  5. (i) H. Beinert, MC Kennedy, CD Stout, "  aconitasen som Iron-Svovel Protein, Enzyme og Iron Regulatory Protein  " , Chem. Rev. , vol.  96, n o  7, November 1996, s.  2335-2374 ( PMID  11848830 , DOI  10.1021 / cr950040z )
  6. (in) AH Robbins og CD Stout , "  The structure of aconitase  " , Proteins , Vol.  5, n o  4, 1989, s.  289-312 ( PMID  2798408 , DOI  10.1002 / prot.340050406 , les online )
  7. (en) AH Robbins og CD Stout , “  Struktur av aktivert aconitase: dannelse av [4Fe-4S] -klyngen i krystallet  ” , Proceedings of the National Academy of Sciences i De forente stater , vol.  86, n o  10, 1 st mai 1989, s.  3639-3643 ( PMID  2726740 , PMCID  287193 , DOI  10.1073 / pnas.86.10.3639 , les online )
  8. (in) H. Lauble, MC Kennedy, H. Beinert og CD Stout , "  Krystallstrukturer av aconitase og isocitrat med nitroisocitratbundet  " , Biochemistry , vol.  31, n o  10 17. mars 1992, s.  2735-2748 ( PMID  1547214 , DOI  10.1021 / bi00125a014 , les online )
  9. (i) RA Gardner, "  aconitase: sensitivt mål og mål på superoksid  " , Meth. Enzymol. , vol.  349, 2002, s.  9-23 ( PMID  11912933 , DOI  10.1016 / S0076-6879 (02) 49317-2 )
  10. (en) DB Mirel , K. Marder et al. , “  Karakterisering av det humane mitokondrie-aconitase-genet (ACO2)  ” , Gene , vol.  213, n bein  1-2,Juni 1998( ISSN  0378-1119 , DOI  10.1016 / S0378-1119 (98) 00188-7 )
  11. (en) MA Hooks , JW Allwood et al. , “  Selektiv induksjon og subcellulær distribusjon av ACONITASE 3 avslører viktigheten av cytosolisk sitratmetabolisme under lipidmobilisering i Arabidopsis  ” , Biochem. J. , vol.  463, n o  tooktober 2014, s.  309--317 ( PMID  25061985 , DOI  10.1042 / BJ20140430 )

Relaterte artikler