De akvatiske sopp (eller sopp amfibier ) som danner hydromycoflore , er en gruppe økologisk stedet for taksonomisk . Med svært sjeldne unntak er de mikroskopiske og encellede, og fremdeles relativt ukjente, selv om de er utbredt. Først oppdaget av biomolekylære studier på akvatiske mikroeukaryoter , har de blitt funnet til og med på havbunnen , i dype hydrotermiske systemer.
I økosystemer har marine og ferskvann en viktig økologisk rolle fordi de er de viktigste nedbrytningselementene treaktige og urteaktige takket være deres evne til å nedbryte lignocellulose og bidra til nedbrytning av døde dyr og animalsk avfall. De globale økosystemtjenestene de tilbyr er likevel fortsatt dårlig forstått.
Visse akvatiske mikro-sopp er viktige patogener for planter og dyr (inkludert til sjøs). Andre eller samme har utviklet symbiotiske forhold til andre marine eller ferskvannsorganismer.
De organismer som er i stand til å utføre hele sin syklus under vann ( ferskt , brakkvann eller marint vann , avhengig av art) eller inne i eller utenfor levende akvatiske organismer som de parasitter eller som de ofte opprettholde et nært symbiotisk forhold ( Mycophycobiosis ). Ji NY og Wang BG i 2016 snakker om “alguicolous” sopp (algicolous for engelsktalende) for å betegne soppene som utvikler en symbiose mens de lever i en alge.
De ble tidligere klassifisert som "underlegne planter" og / eller som "ufullkomne sopp" ( Fungi imperfecti ). De er " sopp " ( hovedsakelig hyphomycetes og ascomycetes ) med forskjellige fylogenetiske opprinnelser, og danner derfor ikke en enkelt og sammenhengende gruppe eller taxon . De er nå oppfunnet og studert av "hydromykologi" og til sjøs innenfor rammen av "marin mykologi". Hittil er deres funksjoner i økosystemer og økosystemtjenestene de tilbyr fortsatt dårlig forstått, bortsett fra noen få patogene eller nyttige arter som er bedre studert. De spiller en viktig rolle i økosystemer, i karbonkretsløpet så vel som i visse sykdommer.
Det er kanskje flere millioner mikroskopiske arter, samt noen få arter av vannlav ). Omvendt er det i " makromycetene " (tidligere også kjent som " høyere sopp ") bare to arter (sjeldne og ikke-relaterte) hittil blitt identifisert som delvis eller kanskje helt akvatiske :
Begge artene nedbryter nedsenket dødved eller kanskje andre kilder som er rike på cellulose eller lignin. De har sjelden blitt observert, og alltid i ferskvann . I tilbakegang i antropiserte sammenhenger kan de ha en bioindikativ verdi.
Den undersjøiske mikrosoppen er veldig diskret og nesten alltid usynlig for det blotte øye (fordi den ofte er mikroskopisk og ikke-pigmentert). Det bidrar effektivt til nedbrytning av nedsenket nekromass ( dødt tre , undervannssøppel av døde blader), lik , en del av det sedimenterte organiske materialet , så vel som avføring som er tilstede i vannet, på harde overflater eller på det nedsenket sedimentet eller vått.
Noen arter lever også på de fremkomne delene av døde myrplanter ( for eksempel siv ).
Det utgjør en betydelig del av “ mycobiodiversity ”, som i seg selv lenge har blitt ignorert og deretter undervurdert.
Det spiller dermed en hovedrolle i karbonsyklusen . De mest spektakulære "synlige" akvatiske mikro-soppene er Leptomitus, som florerer i visse farvann som er forurenset av organisk materiale . Imidlertid kan disse filamentøse soppene ikke skilles fra det blotte øye fra bakteriefilamenter som er dannet utelukkende fra Sphaerotilus (som florerer under samme forhold). I tillegg eksisterer ofte disse soppene og bakteriene i disse forurensede miljøene. I følge A Wurtz favoriserer avvisninger fra meierier sopp, muligens i rene stander i vannløpet , men også i mindre grad enn stivelsesfabrikker eller stivelsesfabrikker , mens papirfabrikker , sukkerfabrikker , destillerier og kloakker favoriserer sphaerotilus- bakterier .
I godt luftede vannveier er det akvatiske sopp ( hovedsakelig oomycetes og chytridiomycetes ) som bidrar mest til å nedbryte milliarder av døde blader som faller i vannet hvert år (men ikke i oksygenfattige sump der bakterier dominerer dem).
Microfonge er også en av kildene til nedbrytning av skipsskrog av tre og undervannsbeslag laget av tre. Den akvatiske mikrofampen inneholder et stort antall arter, ofte veldig iøynefallende og mikroskopisk. Det er fortsatt dårlig forstått.
De "underordnede" akvatiske artene, ofte filamentøse og tidligere klassifisert som phycomycetes , kan danne biofilmer eller i forurenset vann store myceliale flokker (som avhengig av tilfelle fremkaller dun, flak eller filamenter som ofte ser ut som fluff). 'A ". sauehale " eller " nedsenket lammehale " , som utvikler seg til en tykkelse som kan nå omtrent tjue cm eller mer. Ifølge Wurtz er disse trådformede akkumuleringene spesielt karakteristiske for Leptomitus hvis man er nedstrøms for et meieri. De er vanskelige å identifisere ved observasjon, fordi de under vann produserer svært få reproduktive organer (antheridia, oogonia, aseksuelt reproduserende sporer som er nødvendige for deres nøyaktige identifikasjon). velstående, renseanleggene som ble satt opp på 1980- til 2000-tallet, eliminerte de fleste av disse manifestasjonene, men de vedvarer i dårlig land eller land med dårlig miljølovgivning. Wu rtz indikerer at når strømmen er viktig (f.eks. mølleflåte, pennestam, dam, vinning) eller på bevegelige elementer (møllehjul), reduseres størrelsen på flakene og slepene ved å utvikle seg mot en tykk biofilm, mer eller mindre tykk, elastisk og som "pergament" . Leptomitus- flakene er faste, men strømmen kan løsne dem og vaske dem bort. Deretter stiger de opp til overflaten og bidrar til spredning av arten (de har noen ganger blitt forvekslet med flak av ostemelk eller rester av papirmasse som bæres av strømmen nedstrøms utslipp av industrielt avløp). Disse flytende flakene er hvite til gråsvarte, avhengig av oksygeninnholdet i vannet der de dannes og typen forurensninger eller rester de inneholder. eller bli svart med produktene fra sin egen gjæring når den sentrale delen av en flokk dør av å være fratatt oksygen.
Dette tallet er ukjent - til og med omtrent - til i dag, det samme gjelder alle sopporganismer som ble ansett for å være rundt 1,5 millioner i 1991 , men som ifølge nylige estimater basert på sekvensering med høy gjennomstrømning ville være nærmere 5,1 millioner arter .
Mens Wong i 1998 hadde litt mer enn 600 arter (inkludert 300 ascomycetes ) vitenskapelig beskrevet (unntatt lav og sopp periodisk nedsenket fra kysten), 8 år senere (i 2006 ), Shearer et al. nummerert rundt 3400 arter, selv om det ble anerkjent at et stort antall arter av akvatiske sopp ennå ikke kunne beskrives.
Og året etter (2007) Carol A. Shearer & al. hadde om lag 3000 sopparter og 138 arter av saprolegniae funnet i akvatiske habitater, de fleste av dem Ascomycetes . Samtidig estimerte Schmit at den laveste hypotesen er 8400 arter. Med funnene som ble gjort i 2010, ville det ta mer enn 1000 år å beskrive dem alle.
Mycologen Meredith Blackwell fra University of Louisiana mener at nye molekylære verktøy for inventar på biologisk mangfold kan øke hastigheten på oppdagelsen. I sammenheng med den biologiske mangfoldskrisen noen ganger referert til som " sjette utryddelse " og den utbredte bruken av soppdrepende midler, er det imidlertid sannsynlig at visse sjeldne og / eller sårbare arter nylig har forsvunnet eller er i en kritisk situasjon.
Akvatiske sopp er ofte mikroskopiske, dårlig pigmenterte eller gjennomsiktige og mer skjøre enn deres jordiske fettere. De virker mindre tilgjengelige, men kan enkelt samples in situ i miljøet (i åpent vann eller på forskjellige støtter) eller fra bærere / agn neddykket i miljøet til de blir kolonisert av sopp, deretter gjenopprettet og observert i laboratoriet.
De blir deretter identifisert (under et mikroskop i nesten alle tilfeller), suksessivt på grunnlag av morfologien, anatomien, sporuleringen eller på grunnlag av biokjemiske eller genetiske analyser). Tilnærminger som metabarkoding kan snart gjøre det mulig å legge til rette for varelager i åpent vann, i sediment eller i stor dybde.
Mens mange arter tydelig er tilpasset livet under vann, med forplantninger utstyrt med høyspesialiserte akvatiske spredningsevner, og som utfører all sin utvikling og reproduksjon under vann, er andre rett og slett amfibiske (bare et stadium av deres livssyklus finner sted under vann, eller dette stadiet er ikke obligatorisk). Noen lever ikke under vann, men sporene deres kan spres i vann og i luften. Sporene til mange terrestriske sopp kan bæres av saltsyre vann , noe som ikke gir disse artene vannmessig karakter .
Dermed er de fleste strandlinjesoppene som finnes på stubber eller drivved i virkeligheten semi-akvatiske (eller "aero-akvatiske" ). Noen av disse artene, spesielt funnet på bladene, stilkene eller jordstenglene til myrplanter, er klassifisert som vannlevende, men det oppdages etter hvert at de ofte er det " anamorfe stadiet " av forskjellige slekter av ascomycetes eller basidiomycetes som finnes under andre former i. det terrestriske miljøet.
Avgjørende faktorene for deres distribusjon begynner å bli bedre forstått: De er spesielt knyttet til hastigheten av organisk materiale og oksygen og til temperatur, men de er fremdeles gjenstand for studier.
hydromycoflora er vidt distribuert over hele verden og finnes rikelig på nesten alle dybder og høyder (hvis tilstrekkelig organisk materiale og oksygen er til stede). Noen arter trives opp til en temperatur nær 0 ° C, eller noen ekstremofile arter tolererer andre typer miljø ugjestmilde for andre arter.
De danner bare veldig store og tette populasjoner (noen ganger veldig tykke og nesten monospesifikke biofilmer) under veldig spesifikke forhold; nesten alltid knyttet til økologiske ubalanser forårsaket for eksempel av alvorlige industrielle, husholdnings- eller landbruksutslipp, eller i naturen ved tilstedeværelsen av et dykket dyrekropp.
På bakgrunn av dataene som er tilgjengelige på begynnelsen av 2000-tallet, er det soppdiversitet under vann maksimalt (for alle kjente grupper) i den tempererte sonen foran de asiatiske tropene, men dette fordelingsmønsteret kan være helt eller delvis bare på grunn av trykket lager som var sterkere i Europa og Nord-Amerika. Mange arter er ennå ikke blitt oppdaget i akvatiske habitater, hvorav mange ennå ikke er prøvetatt, spesielt i boreale regioner, Afrika, Australia, Kina, Sør-Amerika og mange regioner.
Suzuki (i 1960) anslår at fordelingen av akvatisk mycobiota er globalt ensartet i sirkulerende vann, men at den stratifiserer raskt i stillestående vann, spesielt om sommeren og vinteren.
I 1997 ble Lorez & al. viser at visse akvatiske sopp kan dyrkes under temperatur- og hydrostatisk trykk som tilsvarer de dype havbunnen, der de faktisk er funnet (inkludert patogene gjær for modioler (muslinger funnet rundt dype hydrotermiske ventilasjoner) En første samling sopp (filamentøs og gjærlignende) fra hydrotermiske økosystemer ble etablert på begynnelsen av 2000-tallet.
I vann synes imidlertid den spesifikke rikdommen til akvatiske sopp generelt å avta med dybde, sannsynligvis på grunn av temperaturfallet og oksygeninnholdet med dybden. Faktorer som påvirker lignende mykologiske mangfoldet i undergrunnen og bunnvann i innsjøer er undersøkt av Silicki (2008).
I sedimentet (overfladisk eller dypt)Studien av den mikrobielle soppen av dype marine sedimenter er nylig. Til dags dato har de blitt funnet opptil 1740 meter under havbunnen. De fysisk-kjemiske (trykk, temperatur, pH) og økologiske ( mer eller mindre viktig oligotrofi i dybden ...) ser ut til å strukturere disse mikrobielle samfunnene i dype marine sedimenter.
Nylig vitenskapelig arbeid, for eksempel av Vanessa Rédou (2011-2014) og M Navarri (2016), fokuserte på 183 sopparter, hvorav 80% ble isolert fra sedimentprøver tatt i "Canterbury-bassenget" ( New-Zeeland ) mellom 4 og 1 884 meter under havbunnen, etter et foreløpig stadium av berikelse av sedimentet under hydrostatisk trykk og etter et stadium av dereplikering. Sekvensering og fylogenetisk analyse viste i dette tilfellet en veldig sterk overvekt av Ascomycota (mer enn 89% av tilfellene). Slektene Penicillium og Fusarium (kjent på kontinentene for å være allestedsnærværende) dominerte kategorien filamentøse sopp og slekten Meyerozyma dominerte i gjærgruppen . Den stilksporesopper (11%) var hovedsakelig Gjær Rhodotorula . Disse taxaene er ikke nye for vitenskapen, allerede kjent i terrestriske økosystemer, men her ser de ut til å ha utviklet tilpasninger til de ekstreme forholdene i den dype biosfæren. Potensialet for syntese av sekundære metabolitter er av bioteknologisk interesse. Disse stammene ble "screenet" ved å lete etter potensielt bioaktive metabolitter. Over 96% av samlingen hadde minst ett av målene. Bare åtte gjærstammer presenterte ikke noen av de ønskede gener.
Merkelig nok fremstår disse stammene som ikke-halofile ved 25 ° C. men jo mer temperaturen øker (og den øker med trykket i sedimentet), jo mer motstår de salt (de dypeste stammene alene er virkelig halofile); i Canterbury-bassenget, faller temperaturen fra 2 ° C ved vannsedimentgrensesnittet til 60-100 ° C på en dybde på nesten 2 km. Den gjennomsnittlige temperaturgradienten i havsedimenter er omtrent +25 ° C per km sediment.
Nesten overalt hvor biologisk nedbrytbart organisk materiale er tilstede under vann i form av nekromasse, avføring eller utskillelse (til og med levende organismer), har sopparter dukket opp. Sridhar fant dem så til stede i noen strømmer at han foreslo å klassifisere dem som " plankton " . Mikroskopiske arter har blitt funnet i porevannet ("hyporheic") i det underfluviale rommet i elver (der det eksisterer og er tilstrekkelig oksygenert).
Vi skiller ofte (fordi vi bor i forskjellige arter):
Noen arter trives veldig godt ned til rundt 0 ° C hvor bakterievekst hemmes av kulde (kanskje delvis fordi kaldt vann er naturlig rikere på oksygen).
Noen akvatiske sopp i vann lever i dystrofisk og nesten anoksisk vann , men så nær overflaten eller i veldig flytende vann der noe luftbåren oksygen er permanent tilgjengelig (for eksempel i rennende vann rett nedstrøms visse utløp for by-, landbruks- og / eller industriavfall generelt).
Imidlertid har de såkalte "overlegne" amfibiske soppene et viktig behov for oksygen som neppe er kompatibelt med en lengre levetid under vann, på grunn av mangelen på et passende åndedrettsorgan (dette er aerobe arter som har blitt akvatiske). Psathyrella aquatica kan dra nytte av oksygenbobler som frigjøres av alger, planter eller fotosyntetiske svamper ( Spongilla lacustris ), disse boblene kan midlertidig fanges under hetten på soppen. <nr /> En akvatisk sopp trenger likevel alltid oksygen (uansett i vekstfasen). Disse organismer er derfor mer tilstede nær overflaten eller i rennende vann eller luftes av konstant turbulens. Alternativt kan de også finnes i nærheten av fotosyntetiske samfunn som er en direkte kilde til oppløst oksygen (eller oksygenbobler som kan samles under gjellene til Psathyrella aquatica , den eneste kjente bladesopp som er i stand til å gjøre noe. Dens vekstsyklus under vann.
Den akvatiske mycobiotaen er ikke kjent for å avhenge av lys. Hvis dens variasjon avtar med dybde, er det sannsynligvis som et resultat av redusert tilgjengelighet av oksygen fra atmosfæren og fotosyntese (spesielt om natten) og et fall i temperatur; to faktorer vurderte også å påvirke soppens biomasse, mer enn det mykologiske mangfoldet som virker likt i vannsøylen og på bentisk nivå, for eksempel i innsjøene studert av Silicki (2008). Suzuki (1960) fant en jevn fordeling av mycobiota når vann sirkulerer naturlig og deretter en lagdelt fordeling når vann stagnerer om sommeren og vinteren.
Mange studier søker å spesifisere de biotiske forholdene (trofeer, sesongvariasjoner og varige interaksjoner spesielt) og abiotiske (temperatur, pH, trykk, saltinnhold, gasser og mineraler oppløst i vann, tilstedeværelse av metaller, inkludert jern, etc.) av deres utvikling , spesielt i hodene til vannskillene (nær kildene), men også i innsjøene (For eksempel har polske studier forsøkt å forstå rollene og betydningen av akvatiske sopp i 2 innsjøer med forskjellige egenskaper). Mykologer har oppfunnet alle soppene og "fungiforme organismer" der, og har på to år (2005-2007) funnet totalt 54 arter (alle av mikroorganismetypen, som tilhører slektene Achlya , Anguillospora , Aphanomyces , Aplanes , Apodachlya , Composporium , Debaryomyces , Dictyuchus , Isoachlya Kluyveromyces , Leptolegnia , Metschnikowia , Pichia , Pythiogeton , Pythium , Saccharomyces , Saprolegnia , Thraustotheca , Zoophagus , slektene Achlya og Saprolegnia å være den mest tallrike når det gjelder arter) i vannsøylen og på bunnen ( bunnlevende arter ) inkludert 36 arter i Marta-innsjøer (fattigere i oksygen) og 45 i Sitno-innsjøen, med et større mangfold av arter der vannet er mer oksygenert og rik på forbindelser av biologisk opprinnelse i vann. Som i de fleste andre tilfeller var temperaturen og oksygenet i vannet her de faktorene som mest påvirker fordelingen av mycobiota i disse innsjøvannene. Artsmangfold og Shannon Biodiversity Index var høyest om sommeren. Terrestriske sopp er kjent for sin evne (forskjellig avhengig av art og stamme) til å absorbere, biokonsentrere og støtte visse giftige metaller, andre er imidlertid soppdrepende midler ( kobber ); i surt vann kan disse metallene imidlertid være mye mer biotilgjengelige.
De første sopplignende organismer i vann fossiliserte sannsynligvis dårlig.
Det antas at chytridene er en veldig gammel gruppe. De er det sannsynlige fylogenetiske grunnlaget for hele soppriket, det vil si sannsynlige forfedre til Zygomycota, deretter Ascomycota og Basidiomycota (sistnevnte er nesten utelukkende jordbasert).
Det er sannsynlig at mange arter som er veldig like hverandre etter en evolusjonær konvergens, likevel har veldig forskjellige opprinnelser.
for over hundre år siden, fra 1893 til 1895, beskrev de Wildeman 4 nye arter av mikroskopiske undersjøiske sopp funnet i dammer og små innsjøer, alle med konidier av en veldig uvanlig form. Men observasjonene hans vekker liten interesse og blir glemt i mer enn 50 år.
Konseptet med "akvatisk sopp" ble ikke foreslått før i 1942 av den engelske mykologen og botanikeren CT Ingold mens han studerte mikroskopiske sopp som nedbryter senkede blader av eld og pil (i en bekk ).
Det er 16 arter (tilhører 13 slekter), inkludert 10 nye for vitenskapen, og det er grunnen til at uttrykket "ingoldian sopp" noen ganger brukes til å beskrive dem.
I likhet med Wildeman før ham, finner Ingold at sporene til disse artene ofte har en uvanlig, kompleks form (forgrenet eller lang og buet, noen ganger vridd), noe han antyder kan tillate dem å feste seg bedre til bladene som spaltes i bekkesenger. Fra de tilgjengelige dataene i 1974 anslår han at "mindre enn 2% av artene (av sopp) er akvatiske" .
Ulike observatører som J. Duché i 1945 (EPCI-ingeniør, doktor i medisin, doktor i naturvitenskap) bemerker at siden vann har blitt studert under mikroskopet, har det blitt observert mange sporer eller mikroskopiske sopp der. Han foreslår å prøve å skille mellom:
Han bemerker at mucor thalli ofte dannes på kulturmedier som brukes til å analysere vann, men han vet ikke om de ville være i stand til å leve i vann eller på sediment i naturen; han anerkjenner at, bortsett fra parasittiske sopper av strengt vannlevende organismer, har vi ennå ikke "visse kriterier for å bekrefte at en sopp er akvatisk" . Det krever å fylle ut disse kunnskapshullene, fordi "den nøyaktige kunnskapen om den mykologiske floraen av elver, innsjøer og dammer, gjør det mulig å belyse en rekke problemer innen innsjø- eller fluvialbiologi" .
Siden da har det blitt gjort mange studier, og ifølge Bärlocher (1982), hovedsakelig på grunn av deres vannlevende liv, har ingolidiske sopp en spesiell økologi.
Artenes økologi varierer veldig avhengig av om de er mikroorganismer i suspensjon eller midlertidig fikserte sopp eller lamellasopp (en enkelt art kjent til dags dato), parasittiske eller ikke.
Alle chytrid-arter produserer bevegelige sporer (kalt " zoospores ") med et flagellum som er i stand til å svømme i vann eller i en væske med nær tetthet (de kalles uniflagellates); dette er et unikt faktum i sopptiden. men andre tilpasninger til vannmiljøet blir observert, mer eller mindre delt av visse grupper av arter, med noen ganger bemerkelsesverdige vanlige punkter, men sannsynligvis ofte som følge av en økologisk konvergens (se nedenfor).
Merk: De fleste sopp i vann ser ut til å bruke svært lite eller svært sjelden til seksuell reproduksjon . Og det faktum at de ikke kunne observere reproduktive organer () gjorde identifikasjonen deres under et mikroskop veldig vanskelig i lang tid.
Sporene til hydrofongen, sannsynligvis som pollen fra undervannsplanter eller andre typer akvatiske propagules (pteridophytes, bryozoans, bryophytes ...) måtte tilpasse seg vannmiljøet, med mulige evolusjonære konvergenser mellom disse organisasjonene.
For eksempel har de utviklet seg til å flyte eller bevege seg nær vannoverflaten, og er ofte todådige , to egenskaper " forutsagt " av modeller som fokuserer på å lette spredning i vann.
Logisk, hydrochory er (transport av propaguler som kan være zoosporer eller hel thalli) av strøm, spray eller avrenning) som anses å være den a priori den vanligste spredning strategi i akvatiske "fungi". Mange propagules blir faktisk observert i bekker , på mobile underlag, eller bare suspendert i rennende vann. Vannkraft i elver innebærer ensrettet transport fra oppstrøms til nedstrøms. Hvis dette var helt sant, ville oppstrømsenden av alle vassdrag derfor måtte være veldig dårlig i spesifikt og genetisk mangfold , eller til og med øde av akvatiske sopp og andre ikke-bevegelige organismer. Dette er imidlertid ikke tilfelle (så snart miljøet er rikt på organisk materiale i form av tre, blader eller til og med suspendert materiale ); det er derfor økologiske mekanismer som tillater en massiv " økning " av forplantninger fra nedstrøms til oppstrøms. Denne oppstigningen involverer sannsynligvis dyrepark (transport av forplantninger av dyr fra ett geografisk punkt til et annet). Denne transporten kan sikres ved fugler ( ornitokori ), trekkende fisk som vender tilbake til kildene ( ichthyochoria ) og / eller over kortere avstander av andre vannlevende dyr som beveger seg lineært i vassdraget ( Castor for eksempel) og / eller på bredden av den ( oter , amfibie) vole , muskrat , nutria , etc.
Soppesporer har blitt funnet i noen ganger veldig store mengder i mosen som dannes i visse bekker, strømmer og raske elver eller på fossenivået ). I India ser det ut til at visse arter som finnes i en ekvatoriell klimasone , bare reproduserer seg i kjøligere vann, i høyde, fordi sporene deres bare er funnet (i store mengder) i mosen av fjellstrømmene. I disse kule fjellstrømmene er det også funnet få arter av den tempererte typen. Dette antyder at disse tropiske artene i visse regioner kan være sårbare for global oppvarming, og at oppvarming av vann oppstrøms og i høyde kan føre til at visse saprofytiske sopp forsvinner langt nedstrøms vassdrag. I fuktige områder , hav eller flomsoner , på grunn av strømmer, bevegelse av vannmasser eller via dyrepark , er bevegelsene til propagules naturlig mer komplekse. Noen ganger kan de være massive, raske. De virker ofte veldig sesongmessige , for eksempel under en flom).
I sammenheng med den generelle antropiseringen av planeten, har de kunstige kanalene gravd mellom fjerne elver plassert vannskill som ikke var naturlig i direkte sammenheng , det samme for hav med Suez-kanalen og Panamakanalen som nå tillater direkte interoceaniske overføringer, inkludert potensielt patogene eller parasittiske sopper, spesielt fisk;
På samme måte viser historien til invasive arter at transport av propagules av kunstige gjenstander, passivt mobile koloniserte naturlige substrater, som reiser mellom to farvann eller flytende eller til og med via aktivt mobile gjenstander (båtskrog, skipsballast) også eksisterer. Og kan bidra til overføringer på lokale til transkontinentale skalaer.
Andre tilpasninger for spredning i eller på vannmiljøet finnes i ikke-bevegelige sporer av taxa Ascomycota og Deuteromycota . Disse sporene er flytende og / eller har ofte mye mer komplekse former (spesielt i marine arter) enn de fra terrestriske sopp. Disse sporene er innredet med vedheng, omgitt av konvolutter, mucilage og / eller veggpynt. Disse særegenheter har alle blitt tolket som tilpasninger til spredning og / eller tilknytning til bestemte underlag ifølge Jones (2006).
Biologer har blitt overrasket over å finne at konidier av noen arter produserer rikelig mucilage. Dette kan spille en viktig rolle i adhesjonen av konidiene til et glatt underlag eller utsatt for strømmen (Jf. Side 135, 137, 138, 140 til 149 og 215, i The Ecology of Aquatic Hyphomycetes. Denne slimhinnen kan også beskytte visse marine arter fra salt, eller i levende vann være et middel til å beskytte enzymer som utskilles av soppene mens de angriper målsubstratet, mens uten denne slimhinnen ville disse enzymene bli oppløst eller vasket bort av vannet som omgir strømmen.
Visse arter (noen ganger patogene som Sporothrix globosa ) finnes nesten over hele planeten, og deres relative genetiske homogenitet viser regelmessige og intense genetiske kontakter og utvekslinger mellom de forskjellige geografiske befolkningene i verden. Dette viser at disse artene har utviklet gode spredningsevner, men også tilpasning til forskjellige verter og habitater.
Akvatiske sopp er heterotrofe .
De fleste er saprofytter (nedbrytere, coprophiles eller lignivores og / eller er i stand til å nedbryte cellulose , kitin og keratin eller andre komplekse proteiner for enkelte arter).
Mange av dem, takket være proteaser (f.eks. Keratinase fra keratinofile og / eller keratinolytiske sopp , dvs. som bryter ned keratin) som de produserer, kan nedbryte kitin og keratin i skjell , skalaer og integrasjoner ( negler , klør , horn , hår ) og hud på vannlevende organismer (eller ikke), døde eller noen ganger i live (i sistnevnte tilfelle sies det at de er patogene , men infeksjonene er ofte " opportunistiske " (etter for eksempel skade eller utarmning av immunforsvaret).
Mange arter er opportunistiske eller noen ganger spesialistiske eller "obligatoriske" parasitter , og i noen tilfeller fremdeles dårlig forstått (som i slekten til Oomycota ; Pythiella ) eller de er hyperparasitter (det vil si at de parasiterer andre parasittiske sopp).
I ferskvann virker symbiotiske, mutualistiske og / eller kommensale assosiasjoner ( særlig leddyrens tarmflora ) eller i andre tilfeller parasitiske assosiasjoner. Disse assosiasjonene hjelper disse organismer med å få bedre tilgang til visse trofiske rom (spesielt suspendert organisk materiale eller inntatt organisk materiale, for eksempel for endofytiske arter eller de som er i stand til å kolonisere en del av fordøyelseskanalen til et dyr, som kan være menneske). Samspillet mellom sopp og sopp eller bakterie spiller en viktig, til og med kritisk rolle i prosessene med nedbrytning av organisk materiale under vann, og derfor i karbonsyklusen , men de har bare nylig blitt studert med en mer helhetlig tilnærming til dette. innenfor økosystemet og mikrobielle matnett . Disse interaksjonene er komplekse . De studeres spesielt i mer eller mindre ekstreme miljøer , som i gamle saltmyrer i det sørøstlige USA, hvor flere arter av ascomycetes , i forbindelse med et fellesskap av bakterier, nedbryter restene av den halofile planten Spartina. Alterniflora som dominerer disse miljøer. I denne sammenhengen ble det funnet at disse saprofytiske samfunnene varierer lite i verdensrommet eller med dekomponeringsstadiet, men veldig tidsmessig, avhengig av økologiske faktorer som fortsatt er dårlig forstått, og som ikke kan forklares med endringene. enkle forhold til miljøfaktorer. Når det gjelder overflod av disse spalterne, har det på den annen side blitt funnet negative eller positive sammenhenger mellom de dominerende sopptaksene og bakteriene, noe som antyder at det er økologiske interaksjoner mellom disse to typer spaltere.
De er veldig forskjellige, avhengig av arten som vurderes. Den thalli av chytrids danner ikke sant mycel og noen arter er encellede .
Avhengig av arten og tidspunktene de kan bli funnet på et underlag, inne eller utenfor en annen organisme som de okkuperer eller parasiterer (noen ganger i en annen sopp i tilfelle av arter hyperparasitter ) eller suspendert i vann.
Noen arter er kjent for å være dyr symbionter ; for eksempel er Neocallimastigales en del av mikrobiota (her aktiv i vommen ) av drøvtyggende planteetere der de bidrar til nedbrytning av cellulose . Det er sannsynlig at det også eksisterer mange forhold (symbiotisk eller ikke) med andre mikro-sopp, med andre mikroorganismer og med alger , bakterier , cyanophyceae og høyere planter (noen vannrøtter er kappe i en hylsefongbakteriell som kan fremkalle systemer bakteriologiske mycorrhysiens observert på jorden).
Noen er patogener fra små akvatiske dyr ( for eksempel rotiferer ), av encellede alger så små som kiselalger , eller av større organismer som vannplanter, virvelløse dyr i vann (krepsdyr for eksempel), fisk eller flere amfibier .
Sistnevnte forsvarer seg normalt fra det ved å utskille eller metabolisere soppdrepende eller beskyttende forbindelser (for eksempel produsert eller lagret i slim ).
Propagler av visse akvatiske arter finnes ofte i terrestriske miljøer, spesielt på fuktig skog og blader.
Noen av disse propagulene tåler frysing, relativt høye temperaturer og / eller en viss dehydrering, noe som gjør at de kan overleve mer eller mindre lang tid i terrestriske omgivelser.
Ved å eksperimentere med overføring av skiver av døde blader inokulert av 10 forskjellige arter av akvatiske sopp ( hyphomycetes ) til et skogkull av døde blader, for å teste deres evne til å overleve i "terrestriske vannregimer" , har biologer observert i 1978 at "fire av disse artene forsvant raskt, tre etter åtte måneder, en etter 11 måneder mens de to siste overlevde minst 12 måneder" .
En kanadisk studie evaluerte (i Nova Scotia ) overlevelsen i forhold til den laterale spredningen av forplantninger (vinkelrett på vassdragets akse) av akvatiske eller semi-akvatiske hyphomycetes. Forfatterne har virkelig funnet propaguler av disse soppene på bredden og på regelmessig oversvømte steder eller rundt dem, men mindre og mindre når man beveger seg bort fra bekken.
De er hovedsakelig nedbrytere av nedsenket nekromasse . De gir dermed et stort bidrag til resirkulering av organisk materiale. Andre roller tilskrives visse arter eller all sopp i vann:
Alle disse soppene, og deres sporer, fungerer også som mat for mange andre arter ( dyreplankton , bakterier og virvelløse dyr som spiser dem). Dermed har chytridene minst 5 identifiserte roller i dynamikken i næringskjeden:
Disse egenskapene inviterer oss til å forstå dem bedre, og å bedre plassere deres plass i økologiske prosesser, i akvatiske økosystemer. Molekylærbiologi burde litt etter litt gjøre det mulig å vurdere, kvantitativt og kvalitativt, økosystemtjenestene de bidrar til, og å vurdere deres biologiske mangfold i ulike typer miljøer.
I vann (som på land) til tross for sin beskjedne størrelse og nesten usynlighet, er de to viktigste gruppene av mikrobielle nedbrytere når det gjelder biologisk nedbrytning og trofisk strømning, bakterier og sopp.
De jobber sammen eller på en komplementær måte avhengig av miljøforholdene (temperatur, oksygenering og pH generelt).
Først kunne bare hyfomycetene lett identifiseres. Men de første omfattende studiene om nedbrytning av akvatiske mikro-sopp ble gjort på begynnelsen av 2000-tallet takket være fremskritt innen molekylærbiologi. De avdekket et uventet mangfold av taxa ( Ascomycota , Basidiomycota , Chytridiomycota , Zygomycota og Oomycota ).
Biologisk nedbrytning av ikke-lignifiserte blader og planterNår det gjelder bladsøppel og ikke-treaktige planterester (som legger seg raskt til bunnen av vannet, hovedsakelig om høsten i kalde og kontinentale klimaer eller nesten hele året i ekvatorialsonen), har vi på 1990-tallet til 2000 tydelig vist at døde blader avsatt i vannet blir ganske nedbrutt av sopp når vannet er godt oksygenert (torrenter, raske elver), og heller av bakterier i mer anoksiske forhold (dammer, myrer). I svømmende vann blir soppene ytterligere hjulpet av mekanisk nedbrytning av tre og blader.
I 1996 fant K Suberkropp og H Weyers ( University of Alabama ) at "bakterie- og soppproduksjon øker eksponentielt med økende temperatur" . I tillegg, i det rennende vannet som ble undersøkt av disse to forfatterne, var "soppkarbonproduksjonen på blader kolonisert i 21 dager 11 til 26 ganger større enn den bakterielle karbonproduksjonen", mens bakteriene på bunnen av en myr dominerer bredt gjennom året (10 til 18 ganger mer aktiv i et kystnært ferskvannsmyr som ble studert av N Buesing og M. O Gessner i 2006).
Sammenlignet med landjordiske kolleger har soppene som biologisk nedbryter døde blader i raske torrenter og elver utviklet tilpasninger som for eksempel gjør dem mindre synlige for rovdyrene (ofte gjennomsiktige konidier) eller lar propagulatene deres "finne" målet sitt bedre og at de holder seg bedre til det (Brown, forfatter av teorien om bruniansk bevegelse, hadde vært fascinert av det faktum at sporene og pollenkornene som var tilstede i vannet ikke beveget seg i et tilfeldig mønster.).
Andre tilpasninger tillater også at visse formeringsmidler effektivt "fester" seg (for eksempel til overflaten av en gren eller et dødt blad) til tross for sterk strøm.
Flere forfattere har nylig vist eller bekreftet at forskjellige typer blader er kolonisert av forskjellige sopparter, og at på noen blader (eikeblader for eksempel) ble et av ansiktene (undersiden) i dette tilfellet mye lettere kolonisert. Av conidia til stede i mediet. I tillegg må næringsstoffene og sporstoffene som er avgjørende for soppene, være tilstede i tilstrekkelig grad for at metabolismen til soppene skal være mest effektive; Vannkjemi er av stor betydning for sopp i vann, som ikke kan finne visse grunnstoffer i jord så lett som deres jordiske kolleger. På samme måte er oksygenivået som kanskje ikke er en avgjørende faktor for veksten av visse sopper, mens det forblir slik for sporuleringen. I sammenheng med eutrofiering og anoksi (fenomen av hypoksisk dødt vann ) får bakterier generelt overtaket.
Biologisk nedbrytning av dødvedDet indre av et nedsenket stykke dødved er oksygenfattig, spesielt hvis treet er tett. I vann gjør dette det mye vanskeligere for sopp å kolonisere enn om det samme dødvedet bare var fuktig og utsatt for luft.
I tillegg er området som er umiddelbart tilgjengelig for sopp, mye større på senkede døde blader enn på dødt tre.
Kvantitative data om den respektive nedbrytningen av blader og tre ved sopp har lenge manglet, men soppproduksjon kan nå vurderes (i henhold til en metode som ble utviklet for jordsopp) ved å måle d nivåer. Inkorporering av 14-karbon radiomerket acetat ( 14C-acetat) til ergosterol .
I 2008 fokuserte en studie på to bekker i de sørlige appalacherne (den ene tjener som referanse og den andre er beriket med næringsstoffer). Dette arbeidet, utført av Coastal Carolina University, vurderte delvis rollen som akvatiske sopp på en årlig syklus av dødvednedbrytning, og forsøkte dessuten å sammenligne nedbrytningseffektiviteten til små døde skoger (<40 mm i diameter, samlet tilfeldig) med den ved soppnedbrytning. av døde blader. Akkurat som mikrobiell respirasjon på tre (per gram detrital karbon), ble soppaktivitet vist å være mye mindre (i størrelsesorden) enn den som ble målt på bladene. Forfatterne fant videre at mikrobiell aktivitet (per gram karbon) var betydelig høyere i næringsberiket strøm. Imidlertid, som det årlige tre inn i vassdraget var i form av karbon-inngang i disse tilfellene to til tre ganger større enn det karbon-inngang på grunn av døde blader alene, andelen av input av organisk materiale oppnådd direkte fra trevirke av sopp er til syvende og sist sammenlignes i dette miljøet med det som er oppnådd fra døde blader (15,4% for tre og 11,3% for blader i referansestrømmen, og 20,0% for tre og 20,2% for blader i næringsberiket strøm. Forfatterne konkluderer med at til tross for en betydelig lavere gjennomsnittlig soppaktivitet (omtrent 5 ganger mindre per gram detrital karbon betraktet) på tre enn på blader, sopp kan derfor være like viktig for tre som de er for blader i resirkulering av karbon fra blader og dødved til bekker.
Disse artene ble tidligere klassifisert med planter , på grunnlag av morfologiske kriterier som Ingold selv raskt forsto at de stammer fra evolusjonær konvergens (spesielt sporene kan ifølge ham være 3 svar på det naturlige selektive trykket som er identisk utviklet av fylogenetisk fjernt arter:
De fleste arter har blitt forsømt av eksperimentell vitenskap til nesten alle slutter av XX - tallet.
I dag er det ingen spesifikk klassifisering for vannlevende sopp, fordi de tilgjengelige biomolekylære data viser at de ikke utgjør en taksonomisk gruppe i seg selv, men at denne "gruppen" har flere opprinnelse innenfor livets tre. ; noen av disse organismene er nærmere dyr og en annen del nærmere primitive planter.
I tillegg er den generelle taksonomien til sopp fortsatt underlagt endringer. Av praktiske og vitenskapelige grunner er disse taksene i dag gruppert i riket av sopp og underriket Dikarya (Hibbett et al. 2007), men deres morfologiske og genetiske variabilitet, samt likheten som eksisterer mellom mange arter. Innebærer lang arbeid med genetiske og biokjemiske studier for å stabilisere klassifiseringen.
Dette arbeidet blir startet over hele verden, for eksempel for Blastocladiales , Monoblepharidales , Saprolegniales , Leptomitales og Legenidiales , men mange arter (kanskje 50 til 75% av de som faktisk eksisterer i henhold til et estimat laget av Meredith Blackwell i 2011) har sannsynligvis ennå ikke blitt oppdaget, eller er fortsatt forvekslet med andre eller feilaktig identifisert.
Således tilhører noen arter, spesielt til gruppen Chytridiomycota (eller ' chytrider eller Chytridiomycetes ); en av de fire store divisjonene i soppriket) kan ha en vannmessig syklus. Chytrid-gruppen som samler mesteparten av disse akvatiske soppene er delt inn i fem ordrer.
I 1998 skilte Michelle KM Wong (University of Hong Kong) uformelt tre grupper:
Kanskje på grunn av ulik oksygentilgjengelighet, skiller sopper som er typiske for lentiske habitater, seg generelt fra de som lever i lotiske habitater. Noen av soppene som finnes nedstrøms i langsomt, varmt vann reproduserer bare oppstrøms i vann mer livlige og friske.
Sopparter under vann (spesielt unicellular) er en fortsatt dårlig utforsket del av naturarven , spesielt i tropiske områder, men ikke utelukkende.
Som eksempel:
Vi begynner å være i stand til å studere visse sjeldne arter bedre ved bedre å mestre deres ex situ kultur . og takket være nye metoder for genetisk og biokjemisk analyse.
Taksonomer observerer at noen arter overlapper mellom land- og ferskvannstaxa, men at dette fenomenet er sjeldent mellom ferskvann og marintaxa.
Ved midten av XX th århundre, i søkende, ble det funnet i, på alger , den tre og strenger i fjæra og under nivået for lavt vann i Aberystwyth og noen steder på kysten av Cardigan Bay ( Nord-Irland ) , i 1951 ble det observert tjue arter av Pyrenomycetes og ufullkomne sopper (17 allerede beskrevet og tre sannsynligvis nye arter; flere hadde aldri blitt sitert for Storbritannia ; Halophiobolus salinus , H. opacus , Ceriosporopsis halima , Peritrichospora integra , Remispora maritima , Amphisphaeria maritima , Helicoma maritimum , H. salinum , speira pelagica og Botryophialophora marina . .
Innen 2010 ble bare 537 arter av eksklusivt marine sopp beskrevet, men det faktiske antall taxa kunne ifølge EG Jones overstige 10 000, et tall som fortsatt er veldig lavt for planetarisk skala, sammenlignet med terrestrisk taxa. Det ble opprinnelig antatt at det var få marine arter ( spesielt Dikarya ) og hovedsakelig lokalisert nær kysten, men sekvensering med høy gjennomstrømning avslørte nye filotyper og ukjente linjer. Studien av miljø-DNA avslørte ikke veldig biologisk mangfold.
I 2019 , mens forskning forbereder nye veier og verktøy i feltet, er disse marine soppene fortsatt svært dårlig forstått. Vi vet at deres biomasse er viktig lokalt, taksonomien deres ikke er stabilisert, og noen mykologer som spesialiserer seg på dette feltet, ønsker å vite om de har de samme rollene til sjøs eller lignende roller som de har i terrestriske økosystemer. Eller ferskvann.
Det er funnet på rester av døde planter og andre flytende eller flertrådet organiske substrater, og i områder som er utsatt for å spraye ( strender , sanddyner , som lignicolous arter av drivved for eksempel, men også i form av sporer som lever inne sand (f.eks marin Ascomycetes and sopp imperfecti ) Mange arter har sannsynligvis ennå ikke blitt beskrevet eller studert, spesielt i tropene, og for endofytisk og kryptisk taksa
Noen er koprofile sopp og vokser på avføring av vannfugler eller avføring fra andre vanndyr. I innsjøer vokser noen mikroskopiske arter på likene av krepsdyr eller planktonorganismer. Kystnære marine arter kan ha avviket tidlig i livets tre.
Microfungi finnes også i saltvann, for eksempel to arter ( Monodktys pelagica (Johnson) Jones og Naïs inornata Kohlm) funnet på begynnelsen av 1970-tallet, for første gang ut av havet, i en innsjø i Wyoming rik på MgSO4 og Na2SO4-
vekst terrestriske eller akvatiske sopp, og til og med sjømenn, og reproduksjon (sporulering) påvirkes utover en viss saltholdighet (avhengig av art). Imidlertid er noen marine ascomycetes veldig tolerante mot saltholdighetsforhold (høy eller lav), mens deres fetters ferskvann Ascomycetes ikke tåler saltvann. Ufullkomne sopper virker ganske tolerante. De Hyphomycetes støtter ikke veldig bløtt vann (oligotrofe svakt mineralisert). I Chaetomium globosum har salt bare en effekt på bestemte tidspunkter i utviklingssyklusen.
Det er dårlig evaluert, og det varierer sannsynligvis etter art, i henhold til stammene og i henhold til immunarven og sårbarheten til arten som angripes av disse soppene. Som eksempel er slektene Saprolegnia , Aphanomyces og Achlya veldig smittsomme for krepsdyr , padder , bløtdyr og fisk . I oppdrettsanlegg legger visse sopper av denne familien seg på de døde eggene og forurenser derfra de levende eggene.
Det er fremdeles dårlig undersøkt, men - i likhet med deres jordiske fettere - viser de undersøkte marine soppene seg i stand til å absorbere og bioakkumulere visse tungmetaller eller metalliske sporstoffer .
Mens bladene av sivbed ( Phragmites australis ) har vist seg å brytes ned under vann, øker nivået av metalliske sporstoffer og tungmetaller (hentet fra vann) i råtnende organisk materiale i samme hastighet. Nivået av ergosterol (som indikerer kolonisering av dette nye substratet av akvatiske sopp), som også forstyrrer syklusen av metallforurensende stoffer i våte områder;
Dette gjelder det marine miljøet. Dermed absorberer to marine arter ( Corollospora lacera & Monodictys pelagica ) bly i høye doser uten toksisk effekt for dem, og bioakkumulerer kadmium , som imidlertid - i motsetning til bly - alvorlig hemmer deres vekst; spesielt for M. pelagica og da i dette tilfellet at ergosterolnivået synker når kadmiumkonsentrasjonen av soppen øker. Disse to metallene absorberes av myceliet som vokser på et substrat som inneholder dem (i bioassimilerbar form), spesielt ettersom metallinnholdet er høyt. Det så ut som myceliet av C. lacera avgifter blyet det absorberer ved å lagre det (for 93% av alt det absorberte blyet) i soppets ekstracellulære rom. M. pelagica ble vist å være i stand til å biokonsentrere mer enn 60 mg kadmium og mer enn 6 mg bly per gram mycelium, mens C. lacera bioakkumulerer mer enn 7 mg kadmium og opptil 250 mg bly. Per gram mycelium. I begge tilfeller kan de bioakkumulerte metallene forurense mykofagiske vannlevende organismer (akvatiske snegler, visse fisker som fôres ved å skrape biofilmen som er tilstede på forskjellige underlag) og deretter matveven.
De fleste arter av akvatiske sopp er mikroskopiske, gjennomsiktige og vanskelige å identifisere; og de har sannsynligvis ennå ikke blitt oppfunnet eller oppdaget. Tilstanden av befolkningen kan derfor bare grovt vurdert , og vi har ikke en nulltilstand tillater oss å vite om disse populasjonene har vært stabil eller i tilbakegang i et århundre eller mer.
Ulike typer soppdrepende midler er mye brukt over hele verden og distribueres i naturen. Noen av dem havner i innsjøer, elver og sjø (spesielt de som er mest oppløselige i vann, og de som fester seg til jordpartikler som kan bæres av vannet. Erosjon . Den økotoksiske mekanismen varierer hovedsakelig avhengig av på typen molekyler den inneholder og dosen. generelt er soppdrepende stoffer en direkte og voksende trussel mot "ikke-målarter" som ikke blir tatt riktig i betraktning av økotoksikologiske evalueringsstudier av disse biocidene, ettersom de i økende grad brukes rundt verden og ofte funnet i elver og våtmarker som et resultat av avrenning eller "aerial drift" d ' aerosol sprayet.
Virkningen av disse biocidene på sopp i vann kan, som for andre organismer, testes via individuelle tester in vitro og / eller i mikrokosmos ; de varierer ofte mye i henhold til dosen, men også i henhold til deres følsomhet eller utviklingsstadium, eller i henhold til om eksponeringen er kort eller kronisk av arten som vurderes.
Lite arbeid har blitt utført på soppgrupper i vann, men adaptive seleksjonsfenomener med fremveksten av patogene stammer som er resistente mot soppdrepende midler har allerede blitt observert i tilfelle antibiotikabehandling eller landbruksbruk av soppdrepende midler (for eksempel med mykoser (f.eks.: Aspergillioses eller Candidiasis ) antibiotikaresistent og annen antibiotikaresistens i human- eller veterinærmedisin eller med utseende av resistens mot soppdrepende midler som benzimidazoler og tiofanater i korn eller i tilfeller av behandling mot mugg i hvete og andre biocider generelt i andre mikroorganismer som er i stand til å reprodusere Omvendt kan noen effekter lett undervurderes: Dermed, selv om soppen ikke ser ut til å bli påvirket i vekst eller aktivitet, kan lave doser biocid hemme sporuleringen og / eller spiring av konidier. (dermed spiring av Campylospo conidia ra chaetocladia, Flabellospora verticillata, Flagellospora penicilliodes, Helicosporium sp., Lunulospora curvula og Wiesneriomyces javanicus er ikke i laboratoriet hemmet opptil 1 mg 1 (-1) for flere testede plantevernmidler, men utover denne konsentrasjonen, reduserte hastigheten på spiringsgraden av conidia med økende dose. Av grunner som fortsatt er dårlig forstått, ifølge Chandrashekar & al. (1994), “kan toleransene fra organismer til kjemikalier anses å være relatert til underlaget” . Over denne konsentrasjonen reduserte spiring av prosent konidier med økende konsentrasjon.
Til tross for en viss metodisk og teknisk fremgang for den økotoksikologiske vurderingen av soppdrepende midler, kunne effekterstudiene være ufullstendige, de toksiske effektene av soppdrepende midler og andre biocider på soppsamfunnet i vann kunne vært undervurdert. En nederlandsk studie (2011) søkte å vite om terskelverdiene som er godkjent eller anses akseptable for menneskers helse eller beskyttelse av primærprodusenter og forskjellige virveldyr (fisk, krepsdyr, pattedyr osv.) Også er i stand til å beskytte "ville akvatiske sopp". Og ikke-mål. På bakgrunn av økotoksisitetstester utført på et panel av forskjellige sopparter og oomycetes isolert og identifisert i forurenset overflatevann i Nederland (for syv soppdrepende midler med forskjellige virkningsmåter) har akutte økotoksiske effekter faktisk blitt observert, ved doser lavere enn hva forskriftene tillater 3 typer soppdrepende midler ( triazol , epoksikonazol og tebukonazol ). Imidlertid kan disse soppene i moderne landbruks- og antropiserte miljøer bli utsatt for "cocktailer" av mange soppdrepende midler og noen ganger "kronisk" , med en cocktaileffekt ( synergistisk ) og direkte eller indirekte og forsinkede effekter i rom og / eller tid.
Mange akvatiske sopp er sårbare for lave doser (5 til 10 mg / l) soppdrepende midler, for eksempel ofte brukte doser inkludert Bordeaux-blanding .
De er også følsomme for visse insektmidler som BHC ( benzenheksaklorid ), og naturlig for foulingmaling , anti- lichen- produkter som brukes til å rense tak eller bygninger eller til og med antifoolings som er spesielt brukt til å beskytte skipsskrog. (Sridhar og kaveriappa 1986).
Noen arter som trenger ferskt og oksygenert vann for å reprodusere, kan være sårbare for global oppvarming .
Lokalt og noen ganger over store områder, vannet avling (med soppdrepende midler) og drenering av våtmarker i jordbruket (som i Frankrike ble forverret på 1970-tallet av stor landkonsolidering og nye teknikker for drenering og vannevakuering), fylling eller tilstopping av dammer eller overutnyttelse av overflatevannressurser kan eller vil føre til nedgang i populasjonen av akvatiske sopp.
Disse artene spiller en viktig rolle i karbonsyklusen og i selvrensingen av vannforekomster.
De har et sterkt medisinsk potensial (de første antibiotika ble hentet fra sopp).
Industrielle spørsmål eksisterer også, så vel som når det gjelder biomimicry .
Disse artene har en bioindikatorverdi . Av spørsmål om miljøvurdering og helse eksisterer derfor også. For eksempel er noen veldig følsomme for oksygenivået, for soppdrepende midler eller for forsuring (i vannsøylen i "normale" eller " ekstremofile " omgivelser og temperatur, så vel som innholdet av vann. Organisk materiale i vann, tre parametere sterkt påvirket av mennesker i antropiserte områder (stadig større) og i sammenheng med klimaendringer og forsuring av vann (regn og andre vannmiljøer, inkludert via mine dreneringssyre ). i tillegg er noen arter patogene eller parasittiske (ansvarlig for sopp infeksjoner og sår fisk, skilpadder, krepsepesten , massiv amfibiedødelighet ...), og er derfor av interesse for 'landbruk, dyrehold, til og med menneskers
helse. Disse artene bør tas i betraktning når de måler den gode økologiske statusen til vann og bassenger, siden blant akvatiske sopp finner vi både bioindikatorer og noen arter. patogener og / eller sus sannsynlig å ha en veldig negativ innvirkning på biologisk mangfold (spesielt amfibier) i en situasjon med økologisk ubalanse. En annen utfordring er å finne strategier for biokontroll av disse soppene når de er patogener som er plagsomme for mennesker, avlinger, havbruk og andre former for oppdrett, dvs. biologisk bekjempelse innen medisinsk, veterinær og agroindustriell felt (beskyttelse av tre), samtidig som bruken av giftige og noen ganger ikke-biologisk nedbrytbare biocider begrenses , som i tilfelle antifoolings eller visse trebeskyttelsesprodukter.
Omvendt kan noen sopp brukes som et " biopesticid " mot visse skadedyr, eller mot visse sykdomsvektorer, og sørger for at de ikke risikerer å påvirke økosystemer eller bli invasive (hvis de brukes utenfor sammenheng. Naturlig biogeografisk).
Det var først i XX th århundre erkjennelsen av at vannlevende sopp hadde også seksuell reproduksjon, de også møte darwinistiske lover genetikk og valg som de terrestriske sopp, de er veldig forskjellige planter. Tre forskere Burgeff, Kniep og Lindegren hjalp til med å starte de mykologiske genetiske studiene. forskning i mykologi har funnet fornyet interesse med oppdagelsen av penicilin, så igjen med utvikling av bioteknologi og spesielt molekylærbiologi .
Som undervanns nedbrytere, kan noen av disse sopp (eller deres inngående kunnskap) kanskje tilveiebringe løsninger for å forbedre effektiviteten i avløpsanlegg, produksjon av agrodrivstoff eller biobrensel eller andre nyttige biobased produkter, særlig av organisk materiale og agrifood og industriell avfall i dag vanskelig å utnytte på grunn av for eksempel et høyt innhold av lignin eller cellulose. Det samme gjelder feltet filtrering, sanering eller biodeteksjon av visse dispergerte forurensninger, men som utgjør problemer ved lave doser.